Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,495,786 | 0 | C | T | 25.0% | 538.1 / 195.6 | 273 | D727N (GAT→AAT) | fryA | putative PTS enzyme, Hpr component/enzyme I component/enzyme IIA component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (107/97); new base T (32/36); total (139/134) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.85e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
GACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAGCGCCAGCAGTGGGCGAACGTCTTCTTCCGGCGTAA > CP009273/2495637‑2495935 | gACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACAtc > 2:606219/1‑150 (MQ=255) gACTTCGCCCATTGCTGACGGCCAGCCATGGGGTTTCGCCCGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGCCGGATCCAGTGTGTTTTGGTGTGGGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACAtc < 1:3731365/150‑1 (MQ=255) ttCGCCCTTTTCTGACTGCCAGACACTCGGTTTCGCCTGCCGGGAAATGCTGATACTGTATTGACGGATCCACTTTTATTTGGTGTGGGGTATCGATACGCAAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACAtcttc < 1:26218/150‑1 (MQ=255) 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tGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAGCGCCAGCAGTGGGCGAACGtcttct > 1:1626583/1‑150 (MQ=255) gCCAGAAATGTTCTTCCAGCTCAAACGGATTTTCTGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAGCGCCAGCAGTGGGCGAACGTcttctt < 1:3341432/150‑1 (MQ=255) ccAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAGCGCCAGCAGTGGGCGAACGTCttcttc > 2:2725598/1‑150 (MQ=255) ccAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAGCGCCAGCAGTGGGCGAACGTCttcttc < 2:1973494/150‑1 (MQ=255) cAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAGCGCCAGCAGTGGGCGAACGTCTTCTTcc < 1:3965362/150‑1 (MQ=255) 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tcttctTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAGCGCCAGCAGTGGGCGAACGTCTTCTTCCGGCGTa < 1:995037/150‑1 (MQ=255) cttcttCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAGCGCCAGCAGTGGGCGAACGTCTTCTTCCGGCGTaa < 1:1810095/150‑1 (MQ=255) | GACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATTCTCCAGCGCCAGCAGTGGGCGAACGTCTTCTTCCGGCGTAA > CP009273/2495637‑2495935 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |