| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,568,720 | C→T | 64.9% | A33T (GCC→ACC) | eutP ← | putative P‑loop NTPase ethanolamine utilization protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,568,720 | 0 | C | T | 64.9% | 230.5 / 233.8 | 211 | A33T (GCC→ACC) | eutP | putative P‑loop NTPase ethanolamine utilization protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/40); new base T (48/89); total (82/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.08e-01 | |||||||||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
GCAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATAAG > CP009273/2568573‑2568868 | gcaACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCt < 1:4283786/150‑1 (MQ=255) caACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCtg < 2:1830129/150‑1 (MQ=255) caACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCtg < 1:4656072/150‑1 (MQ=255) aCCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCtgtg < 1:2195941/150‑1 (MQ=255) cGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGtt < 1:1088187/150‑1 (MQ=255) cGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGtt < 1:4606033/150‑1 (MQ=255) cGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGtt < 2:2460296/150‑1 (MQ=255) cGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGtt < 1:3546083/150‑1 (MQ=255) aCTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGtttt > 1:840807/1‑150 (MQ=255) aCTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGtttt > 2:682751/1‑150 (MQ=255) cTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGttttt < 2:4341660/150‑1 (MQ=255) tttCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTc < 1:646109/150‑1 (MQ=255) ttCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCt < 1:3166967/150‑1 (MQ=255) ccGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTgg > 2:629674/1‑150 (MQ=255) gggTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCg > 2:1521821/1‑150 (MQ=255) gTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAg < 1:2484719/150‑1 (MQ=255) tCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAgg < 1:1988016/150‑1 (MQ=255) tCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAgg < 1:1987753/150‑1 (MQ=255) tttGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGta < 1:1309581/150‑1 (MQ=255) tttGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGta < 1:3025509/150‑1 (MQ=255) tttGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGta < 2:3938545/150‑1 (MQ=255) tGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGtata > 2:4552498/1‑150 (MQ=255) tGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGtata < 1:145595/150‑1 (MQ=255) cgcCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAAt < 1:1136375/150‑1 (MQ=255) gcCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAAtt < 1:2221602/150‑1 (MQ=255) aTGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTccc > 2:3191944/1‑150 (MQ=255) ggACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCt < 1:3334228/150‑1 (MQ=255) gACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTg < 1:3382983/150‑1 (MQ=255) gACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTg > 2:728150/1‑150 (MQ=255) gACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTg < 1:857973/150‑1 (MQ=255) gACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTg > 2:4111463/1‑150 (MQ=255) cATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCa < 1:2063971/150‑1 (MQ=255) cATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCa < 1:1935055/150‑1 (MQ=255) cATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCa < 1:3473249/150‑1 (MQ=255) aTCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCa < 2:2958528/150‑1 (MQ=255) tCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCAt > 2:1380883/1‑150 (MQ=255) aGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTa < 1:1820025/150‑1 (MQ=255) aTGTCTACATCCTGTAGCGTGGTTATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTTAAt < 2:781990/150‑1 (MQ=255) aTGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAAt < 1:4441743/150‑1 (MQ=255) gTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATaa > 1:3332226/1‑150 (MQ=255) tCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATTGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAAc < 1:3576582/150‑1 (MQ=255) tCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAAc < 1:319935/150‑1 (MQ=255) aCATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgtt < 2:4744815/150‑1 (MQ=255) cATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttg < 1:2643943/150‑1 (MQ=255) aTCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttgt > 1:2599131/1‑150 (MQ=255) ccTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGttt < 1:3225964/150‑1 (MQ=255) ccTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGttt > 2:2644637/1‑150 (MQ=255) cTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGtttt < 1:4210832/150‑1 (MQ=255) cTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGtttt < 2:4558020/150‑1 (MQ=255) cTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGtttt > 1:3692720/1‑150 (MQ=255) cTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGtttt > 2:1532104/1‑150 (MQ=255) tAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTcc > 1:3154969/1‑150 (MQ=255) aGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCt < 2:3872566/150‑1 (MQ=255) cGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGc < 2:3845918/150‑1 (MQ=255) aaTTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGAc > 2:2132014/1‑150 (MQ=255) aaTTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGAc > 1:2773735/1‑150 (MQ=255) tAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCt > 2:17640/1‑150 (MQ=255) tAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCt < 1:4774497/150‑1 (MQ=255) gTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCcac > 1:1498220/1‑150 (MQ=255) tACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAAc < 2:3040397/150‑1 (MQ=255) tACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAAc < 2:3040168/150‑1 (MQ=255) tACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAAc > 1:3863612/1‑150 (MQ=255) aCCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACg < 1:1452446/150‑1 (MQ=255) aCCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACg > 1:3174855/1‑150 (MQ=255) cGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAAtt > 1:1178885/1‑150 (MQ=255) cGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCGGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAAtt < 2:2582068/150‑1 (MQ=255) ggggATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTc < 2:1498194/150‑1 (MQ=255) gTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCAt > 2:2830569/1‑150 (MQ=255) ttAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATg < 1:239099/150‑1 (MQ=255) ttAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATg < 2:844238/150‑1 (MQ=255) aaTATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATg < 2:2276458/150‑1 (MQ=255) atatTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGc > 2:2192258/1‑150 (MQ=255) ttCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTc < 2:126980/150‑1 (MQ=255) cGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTa < 1:2896754/150‑1 (MQ=255) cGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTa > 1:2820595/1‑150 (MQ=255) cGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACt > 1:2636045/1‑150 (MQ=255) cGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACt > 1:2635661/1‑150 (MQ=255) gTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACtt > 2:3639421/1‑150 (MQ=255) tATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACttt < 2:1034942/150‑1 (MQ=255) tATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACttt > 1:721905/1‑150 (MQ=255) aTCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACtttt < 1:682478/150‑1 (MQ=255) tCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTg < 2:1686115/150‑1 (MQ=255) tCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTg > 2:4137248/1‑150 (MQ=255) cAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTgg > 1:1663845/1‑150 (MQ=255) tatCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCa < 2:2663771/150‑1 (MQ=255) cGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCAttt > 2:4655837/1‑150 (MQ=255) cccTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTca > 2:2402371/1‑150 (MQ=255) tATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACaaa > 2:3916457/1‑150 (MQ=255) aTTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGt < 2:1971239/150‑1 (MQ=255) aTTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGt < 1:419603/150‑1 (MQ=255) aTTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAAGTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGt < 1:418409/150‑1 (MQ=255) tAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGtat < 2:4445668/150‑1 (MQ=255) aTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAAAGTTGTTTTTCCTGCCCCGACTCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAAt > 1:1023529/1‑150 (MQ=255) tCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAAttt < 1:1521821/150‑1 (MQ=255) tCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAAttt < 1:3652821/150‑1 (MQ=255) aCGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTtaat > 1:4095538/1‑150 (MQ=255) cGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTtaata < 1:629674/150‑1 (MQ=255) ggCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTtaataa < 1:1532104/150‑1 (MQ=255) gCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATAAg < 2:3342649/150‑1 (MQ=255) gCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATAAg < 2:3342472/150‑1 (MQ=255) | GCAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATAAG > CP009273/2568573‑2568868 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |