| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,592,504 | A→T | 6.8% | intergenic (‑260/+370) | yneO ← / ← lsrK | pseudogene, AidA homolog/autoinducer‑2 (AI‑2) kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,592,504 | 0 | A | T | 6.8% | 531.1 / 22.4 | 148 | intergenic (‑260/+370) | yneO/lsrK | pseudogene, AidA homolog/autoinducer‑2 (AI‑2) kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/86); new base T (4/6); total (56/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
ATATACAAACAATACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTAAAAATCGAAGTTTAT > CP009273/1592355‑1592645 | atatACAAACAATACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTa < 2:3347501/150‑1 (MQ=255)atatACAAACAATACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTa > 2:4473952/1‑150 (MQ=255)atatACAAACAATACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTa > 2:4474100/1‑150 (MQ=255) aaacaaTACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAAtt < 1:1288546/150‑1 (MQ=255) aaacaaTACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAAtt > 1:212084/1‑150 (MQ=255) aaacaaTACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAAtt > 1:212068/1‑150 (MQ=255) aacacTACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTg < 2:3028352/150‑1 (MQ=255) aacaaTACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTg < 2:3028880/150‑1 (MQ=255) aacaaTACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTg < 1:3363528/150‑1 (MQ=255) aaTACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCAt > 1:1761323/1‑150 (MQ=255) aaTACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCAt < 1:1589044/150‑1 (MQ=255) aaTACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCAt > 2:1589244/1‑150 (MQ=255) aTACAGCCACGAAATAGATGAGACGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATa < 2:3105853/150‑1 (MQ=255) aTACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATa > 1:4414601/1‑150 (MQ=255) aCAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGt < 2:2569194/150‑1 (MQ=255) cAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGtt < 1:4176258/150‑1 (MQ=255) gCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCt < 2:3524981/150‑1 (MQ=255) aCGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCttat < 2:2387255/150‑1 (MQ=255) gAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTTAAAATTGCATAGTTCttattt > 1:810691/1‑150 (MQ=255) gAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTTAAAATTGCATAGTTCttattt < 2:2480814/150‑1 (MQ=255) gAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTTAAAATTGCATAGTTCttattt < 2:2480480/150‑1 (MQ=255) gAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTATAAATTGCATAGTTCttattt > 2:1306581/1‑150 (MQ=255) gAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCttattt > 2:3766534/1‑150 (MQ=255) agagATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCttattttat < 2:2423070/150‑1 (MQ=255) agaTGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTtattttattt < 1:152790/150‑1 (MQ=255) agaTGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTtattttattt < 1:152985/150‑1 (MQ=255) agaTGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTtattttattt < 2:3992220/150‑1 (MQ=255) aTGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTaa > 2:4052996/1‑150 (MQ=255) aTGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTaa > 2:1594549/1‑150 (MQ=255) tGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTaaa < 1:4055251/150‑1 (MQ=255) gAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAat > 2:4030278/1‑150 (MQ=255) tcgtcAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATg < 1:3655162/150‑1 (MQ=255) tcgtcAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATg < 1:3544348/150‑1 (MQ=255) tcgtcAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATg < 2:4124426/150‑1 (MQ=255) aCATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATg < 1:3761513/150‑1 (MQ=255) aTTAAAAATGAAACTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAg > 2:3397564/1‑150 (MQ=255) tAAAAATGAAACTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGtt > 2:1769482/1‑150 (MQ=255) aaaaaTGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTa > 2:2570554/1‑150 (MQ=255) aaaaTGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTAt < 1:1432471/150‑1 (MQ=255) aaTGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTAttg > 1:2364043/1‑150 (MQ=255) aaTGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTAttg > 1:2363216/1‑150 (MQ=255) aaTGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTAttg > 1:3172852/1‑150 (MQ=255) tGAAACTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTAttgtt > 1:1618040/1‑150 (MQ=255) aaaCTCATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGc > 2:2231628/1‑150 (MQ=255) aaCTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCt < 2:4494146/150‑1 (MQ=255) aCTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTTAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCtt < 2:630224/150‑1 (MQ=255) aCTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCtt < 2:413165/150‑1 (MQ=255) aCTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCtt < 2:191453/150‑1 (MQ=255) ttattaAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTtaa > 2:4714168/1‑150 (MQ=255) tattaAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTtaat > 2:494703/1‑150 (MQ=255) cattaAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTtaat < 2:2649046/149‑1 (MQ=255) ttaAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTTAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTtaataa < 1:1860203/150‑1 (MQ=255) ttaAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATTAGTTATTGTTGCTtaataa > 1:4464393/1‑150 (MQ=255) ttaAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTtaataa < 1:12140/150‑1 (MQ=255) taAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAg > 1:3296663/1‑150 (MQ=255) aaaTTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGa > 1:2535232/1‑150 (MQ=255) aaTTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGTAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGaa < 2:4637283/150‑1 (MQ=255) aaTTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGaa < 2:4637318/150‑1 (MQ=255) aTTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGaaa < 1:2534151/150‑1 (MQ=255) aTTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGaaa > 2:456318/1‑150 (MQ=255) tGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAAc < 1:4184657/150‑1 (MQ=255) tGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAAc < 1:4184682/150‑1 (MQ=255) tCAGAGGTCTGTATTGAGTGGTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTg < 2:3275401/150‑1 (MQ=255) agagGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGtt < 1:3309072/150‑1 (MQ=255) agagGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGtt > 1:454316/1‑150 (MQ=255) gagGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGttt < 1:660136/150‑1 (MQ=255) agGTCTTTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTGGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGtttc < 2:3072544/150‑1 (MQ=255) agGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAATAAAACTGtttc > 1:1429055/1‑150 (MQ=255) tATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAAt > 2:2931659/1‑150 (MQ=255) aTTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATa > 1:1351854/1‑150 (MQ=255) aTTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATa > 2:1277465/1‑150 (MQ=255) gtTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAAt < 1:1156861/150‑1 (MQ=255) tAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTa < 2:2682000/150‑1 (MQ=255) aGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTatcatcat < 2:4414027/150‑1 (MQ=255) tGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATcatcatcat < 1:498929/150‑1 (MQ=255) gggAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCata < 1:1882780/150‑1 (MQ=255) ggAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCatat < 2:2431222/150‑1 (MQ=255) gAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTTAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATAtt > 2:4221694/1‑150 (MQ=255) aGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTa < 1:3510741/150‑1 (MQ=255) ggTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTaa < 1:494703/150‑1 (MQ=255) gtgtCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAAc < 2:3841082/150‑1 (MQ=255) aaTTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGa > 1:3999962/1‑150 (MQ=255) tttGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAAt < 1:700745/150‑1 (MQ=255) tAATTTGCTAATTCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACt < 2:3185569/150‑1 (MQ=255) tAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACt < 1:479063/150‑1 (MQ=255) aaTTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTa < 2:4515031/150‑1 (MQ=255) tttGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAAt < 1:4454940/150‑1 (MQ=255) tGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTg > 2:4539189/1‑150 (MQ=255) tGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTg > 2:457751/1‑150 (MQ=255) gCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGc < 2:1318030/150‑1 (MQ=255) cTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCt < 2:4096620/150‑1 (MQ=255) aaTGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTaa > 1:2646106/1‑150 (MQ=255) aaTGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTaa > 1:2646977/1‑150 (MQ=255) aaTGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTaa < 1:2894153/150‑1 (MQ=255) tCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTAAAAATCGa > 1:2520920/1‑150 (MQ=255) aTTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTAAAAATCGAAGtt < 2:3574797/150‑1 (MQ=255) aTTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTAAAAATCGAAGtt > 2:1818349/1‑150 (MQ=255) aTTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTAATTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTAAAAATCGAAGtt < 2:3574976/150‑1 (MQ=255) ttGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTATAAATCGAAGttt > 1:4260452/1‑150 (MQ=255) ttGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTAAAAATCGAAGttt < 1:765305/150‑1 (MQ=255) | ATATACAAACAATACAGCCACGAAAGAGATGAGTCGTCAGACATTAAAAATGAAACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTAAAAATCGAAGTTTAT > CP009273/1592355‑1592645 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |