| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 2,759,757 | C→A | 25.8% | L161I (CTC→ATC) | rnlA → | CP4‑57 prophage; RNase LS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,759,757 | 0 | C | A | 25.8% | 554.0 / 180.3 | 240 | L161I (CTC→ATC) | rnlA | CP4‑57 prophage; RNase LS |
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Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
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tCACAACAGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACaggagg < 1:3881354/150‑1 (MQ=255) tCACAACAGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACaggagg < 2:2533843/150‑1 (MQ=255) tCACAACAGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACaggagg > 2:1243409/1‑150 (MQ=255) cacaACAGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGt > 2:4312869/1‑150 (MQ=255) acaacaGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGtt > 1:1447321/1‑150 (MQ=255) acaacaGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGtt > 1:3908965/1‑150 (MQ=255) acaacaGGTAAGATCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGtt < 2:463744/150‑1 (MQ=255) caGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGccc > 1:589001/1‑150 (MQ=255) aGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCg < 1:2105100/150‑1 (MQ=255) aGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCg > 1:1836839/1‑150 (MQ=255) aGGTAAGATCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCg > 2:2015148/1‑150 (MQ=255) gTAAGATCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCa > 2:3980213/1‑150 (MQ=255) | GTTCTACCTGTACTTGAGCTATCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCTCATACCGTAGTGTGGAAAATTATTTCCACCAGCTATCAGGACGAATTGACTGTGAGCCTGCATATCACAACAGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTA > CP009273/2759610‑2759905 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |