| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,381,961 | C→A | 26.5% | intergenic (‑56/‑153) | yfbN ← / → yfbO | uncharacterized protein/uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,381,961 | 0 | C | A | 26.5% | 359.3 / 122.8 | 162 | intergenic (‑56/‑153) | yfbN/yfbO | uncharacterized protein/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/80); new base A (16/27); total (55/107) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
CATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATA > CP009273/2381812‑2382110 | cATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGAcc > 1:2472554/1‑150 (MQ=255)cATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGAcc > 2:1907807/1‑150 (MQ=255) tCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCg > 1:4408241/1‑150 (MQ=255) tCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCg > 1:4408299/1‑150 (MQ=255) tCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCg > 1:925236/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGcc < 1:4435826/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGcc < 1:4435886/150‑1 (MQ=255) gCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCctg > 1:3252276/1‑150 (MQ=255) gCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTAAGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACTACACGGCctg > 1:3252328/1‑150 (MQ=255) cAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCctgac < 2:73735/150‑1 (MQ=255) ccTCTCTAACAACCGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGaa < 2:666000/150‑1 (MQ=255) ccTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGaa < 2:958304/150‑1 (MQ=255) tctctAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAata < 2:107417/150‑1 (MQ=255) aCAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCAc > 2:2320210/1‑150 (MQ=255) gTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTc > 2:4333161/1‑150 (MQ=255) cgggCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCCCGTTTTCCt < 1:1912327/148‑1 (MQ=255) cTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCt < 1:1911405/150‑1 (MQ=255) cTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCt < 2:340781/150‑1 (MQ=255) cTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCt < 2:3316759/150‑1 (MQ=255) cTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCt < 2:1550882/150‑1 (MQ=255) ggCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCAATTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATTATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGc < 2:475295/150‑1 (MQ=255) gCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCt < 1:1457741/150‑1 (MQ=255) cAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCtt < 1:4865186/150‑1 (MQ=255) aaCCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTa > 1:1332392/1‑150 (MQ=255) aaCCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTa < 2:4409962/150‑1 (MQ=255) aaCCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTa < 2:1957409/150‑1 (MQ=255) ccTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAAc < 2:881298/150‑1 (MQ=255) ccTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAAc < 2:1426728/150‑1 (MQ=255) cTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACa < 2:612152/150‑1 (MQ=255) ggATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCAGTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACAtt < 1:2125756/150‑1 (MQ=255) tACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCAt > 2:3194049/1‑150 (MQ=255) aCCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATg > 1:1557366/1‑150 (MQ=255) cGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGtt < 2:4696343/150‑1 (MQ=255) aCAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTat < 2:3675179/150‑1 (MQ=255) aCAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTat < 2:3520107/150‑1 (MQ=255) gTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTatgatg < 1:1781306/150‑1 (MQ=255) gTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTatgatg < 2:3207058/150‑1 (MQ=255) gTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTatgatg < 2:3227009/150‑1 (MQ=255) aCGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGct < 2:4745518/150‑1 (MQ=255) ttcttcCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCtt > 1:3053249/1‑150 (MQ=255) ttcttcCGAAGTTTACGAATTACACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCtt < 2:1202573/150‑1 (MQ=255) ccGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAAc < 1:3552766/150‑1 (MQ=255) cGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACt > 2:1311860/1‑150 (MQ=255) gAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATACATGTTATGATGCTCTTGAAACta > 2:4728040/1‑150 (MQ=255) aGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACtaat < 1:1398761/150‑1 (MQ=255) gTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACtaata < 1:4032492/150‑1 (MQ=255) ttACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTaataat < 2:1101858/150‑1 (MQ=255) aCGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATAc < 2:1668870/150‑1 (MQ=255) aTTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTAt < 2:2444797/150‑1 (MQ=255) ttCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATgg < 1:3429024/150‑1 (MQ=255) cTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAAtt < 1:2905542/150‑1 (MQ=255) ttAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTg < 1:1557722/150‑1 (MQ=255) aaTTACATGTCAAACCCCTTTAAATTTTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACt < 1:2925086/149‑1 (MQ=255) aTTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTa < 2:2820782/150‑1 (MQ=255) aTGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTAt < 2:4096058/150‑1 (MQ=255) tGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATc < 2:61441/150‑1 (MQ=255) tGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATc < 2:61484/150‑1 (MQ=255) gTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCt < 2:3004831/150‑1 (MQ=255) tCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTg < 1:783124/150‑1 (MQ=255) aCCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTaa < 1:1143907/150‑1 (MQ=255) ttAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAAtt < 1:4334262/150‑1 (MQ=255) tAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTc < 2:4648605/150‑1 (MQ=255) tAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTc > 2:3809792/1‑150 (MQ=255) atatTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACTTTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCaat < 2:4561278/150‑2 (MQ=255) tttATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACaa < 2:1379074/150‑1 (MQ=255) tttATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACaa < 2:4465381/150‑1 (MQ=255) ttATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAAt > 2:2553717/1‑150 (MQ=255) ttATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAAt > 1:3593644/1‑150 (MQ=255) ttATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAAt < 2:125849/150‑1 (MQ=255) ttATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAAt > 2:2525178/1‑150 (MQ=255) ttATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAAt > 2:2525177/1‑150 (MQ=255) aTGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGt > 2:3342405/1‑150 (MQ=255) aTGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGt > 2:3343007/1‑150 (MQ=255) tGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTc > 1:2221063/1‑150 (MQ=255) tGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTc > 1:4674454/1‑150 (MQ=255) tAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGt < 1:127497/150‑1 (MQ=255) tAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGt < 2:89043/150‑1 (MQ=255) aacaacGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTtgatga > 2:3742085/1‑150 (MQ=255) aacaacGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTtgatga > 2:2270048/1‑150 (MQ=255) aacaacGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTtgatga > 1:3954357/1‑150 (MQ=255) aacaacGTCTGGATAACGACACTGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCGTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTtgatga < 2:3252328/150‑1 (MQ=255) aacaacGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTtgatga < 2:3252276/150‑1 (MQ=255) aacGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAata < 2:531407/150‑1 (MQ=255) aacGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAata > 1:2142630/1‑150 (MQ=255) acGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAatat < 1:4115409/150‑1 (MQ=255) cGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAatata < 2:3483877/150‑1 (MQ=255) cTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATAtatta > 1:267676/1‑150 (MQ=255) tGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATAtattat < 2:3697417/150‑1 (MQ=255) tGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATAtattat < 1:715298/150‑1 (MQ=255) gATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTAttt < 1:2579495/150‑1 (MQ=255) aTAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTc > 2:1950199/1‑150 (MQ=255) aTAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTc < 1:1437835/150‑1 (MQ=255) aaCGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAg < 1:3273972/150‑1 (MQ=255) aaCGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAg < 1:3907463/150‑1 (MQ=255) cGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAggg > 2:2605196/1‑150 (MQ=255) cGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAggg > 2:4125055/1‑150 (MQ=255) aCCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGaa > 1:4584360/1‑150 (MQ=255) aCCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGaa > 1:2133997/1‑150 (MQ=255) cccGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGaat < 1:4514281/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGaata > 2:2127091/1‑150 (MQ=255) | CATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATA > CP009273/2381812‑2382110 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |