Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,752,877 | 0 | C | A | 27.3% | 289.5 / 109.4 | 139 | G178G (GGC→GGA) | yfjI | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.04e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
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gggCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTaga > 2:2472806/1‑150 (MQ=255) gggCACTGGCGATCAGTCGGAATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTaga < 1:1073760/150‑1 (MQ=255) cACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGAt > 1:1514269/1‑150 (MQ=255) cACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGAt > 2:398594/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATg > 2:1552951/1‑150 (MQ=255) 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tCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTGTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAacac > 1:3802133/1‑150 (MQ=255) catcatGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTc < 2:4774997/150‑1 (MQ=255) | GTAACAAAGATCACTTGGCAACAAATGAAAGACTTAAAGAACTACTTACGACAAACCCGAAAGCTCCAGTGAGATTCAAATTTTTATTTAACGATGCCACACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTC > CP009273/2752729‑2753026 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |