| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,464,269 | G→A | 22.2% | intergenic (+328/‑25) | gtrS → / → tfaS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage/pseudogene, CPS‑53 (KpLE1) prophage; tail fiber assembly protein fragment;Phage or Prophage Related |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,464,269 | 0 | G | A | 22.2% | 535.9 / 151.0 | 243 | intergenic (+328/‑25) | gtrS/tfaS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage/pseudogene, CPS‑53 (KpLE1) prophage; tail fiber assembly protein fragment;Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (107/81); new base A (25/29); total (133/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
CACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACTGC > CP009273/2464120‑2464418 | acaacaAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAggg > 2:1365991/1‑150 (MQ=255) caacaaACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAgggg > 2:2994169/1‑150 (MQ=255) aacaaACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGt > 2:3375989/1‑150 (MQ=255) aaaCCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGAGGTTAt < 1:1698632/150‑1 (MQ=255) aCCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGt > 2:1198201/1‑150 (MQ=255) cccccTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGAGGTTATGtt < 2:1743177/150‑1 (MQ=255) ccccTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGttt < 1:3511022/150‑1 (MQ=255) cTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTa > 1:1344586/1‑150 (MQ=255) tCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTAt < 2:1829976/150‑1 (MQ=255) cAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGAGGTTATGTTTGTATGc > 1:1490545/1‑150 (MQ=255) aGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGAGGTTATTTTTGTATGCg < 1:1802486/150‑1 (MQ=255) gAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGt > 1:407265/1‑150 (MQ=255) gAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGt > 2:2505561/1‑150 (MQ=255) aCCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTcc > 1:342305/1‑150 (MQ=255) ccAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTccc < 2:1695114/150‑1 (MQ=255) ccAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTccc < 2:614311/150‑1 (MQ=255) cAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCcg > 1:518824/1‑150 (MQ=255) aaGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCcgc > 2:529463/1‑150 (MQ=255) gTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGa < 1:3460133/150‑1 (MQ=255) gCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACt > 2:1393228/1‑150 (MQ=255) cTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTa < 2:4465819/150‑1 (MQ=255) atatTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCg > 1:2081494/1‑150 (MQ=255) atatTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCg < 2:1128700/150‑1 (MQ=255) ttatCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGccc > 1:4143227/1‑150 (MQ=255) catcaACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCAtt > 2:4573358/1‑150 (MQ=255) catcaACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCAtt < 1:1705434/150‑1 (MQ=255) atcaACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTa < 1:4691598/150‑1 (MQ=255) caACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAAc < 1:2418306/150‑1 (MQ=255) aaCAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACg > 2:4288293/1‑150 (MQ=255) aaCAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACg > 2:4764902/1‑150 (MQ=255) aaCAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACg < 1:3400018/150‑1 (MQ=255) aCAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGc > 2:1079787/1‑150 (MQ=255) aCAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGc > 1:4705311/1‑150 (MQ=255) cAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGcc < 1:1369640/150‑1 (MQ=255) cAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGcc < 1:265741/150‑1 (MQ=255) tGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATa < 1:4391516/150‑1 (MQ=255) gatagataCATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATAc > 2:3623315/1‑150 (MQ=255) agataCATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGAt < 2:2414639/150‑1 (MQ=255) ataCATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATaa < 1:2766325/150‑1 (MQ=255) ataCATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATaa < 2:4840974/150‑1 (MQ=255) taCATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATaaa < 2:2206891/150‑1 (MQ=255) aCATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAAt < 1:2881042/150‑1 (MQ=255) aCATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAAt < 1:507721/150‑1 (MQ=255) ataCTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGa > 1:1027451/1‑150 (MQ=255) ataCTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGa < 1:1824186/150‑1 (MQ=255) tAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGt > 2:3765764/1‑150 (MQ=255) tGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTgaga < 1:2383416/150‑1 (MQ=255) tGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGAGGGTgaga > 2:3308875/1‑150 (MQ=255) gATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGaa > 1:1621886/1‑150 (MQ=255) ttATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGa > 2:1790042/1‑150 (MQ=255) tataAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGAc > 1:659942/1‑150 (MQ=255) gATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATAcc > 1:4476427/1‑150 (MQ=255) gATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATAcc > 1:4475867/1‑150 (MQ=255) gATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATAcc < 2:195096/150‑1 (MQ=255) aTTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCg < 1:2994169/150‑1 (MQ=255) tCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAg < 2:2907212/150‑1 (MQ=255) ccTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAgg < 1:2278774/150‑1 (MQ=255) tCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGTcaca < 2:4015059/150‑1 (MQ=255) tCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGcaca > 1:3737455/1‑150 (MQ=255) tCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGcaca > 1:3737865/1‑150 (MQ=255) taCTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATa < 1:1052862/150‑1 (MQ=255) taCTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATa > 2:1356089/1‑150 (MQ=255) aaCATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTc < 2:652981/150‑1 (MQ=255) aTAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCa > 2:214516/1‑150 (MQ=255) aTAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCa > 2:2557339/1‑150 (MQ=255) aaGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGt > 2:1530999/1‑150 (MQ=255) aaGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGt > 1:3178846/1‑150 (MQ=255) aGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTa > 1:1275923/1‑150 (MQ=255) aGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTa < 2:4742538/150‑1 (MQ=255) gACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGa > 2:1252597/1‑150 (MQ=255) aCTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGAt > 1:3610510/1‑150 (MQ=255) cTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATg < 2:2632411/150‑1 (MQ=255) cTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATg < 1:4218942/150‑1 (MQ=255) cTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATg > 1:4361228/1‑150 (MQ=255) cTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATg < 2:2632762/150‑1 (MQ=255) ttCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATgc > 2:4390513/1‑150 (MQ=255) ttCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATgc > 1:3913342/1‑150 (MQ=255) cACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATgcagc > 1:4586348/1‑150 (MQ=255) tttGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGa < 1:3996868/150‑1 (MQ=255) tGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAg > 1:575970/1‑150 (MQ=255) ctcGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAg > 1:4011379/1‑150 (MQ=255) cGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACGGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAgcg > 1:4175644/1‑150 (MQ=255) aTAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGcc > 2:3914641/1‑150 (MQ=255) aTAGACACATAACATCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGcc > 1:908208/1‑150 (MQ=255) aGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAg > 1:2061894/1‑150 (MQ=255) aGACACATAACATCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCAGACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAg > 2:378313/1‑150 (MQ=255) acacATAACATCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTc > 1:4611999/1‑150 (MQ=255) cacaTAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCg > 1:463966/1‑150 (MQ=255) acaTAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGc > 2:3195536/1‑150 (MQ=255) aTAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCtg < 1:3780189/150‑1 (MQ=255) aCATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCtgatt > 2:3170845/1‑150 (MQ=255) aCATCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCtgatt < 1:1414742/150‑1 (MQ=255) cATCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCtgattg < 2:1203421/150‑1 (MQ=255) aTCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCtgattga < 2:2319076/150‑1 (MQ=255) aTCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCtgattga > 1:754678/1‑150 (MQ=255) aTCCAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCtgattga > 1:888693/1‑150 (MQ=255) ccAGAGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATa < 2:1490545/150‑1 (MQ=255) cAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATAc > 2:3610725/1‑150 (MQ=255) aGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACt > 1:2238605/1‑150 (MQ=255) gggTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACTGc < 2:2081030/150‑1 (MQ=255) | CACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACTGC > CP009273/2464120‑2464418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |