| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,377,394 | C→T | 69.0% | A275A (GCG→GCA) | ycjW ← | LacI family putative transcriptional repressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,377,394 | 0 | C | T | 69.0% | 383.7 / 258.0 | 268 | A275A (GCG→GCA) | ycjW | LacI family putative transcriptional repressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/49); new base T (92/93); total (126/142) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
AATATTCTGTGGTGACGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGTTTCATGGGTAT > CP009273/1377250‑1377542 | atTCTGTGGTGACGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAActg > 1:828814/1‑150 (MQ=255) ttCTGTGGTGACGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAActgc > 1:1349188/1‑150 (MQ=255) ttCTGTGGTGACGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAActgc < 1:4502736/150‑1 (MQ=255) cTGTGGTGACGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAActgctg < 1:283041/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGACGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACtgctgc < 2:1824097/150‑1 (MQ=255) tgACGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAAt < 1:3324856/150‑1 (MQ=255) gACGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATa < 2:3714170/150‑1 (MQ=255) aCGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAg < 1:4266558/150‑1 (MQ=255) aCGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAg < 2:3426162/150‑1 (MQ=255) cGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGc > 2:3059706/1‑150 (MQ=255) ttttCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAat < 2:2521400/150‑1 (MQ=255) ttttCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAat < 1:3435222/150‑1 (MQ=255) ttttCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAat < 1:1648567/150‑1 (MQ=255) tCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATAtt < 2:902346/150‑1 (MQ=255) cAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATAtttt < 2:3822683/150‑1 (MQ=255) aGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATAttttt < 1:641726/150‑1 (MQ=255) gAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTtc < 1:1721902/150‑1 (MQ=255) gAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTtc > 1:2452702/1‑150 (MQ=255) gAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTtc > 1:24689/1‑150 (MQ=255) aaaTTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTtct < 2:557326/150‑1 (MQ=255) aaTTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTtctc > 2:3163476/1‑150 (MQ=255) aaTTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTtctc > 2:1215361/1‑150 (MQ=255) aaTTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTtctc > 2:2034293/1‑150 (MQ=255) aaTTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTtctc < 2:662623/150‑1 (MQ=255) aaTTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTtctc > 2:3857609/1‑150 (MQ=255) aTTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTctct < 1:3789083/150‑1 (MQ=255) aTTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTctct > 2:1641129/1‑150 (MQ=255) aGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTctgctg > 1:4379899/1‑150 (MQ=255) ggAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCg < 2:4655620/150‑1 (MQ=255) gAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGc > 2:2962124/1‑150 (MQ=255) aataatAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCa < 1:3543332/150‑1 (MQ=255) aataatAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCa < 1:2064564/150‑1 (MQ=255) ataaCTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGAt > 1:1161533/1‑150 (MQ=255) cTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAAt > 2:2566457/1‑150 (MQ=255) cTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAAt < 1:1708790/150‑1 (MQ=255) cTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAAt < 1:4164503/150‑1 (MQ=255) aGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCa > 2:4370456/1‑150 (MQ=255) cTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCAtt > 2:3262340/1‑150 (MQ=255) tttGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTa > 2:1490447/1‑150 (MQ=255) tttGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTa > 2:1490613/1‑150 (MQ=255) ttgttgACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTaa < 1:635835/150‑1 (MQ=255) ttgttgACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTaa > 2:4278439/1‑150 (MQ=255) ttgttgACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCAGGTGCTGTCGTTAATTTAAATGACAGAGTTTCATTGCTATAACCCACCTCTGCTAACTTCTGCGGAATAGATATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATTCTCATTaa < 2:3673154/150‑1 (MQ=255) ttgACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAAttt < 2:3323056/150‑1 (MQ=255) gACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCa > 2:2057174/1‑150 (MQ=255) tAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCt > 1:4672715/1‑150 (MQ=255) aaCTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTg > 2:1792519/1‑150 (MQ=255) aaCTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTg < 1:2865001/150‑1 (MQ=255) aaCTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTg > 2:642632/1‑150 (MQ=255) tCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCa > 2:2995990/1‑150 (MQ=255) tCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCa < 1:4331071/150‑1 (MQ=255) cTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGt > 1:1091168/1‑150 (MQ=255) ggAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAac > 2:3556026/1‑150 (MQ=255) ggAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAac > 1:3639333/1‑150 (MQ=255) ggAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAac < 1:2983248/150‑1 (MQ=255) gAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAaca > 2:4162659/1‑150 (MQ=255) gAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAaca > 2:1441310/1‑150 (MQ=255) aaCATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAacac > 2:2119614/1‑150 (MQ=255) aCATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACAcc < 1:2271461/150‑1 (MQ=255) gATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTc > 2:213657/1‑150 (MQ=255) aTGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCa < 2:1082181/150‑1 (MQ=255) cccGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAAc < 1:616234/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACg < 1:1641129/150‑1 (MQ=255) cGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACgg < 2:4766427/150‑1 (MQ=255) cGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACgg > 1:4762807/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGa > 2:2443563/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGa > 2:1235754/1‑150 (MQ=255) cAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACt < 2:1713848/150‑1 (MQ=255) aGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTg > 2:3624627/1‑150 (MQ=255) ggCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTgg < 2:2318939/150‑1 (MQ=255) ggCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTgg > 2:4475175/1‑150 (MQ=255) gCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGc < 1:3077924/150‑1 (MQ=255) cGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCt > 1:1959427/1‑150 (MQ=255) cGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCt > 1:4411454/1‑150 (MQ=255) gTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCtt > 1:3814606/1‑150 (MQ=255) aaaaTAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTtaat < 1:493514/150‑1 (MQ=255) aataaatGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTtaataa > 1:4340697/1‑150 (MQ=255) taaatGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAAtt > 2:454394/1‑150 (MQ=255) aatGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGc < 1:1425814/150‑1 (MQ=255) atGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGcc < 2:2938030/150‑1 (MQ=255) gACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGt > 2:4397051/1‑150 (MQ=255) gACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGt > 1:2668844/1‑150 (MQ=255) gTTTCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTgctgct < 2:1307823/150‑1 (MQ=255) tCATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCtttt < 1:3140235/150‑1 (MQ=255) cATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTa < 1:3504655/150‑1 (MQ=255) cATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTa > 2:668632/1‑150 (MQ=255) cATTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTa < 2:848295/150‑1 (MQ=255) aTTGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTaa < 2:3270430/150‑1 (MQ=255) ttGCTATAACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAAt < 2:962561/150‑1 (MQ=255) ataACCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGt > 2:193348/1‑150 (MQ=255) taACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGtt < 1:2816703/150‑1 (MQ=255) aaCCCACCACTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGttt < 1:3051739/150‑1 (MQ=255) aCCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGTTTc < 1:1019737/150‑1 (MQ=255) aCCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGTTTc < 1:1019022/150‑1 (MQ=255) ccaccaCTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGTTTCAt < 2:4078108/150‑1 (MQ=255) ccaccaCTGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGTTTCAt < 2:4789183/150‑1 (MQ=255) accactGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGTTTCATgg > 2:2690785/1‑150 (MQ=255) ccactGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGTTTCATggg < 1:956025/150‑1 (MQ=255) ccactGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGTTTCATggg < 1:4609399/150‑1 (MQ=255) cactGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGTTTCATGGGt < 1:3236914/150‑1 (MQ=255) | AATATTCTGTGGTGACGGTTTTCCAGAAATTAAGCGGAATAATAACTCGCAGCTTTGTTGACCTAACTCCTGCGTCGGAACATCGATGCCGCCCGGTGCAGGCGTTAAAATAAATGACAGCGTTTCATTGCTATAACCCACCACCGCTAACTGCTGCGGAATAGCAATATTTTTCTCTGCTGCCGCACGATAAATGCTCATTAATTTCAGGCTGTCAGTGGCAAACACCGCCTCAGGCAACGGTGACTGGCTTAATAATTGCCGTGCTGCTTTTAATGCAGTTTCATGGGTAT > CP009273/1377250‑1377542 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |