| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,401,206 | 0 | G | T | 18.7% | 635.2 / 104.4 | 219 | Q283K (CAG→AAG) | ydaM | diguanylate cyclase, csgD regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (80/97); new base T (21/20); total (102/117) | |||||||||||
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Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
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aGCAACAAGCTGTAATCCTGAGCGATGGCGAGATGCTGCATTTGGCCTGGTTCCGTAATGTGATAAAACTGTCGCCGATTCAGTAATCCGGTCATCGCGTCATGGTGAGCAGCATGTTCCAGCTGCTCCTCCAGCCGTTTTTGCTCAGTa > 1:4374996/1‑150 (MQ=255) aactaGCTGTAATCCTGAGCGATGGCGAGATGCTGCATTTGGCCTGGTTCCGTAATGTGATAAAACTGTCGCCGATTCAGTAATCCGGTCATCGCGTCATGGTGAGCAGCATGTTCCAGCTGCTCCTCCAGCCGTTTTTGCTCAGTAata < 1:4330547/150‑1 (MQ=255) aacaaGCTGTAATCCTGAGCGATGGCGAGATGCTGCATTTGGCCTGGTTCCGTAATGTGATAAAACTGTCGCCGATTCAGTAATCCGGTCATCGCGTCATGGTGAGCAGCATGTTCCAGCTGCTCCTCCAGCCGTTTTTGCTCAGTAata < 1:616321/150‑1 (MQ=255) aacaaGCTGTAATCCTGAGCGATGGCGAGATGCTGCATTTGGCCTGGTTCCGTAATGTGATAAAACTGTCGCCGATTCAGTAATCCGGTCATCGCGTCATGGTGAGCAGCATGTTCCAGCTGCTCCTCCAGCCGTGTTTGCGAAGTAata > 1:3393772/1‑150 (MQ=255) acaaGCTGTAATCCTGAGCGATGGCGAGATGCTGCATTTGGCCTGGTTCCGTAATGTGATAAAACTGTCGCCGATTCAGTAATCCGGTCATCGCGTCATGGTGAGCAGCATGTTCCAGCTGCTCCTCCAGCCGTTTTTGCTCAGTAatat < 2:3125934/150‑1 (MQ=255) aaGCTGTAATCCTGAGCGATGGCGAGATGCTGCATTTGGCCTGGTTCCGTAATGTGATAAAACTGTCGCCGATTCAGTAATCCGGTCATCGCGTCATGGTGAGCAGCATGTTCCAGCTGCTCCTCCAGCCGTGTTTTGTCAGTAATATCa > 1:3706115/1‑150 (MQ=255) aGCTGTAATCCTTAGCGATGGCGAGATGCTGCATTTGGCCTGGTTCCGTAATGTGATAAAACTGTCGCCGATTCAGTAATCCGGTCATCGCGTCATGGTGAGCAGCATGTTCCAGCTGCTCCTCCAGCCGTTTTTGCTCAGTAATATCAt > 1:2968997/1‑150 (MQ=255) gCTGTAATCCTGAGCGATGGCGAGATGCTGCATTTGGCCTGGTTCCGTAATGTGATAAAACTGTCGCCGATTCAGTAATCCGGTCATCGCGTCATGGTGAGCAGCATGTTCCAGCTGCTCCTCCAGCCGTTTTTTCTCAGTAATATCATg > 2:2933051/1‑150 (MQ=255) gCTGTAATCCTGAGCGATGGCGAGATGCTGCATTTGGCCTGGTTCCGTAATGTGATAAAACTGTCGCCGATTCAGTAATCCGGTCATCGCGTCATGGTGAGCAGCATGTTCCAGCTGCTCCTCCAGCCGTTTTTGCTCAGTAATATCATg < 2:2973869/150‑1 (MQ=255) gCTGTAATCCTGAGCGATGGCGAGATGCTGCATTTGGCCTGGTTCCGTAATGTGATAAAACTGTCGCCGATTCAGTAATCCGGTCATCGCGTCATGGTGAGCAGCATGTTCCAGCTGCTCCTCCAGCCGTTTTTGCTCAGTAATATCATg < 1:116676/150‑1 (MQ=255) aaTCCTGAGCGATGGCGAGATGCTGCATTTGGCCTGGTTCCGTAATGTGATAAAACTGTCGCCGATTCAGTAATCCGGTCATCGCGTCATGGTGAGCAGCATGTTCCAGCTGCTCCTCCAGCCGTTTTTGCTCAGTAATATCATTCACaa > 1:196569/1‑150 (MQ=255) aaTCCTGAGCGATGGCGAGATGCTGCATTTGGCCTGGTTCCGTAATGTGATAAAACTGTCGCCGATTCAGTAATCCGGTCATCGCGTCATGGTGAGCAGCATGTTCCAGCTGCTCCTCCAGCCGTGTTTTCTCAGTAATATAATGCACaa > 1:197699/1‑150 (MQ=255) | CCAACGAAACACCAAATCGCCTTTGCGAGCGCAACTTTCGAGGGTGCGGGCGAGGGCGCATAACACCTCATCACCTTTAGAATGCCCATAGAGATCGTTAATGTGTTTAAAACGATCGGTGTCGATGAGCAACAAGCTGTAATCCTGAGCGATGGCGAGATGCTGCATTTGGCCTGGTTCCGTAATGTGATAAAACTGTCGCCGATTCAGTAATCCGGTCATCGCGTCATGGTGAGCAGCATGTTCCAGCTGCTCCTCCAGCCGTTTTTGCTCAGTAATATCATGCACAAT > CP009273/1401060‑1401350 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |