| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 169,092 | T→G | 8.0% | L382V (TTG→GTG) | fhuB → | fused iron‑hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 169,092 | 0 | T | G | 8.0% | 1027.0 / 34.4 | 373 | L382V (TTG→GTG) | fhuB | fused iron‑hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (123/213); new base G (34/2); total (158/215) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 384 total aligned reads displayed.
CGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGG‑CTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTCCGGCGCG > CP009273/168943‑169241 | cGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATATGCTGGCGTTTTCCCACGCGGGCGGCGTGGTTCTGTTTATTGCGGTGGTGGTTGCGCTGTCGTTTTGTCGTGATTCGCACGGCCTGGACG‑GGGCGAGCGGGGCGt > 2:4091119/1‑150 (MQ=255) atGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTTCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTTGTGGTGGTGGGCACGG‑CTGGACGTGGGGGAGCGGGGCGGTGCTc > 1:298920/1‑150 (MQ=255) atGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGG‑CTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTc < 1:506232/150‑1 (MQ=255) atGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGG‑CTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTc < 1:1930369/150‑1 (MQ=255) atGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGG‑CTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTc < 1:3702295/150‑1 (MQ=255) atGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCGCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGTTGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGGTTCGCCCCG‑CGGGGCGTGGGCGAGCCGGGCGGTGCTc > 1:2730011/1‑150 (MQ=255) tGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGG‑CTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCg < 2:2915970/150‑1 (MQ=255) tGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCACGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGGGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGGGATGCGCACGG‑CTGGTCGTGGGCGACCGGGGCGTGGcgag > 2:670556/1‑147 (MQ=255) 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aTGCGCACGG‑CTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTAGAGGATTTAATTCACTGTCGCTGGCCGCGAAATATGGCGGCGCTGGTTTCCGGCGACAAGCAGGCGGTGGCGGGCGGTATTATTCATCCACTTACCAGAAAACCGAATGCaa > 1:4515136/1‑150 (MQ=255) gcgcACGG‑CTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGc < 1:1643384/150‑1 (MQ=255) cACGG‑CTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCg < 1:1001643/150‑1 (MQ=255) cGG‑CTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGa < 2:1967351/150‑1 (MQ=255) gg‑CTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGaa < 2:2365624/150‑1 (MQ=255) g‑CTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAg < 1:4402850/150‑1 (MQ=255) cTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGt < 1:3541053/150‑1 (MQ=255) ggACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGc < 2:1120075/150‑1 (MQ=255) gACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCt < 1:2309149/150‑1 (MQ=255) gACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCt < 1:3128695/150‑1 (MQ=255) tGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTgggg > 2:3038500/1‑150 (MQ=255) ctgCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGa > 1:995165/3‑150 (MQ=255) gCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGAtt < 1:1020185/150‑1 (MQ=255) gCGAGCGGGGCGGTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGAtt < 1:4068033/150‑1 (MQ=255) cGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTa > 1:3270158/1‑150 (MQ=255) cGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTa < 1:2421052/150‑1 (MQ=255) cGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTa < 2:1825479/150‑1 (MQ=255) cGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTc > 1:1636743/1‑150 (MQ=255) ggggCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTcc > 1:3347852/1‑150 (MQ=255) ggggCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTcc > 2:347791/1‑150 (MQ=255) ggggCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTcc < 1:1725957/150‑1 (MQ=255) gggCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTCcg < 2:3693650/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTCcgg < 1:359891/150‑1 (MQ=255) cGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTCcggcg > 1:213112/1‑150 (MQ=255) ttGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTCcggcgcg > 1:3885231/1‑150 (MQ=255) ttGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTCcggcgcg > 1:4768224/1‑150 (MQ=255) ttGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTCcggcgcg < 2:2515542/150‑1 (MQ=255) | CGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTGCTGTTGATGGCTGTGGTGGTGGCGCTGTCGTTTGGTCGTGATGCGCACGG‑CTGGACGTGGGCGAGCGGGGCGTTGCTCGAGGATTTAATGCCCTGGCGCTGGCCGCGAATTATGGCGGCGCTGTTTGCGGGCGTCATGCTGGCGGTGGCGGGCTGTATTATTCAGCGACTGACCGGAAACCCGATGGCAAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTCCGGCGCG > CP009273/168943‑169241 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |