Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 233,053 | A→C | 24.0% | D167A (GAT→GCT) | dnaQ → | DNA polymerase III epsilon subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 233,053 | 0 | A | C | 24.0% | 491.6 / 209.9 | 262 | D167A (GAT→GCT) | dnaQ | DNA polymerase III epsilon subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (111/88); new base C (27/36); total (138/124) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.32e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
TATTCCGAAGACCAATACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCAAGTAAGTTACGCGTTGTTTTTG > CP009273/232904‑233202 | tatTCCGAAGACCAATACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGa > 2:1319229/1‑150 (MQ=255) atTCCGAAGACCAATACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGAt > 2:4374949/1‑150 (MQ=255) ttCCGAAGACCAATACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATg < 2:3693361/150‑1 (MQ=255) tCCGAAGACCAATACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGc > 1:2403013/1‑150 (MQ=255) ccGAAGACCAATACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGcc > 1:1734237/1‑150 (MQ=255) cGAAGACCAATACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGccc > 2:4028147/1‑150 (MQ=255) aaGACCAATACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAg < 2:1667574/150‑1 (MQ=255) aaGACCAATACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAg < 2:1415033/150‑1 (MQ=255) cAATACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCt < 1:3150474/150‑1 (MQ=255) cAATACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCt > 2:2409957/1‑150 (MQ=255) aaTACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCtt < 1:4200321/150‑1 (MQ=255) aaTACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCtt < 1:1956562/150‑1 (MQ=255) aCTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCg < 2:2765548/150‑1 (MQ=255) cTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCgg < 1:1886854/150‑1 (MQ=255) ttCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGaa < 2:3197937/150‑1 (MQ=255) ttCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGaa < 2:3195747/150‑1 (MQ=255) ttCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGaa > 1:461265/1‑150 (MQ=255) ttCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGaa > 1:461914/1‑150 (MQ=255) cTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGt > 2:2707871/1‑150 (MQ=255) aGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATc > 1:2850871/1‑150 (MQ=255) gTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTg > 1:2511368/1‑150 (MQ=255) gTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGACGTTTATCTg > 1:3272782/1‑150 (MQ=255) gTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTg > 1:3109107/1‑150 (MQ=255) cACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGc > 2:1089407/1‑150 (MQ=255) ccGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGa > 2:4819251/1‑150 (MQ=255) cGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGAt < 2:2344259/150‑1 (MQ=255) cGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGAt > 1:4566452/1‑150 (MQ=255) aTAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGa < 1:4592033/150‑1 (MQ=255) tAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGAc < 2:3093169/150‑1 (MQ=255) tAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGAc > 1:1433715/1‑150 (MQ=255) aGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGAcc > 1:1133658/1‑150 (MQ=255) aGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGAcc < 1:546026/150‑1 (MQ=255) ttGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCggtg > 1:2814084/1‑150 (MQ=255) tGCGGTGGCGAGTAAAATGTTTCCAGGTAATCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCTCTACGAAATAGATAACAGTAAACTAACGCTGCACGTTGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCggtgg < 2:2858716/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCa < 1:3617895/150‑1 (MQ=255) gTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCaa > 2:1236006/1‑150 (MQ=255) gTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCaa > 2:1842095/1‑150 (MQ=255) gTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCaa > 1:4245428/1‑150 (MQ=255) ggCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAAc < 1:151093/150‑1 (MQ=255) gAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGAt < 2:2891100/150‑1 (MQ=255) aaaTGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATgg < 1:2195225/150‑1 (MQ=255) aaTGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGc < 2:4675251/150‑1 (MQ=255) tGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCtt > 1:4842257/1‑150 (MQ=255) tGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCtt > 1:1001427/1‑150 (MQ=255) tGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCtt > 1:1001035/1‑150 (MQ=255) gTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCttt < 2:2018484/150‑1 (MQ=255) tttCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCtttt < 2:3713008/150‑1 (MQ=255) tttCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCtttt > 1:940098/1‑150 (MQ=255) tCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGc < 2:3838676/150‑1 (MQ=255) cGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGAt < 2:1208361/150‑1 (MQ=255) gTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATgg > 1:123579/1‑150 (MQ=255) tAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGa > 1:1173759/1‑150 (MQ=255) tAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGa > 1:3542611/1‑150 (MQ=255) aaGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGaa > 1:1469128/1‑150 (MQ=255) gcgcAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAgg < 1:1646692/150‑1 (MQ=255) cAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGac < 2:2534466/150‑1 (MQ=255) ccTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGAcaca < 2:2319430/150‑1 (MQ=255) cTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACacaa > 2:110454/1‑150 (MQ=255) tCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACacaac > 2:292263/1‑150 (MQ=255) cGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACacaaca < 1:3597813/150‑1 (MQ=255) cGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACacaaca > 1:1791350/1‑150 (MQ=255) aTGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGc > 1:2938110/1‑150 (MQ=255) tGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGca < 1:2775787/150‑1 (MQ=255) tgtgCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGt < 1:898897/150‑1 (MQ=255) tgCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGa > 1:2608119/1‑150 (MQ=255) cGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAAt < 1:4766999/150‑1 (MQ=255) gAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAAtt > 1:2517883/1‑150 (MQ=255) gAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAAtt < 2:1299841/150‑1 (MQ=255) aaaTAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTc < 1:4827971/150‑1 (MQ=255) aaaTAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATCACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTc > 2:1649240/1‑150 (MQ=255) aaTAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCa < 2:1380218/150‑1 (MQ=255) aaTAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCa > 1:2712747/1‑150 (MQ=255) tAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAgc > 2:594427/1‑150 (MQ=255) ataTAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAgcg > 2:2323601/3‑150 (MQ=255) aTAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCa > 1:2256612/1‑150 (MQ=255) tAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCAt > 1:3975256/1‑150 (MQ=255) aCAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTg > 1:3202861/1‑150 (MQ=255) acgaacgCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCa < 2:2517102/150‑1 (MQ=255) acgaacgCTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCa < 1:4030492/150‑1 (MQ=255) acgaacgCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCa > 2:3529264/1‑150 (MQ=255) gaacgCTGCACGGGGCGTTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAgg > 1:4163122/1‑150 (MQ=255) gaacgCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAgg > 1:269161/1‑150 (MQ=255) gaacgCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAgg > 2:1130615/1‑150 (MQ=255) acgCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCa < 1:3313816/150‑1 (MQ=255) cgCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCac > 2:4181926/1‑149 (MQ=255) cgCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCaa > 1:2253615/1‑150 (MQ=255) cgCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCaa > 2:716773/1‑150 (MQ=255) cTGCACGGGGCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCaagt > 2:4040626/1‑150 (MQ=255) cTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCaagt > 2:4677714/1‑150 (MQ=255) ggggCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGAGGGAAGGAGTGACAAAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCACGTAAGTTa > 1:4020327/1‑150 (MQ=255) ggCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCAAGTAAGTTAcg < 2:3919234/150‑1 (MQ=255) ggCATTACTCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCAAGTAAGTTAcg < 2:2339377/150‑1 (MQ=255) ttACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCAAGTAAGTTACGCgtt > 1:4559873/1‑150 (MQ=255) tACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCAAGTAAGTTACGCgttg < 2:1469128/150‑1 (MQ=255) aCTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCAAGTAAGTTACGCgttgt < 1:4830835/150‑1 (MQ=255) cTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCAAGTAAGTTACGCgttgtt < 1:673966/150‑1 (MQ=255) tCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCAAGTAAGTTACGCGTTGttt < 2:2104061/150‑1 (MQ=255) tCGCTGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCAAGTAAGTTACGCGTTGttt < 2:4556382/150‑1 (MQ=255) cGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATTGCTTTTGCGATTGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTAAGCGCATTGTACGTCAGGCAAGTAATTTACGCGTTGtttt > 1:3733850/1‑150 (MQ=255) cGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCAAGTAAGTTACGCGTTGtttt > 2:820794/1‑150 (MQ=255) | TATTCCGAAGACCAATACTTTCTGTAAGGTCACCGATAGCCTTGCGGTGGCGAGGAAAATGTTTCCCGGTAAGCGCAACAGCCTCGATGCGTTATGTGCTCGCTACGAAATAGATAACAGTAAACGAACGCTGCACGGGGCATTACTCGATGCCCAGATCCTTGCGGAAGTTTATCTGGCGATGACCGGTGGTCAAACGTCGATGGCTTTTGCGATGGAAGGAGAGACACAACAGCAACAAGGTGAAGCAACAATTCAGCGCATTGTACGTCAGGCAAGTAAGTTACGCGTTGTTTTTG > CP009273/232904‑233202 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |