| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,897,318 | 0 | T | A | 22.2% | 481.1 / 143.1 | 207 | intergenic (+42/‑21) | manX/manY | fused mannose‑specific PTS enzymes: IIA component/IIB component/mannose‑specific enzyme IIC component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (105/56); new base A (24/22); total (129/78) | |||||||||||
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Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
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tCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATGACCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGtt > 2:1596955/1‑150 (MQ=255) tCTAACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTACCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGtt > 2:2679217/1‑150 (MQ=255) | AGGCGTTCAAGAAACTGAATGCGCGCGGTATTGAGCTGGAAGTCCGTAAGGTTTCCACCGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTACCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTC > CP009273/1897170‑1897465 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |