| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 140,496 | A→T | 14.3% | H103L (CAC→CTC) | yadH → | inner membrane putative ABC superfamily transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 140,496 | 0 | A | T | 14.3% | 937.8 / 129.9 | 307 | H103L (CAC→CTC) | yadH | inner membrane putative ABC superfamily transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (139/124); new base T (23/21); total (162/145) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
GCATGGCTTCAGCTATATGCAGTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGGTGTTGT > CP009273/140347‑140645 | ggCTTCAGCTATATGCAGTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGGCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTc < 2:3966815/150‑1 (MQ=255) tCAGCTATATGCAGTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCatta < 2:2179683/150‑1 (MQ=255) aGCTATATGCAGTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCattatt < 2:239784/150‑1 (MQ=255) aGCTATATGCAGTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCattatt > 1:4618932/1‑150 (MQ=255) gCTATATGCAGTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTg < 2:1396591/150‑1 (MQ=255) cTATATGCAGTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGc > 1:425925/1‑150 (MQ=255) atGCAGTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGa > 1:1665181/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGata > 1:3282010/1‑150 (MQ=255) cAGTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGatat > 1:2830087/1‑150 (MQ=255) aGTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATg > 1:3348812/1‑150 (MQ=255) aGTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATg > 2:456598/1‑150 (MQ=255) gTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGt < 2:2103094/150‑1 (MQ=255) ttCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTc > 1:2787105/1‑150 (MQ=255) tCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTcg < 1:4338580/150‑1 (MQ=255) tCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTcggcg < 1:655547/150‑1 (MQ=255) cGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTcggcgg > 1:4467508/1‑150 (MQ=255) gTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGgt > 2:3411622/1‑150 (MQ=255) tACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGgtg < 2:1894676/150‑1 (MQ=255) ccGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGgtggc < 1:2008136/150‑1 (MQ=255) cGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGgtggcg > 1:464742/1‑150 (MQ=255) gCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGgtggcgtggc < 2:4275613/150‑1 (MQ=255) tGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGgcgc > 1:58724/1‑150 (MQ=255) gATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGcgcg < 2:3512576/150‑1 (MQ=255) tCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTg < 1:4037032/150‑1 (MQ=255) tCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTg > 2:1271992/1‑150 (MQ=255) tgTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCtgt > 1:3688181/1‑150 (MQ=255) tgTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCtgt > 1:778176/1‑150 (MQ=255) gTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCtgtt > 1:945851/1‑150 (MQ=255) tGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTttgttg < 1:4809597/150‑1 (MQ=255) aCCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCAtt > 1:1486770/1‑150 (MQ=255) aCCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCAtt > 1:184632/1‑150 (MQ=255) aCCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGGGGTCTGTTTGTTGGCagt > 2:4602570/1‑148 (MQ=255) cAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCt > 1:88179/1‑150 (MQ=255) aaTGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTg > 1:2442158/1‑150 (MQ=255) aaTGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTg < 2:2547707/150‑1 (MQ=255) aTGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTgg > 2:4211810/1‑150 (MQ=255) aTGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTgg > 2:1759184/1‑150 (MQ=255) tGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGt < 2:3833113/150‑1 (MQ=255) cTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGAc < 1:3058489/150‑1 (MQ=255) aCGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACgg > 1:2307155/1‑150 (MQ=255) ccAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCaa < 1:1018069/150‑1 (MQ=255) ccAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGGGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCaa > 2:1150181/1‑150 (MQ=255) cAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAAt < 1:2299240/150‑1 (MQ=255) aaCGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAAtt < 1:3950079/150‑1 (MQ=255) aaCGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAAtt < 2:1359110/150‑1 (MQ=255) aaCGTTGCGTCAACATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAAtt < 2:1492731/150‑1 (MQ=255) aCGTTGCGTCATCATTTTTAGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAAttt < 1:1288125/150‑1 (MQ=255) gTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCa > 1:2096032/1‑150 (MQ=255) gTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCa < 1:1524072/150‑1 (MQ=255) ttGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCAc < 1:2165592/150‑1 (MQ=255) ttGCGTCATCATTTTTGGGTGCCAAGGTCCAGCGTAATATGGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTAGTGCCGGATAGGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCAc < 1:1933383/150‑1 (MQ=255) tGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACt < 1:2207058/150‑1 (MQ=255) tcatcaTTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGttt > 2:529262/1‑150 (MQ=255) atcatTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGttttt < 2:3618853/150‑1 (MQ=255) atcatTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGttttt < 2:1830854/150‑1 (MQ=255) atcatTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGttttt < 1:2127900/150‑1 (MQ=255) tcatTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGtttttt < 1:3235300/150‑1 (MQ=255) catTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTtg > 2:288443/1‑150 (MQ=255) catTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTtg > 2:286775/1‑150 (MQ=255) tttttGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGATCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTATGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTtgtga > 2:4380442/1‑149 (MQ=255) tGGTGCCAAGTTCCAGTGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCAtt > 2:1555912/1‑150 (MQ=255) tGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCAtt < 2:3372050/150‑1 (MQ=255) tGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCACTTTCACTGTTTTTTGTGCCAtt > 2:4123423/1‑150 (MQ=255) ggTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCAttt < 1:3394858/150‑1 (MQ=255) gCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAg < 2:3239373/150‑1 (MQ=255) aGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGc < 2:2787105/150‑1 (MQ=255) gTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCa < 1:529262/150‑1 (MQ=255) gTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCa < 2:1038364/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCAtt > 2:2160018/1‑150 (MQ=255) gCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTg < 2:3737161/150‑1 (MQ=255) gCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTg < 1:2909921/150‑1 (MQ=255) cGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTgg > 1:4123631/1‑150 (MQ=255) cGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTgg > 2:2999007/1‑150 (MQ=255) gTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTggg > 1:4198339/1‑150 (MQ=255) aaTATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTa > 1:1109349/1‑150 (MQ=255) atatTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTAt < 2:3194724/150‑1 (MQ=255) gAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGtt < 1:618778/150‑1 (MQ=255) gAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGtt < 1:2699919/150‑1 (MQ=255) aaGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTg > 1:3010645/1‑150 (MQ=255) agagCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGc > 1:2452905/1‑150 (MQ=255) gagCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGcc < 2:805978/150‑1 (MQ=255) agCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGcca < 2:2469140/150‑2 (MQ=255) ctgctgGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTa < 1:211366/150‑1 (MQ=255) ctgctgGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTa < 1:2276751/150‑1 (MQ=255) tgctgGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTaa > 2:205643/1‑150 (MQ=255) gctgGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAAc < 1:4395590/150‑1 (MQ=255) ctgGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACg < 2:4809107/150‑1 (MQ=255) gTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTTCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAAATTCACAGTTTTTTGTTCCATTTCAGGTTCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAAAGCTg > 1:2436994/1‑150 (MQ=255) gTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTg < 1:3906235/150‑1 (MQ=255) tAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTgg > 1:3214499/1‑150 (MQ=255) tAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTgg > 2:4072495/1‑150 (MQ=255) aGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGt < 2:4112177/150‑1 (MQ=255) gcCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCC‑GATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTc > 2:4682758/1‑150 (MQ=255) ccGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTc < 2:702429/150‑1 (MQ=255) cGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCa < 1:3449744/150‑1 (MQ=255) cGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCa < 1:1196285/150‑1 (MQ=255) ccGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCAcggcg > 2:1947160/1‑150 (MQ=255) gACTCTCGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGgt > 1:4110853/1‑150 (MQ=255) aCTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTGTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGgtg < 2:1630826/150‑1 (MQ=255) tCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGGtgtt > 1:1167354/1‑150 (MQ=255) | GCATGGCTTCAGCTATATGCAGTTCATCGTACCGGGGCTGATCATGATGTCGGTGATCACCAATGCCTACGCCAACGTTGCGTCATCATTTTTTGGTGCCAAGTTCCAGCGTAATATTGAAGAGCTGCTGGTAGCGCCGGTTCCGACTCACGTCATTATTGCCGGATATGTCGGCGGTGGCGTGGCGCGTGGTCTGTTTGTTGGCATTCTGGTGACGGCAATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGGTGTTGT > CP009273/140347‑140645 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |