Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,767,939 | C→T | 27.0% | Y421Y (TAC→TAT) | yfjW → | CP4‑57 prophage; putative inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,767,939 | 0 | C | T | 27.0% | 212.8 / 91.6 | 119 | Y421Y (TAC→TAT) | yfjW | CP4‑57 prophage; putative inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (54/32); new base T (16/16); total (71/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.15e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.45e-01 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CATGTTGCACCTCTATCTAGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTATCAAC > CP009273/2767790‑2768083 | cATGTTGCACCTCTATCTAGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTac > 1:1344335/1‑150 (MQ=255) cATGTTGCACCTCTATCTAGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTac > 1:1344435/1‑150 (MQ=255) cATGTTGCACCTCTATCTAGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTac < 1:3080095/150‑1 (MQ=255) cATGTTGCACCTCTATCTAGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTac > 2:1213835/1‑150 (MQ=255) cACCTCTATCTAGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATa > 1:3756687/1‑150 (MQ=255) aCCTCTATCTAGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAg > 1:524399/1‑150 (MQ=255) aCCTCTATCTAGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAg > 1:524414/1‑150 (MQ=255) aCCTCTATCTAGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAg > 2:2321109/1‑150 (MQ=255) aCCTCTATCTAGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTAAAACAATAg > 2:1652567/1‑150 (MQ=255) ctctATCTAGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGcc > 1:3235882/1‑150 (MQ=255) ctctATCTAGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGcc > 1:3238398/1‑150 (MQ=255) ctatctaGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCt < 1:3862456/150‑1 (MQ=255) cTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGtacta < 1:4628804/150‑1 (MQ=255) tGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTactact > 1:2025498/1‑150 (MQ=255) tGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTactact > 1:4477149/1‑150 (MQ=255) aaaTAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGAc > 2:4575238/1‑150 (MQ=255) aaTAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACt > 1:1559919/1‑150 (MQ=255) aTAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTg < 2:4818762/150‑1 (MQ=255) tAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGa > 2:1447456/1‑150 (MQ=255) aagaagATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGAt > 1:1621744/1‑150 (MQ=255) agaagaTGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGAtt > 2:1753233/1‑150 (MQ=255) gaagaTGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGAttt < 1:2263153/150‑1 (MQ=255) gaagaTGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGAttt < 1:2262852/150‑1 (MQ=255) gaagaTGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGAttt < 1:2970353/150‑1 (MQ=255) tgAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATaa < 1:1626880/150‑1 (MQ=255) aGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACAt > 1:1908586/1‑150 (MQ=255) gCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATa < 1:4060502/150‑1 (MQ=255) aaaTATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATAcc > 2:4609273/1‑150 (MQ=255) aaaTATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATAcc > 2:4608815/1‑150 (MQ=255) aaaTATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTAGTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATAcc > 2:4608812/1‑150 (MQ=255) atatCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAg > 1:3841183/1‑150 (MQ=255) tatCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGa > 1:272501/1‑150 (MQ=255) atCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGaa > 2:730253/1‑150 (MQ=255) ttAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGAt < 1:908287/150‑1 (MQ=255) cAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATaaaa > 1:4865966/1‑150 (MQ=255) aaTACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAata < 2:1559919/150‑1 (MQ=255) aaTACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAata > 2:2934645/1‑150 (MQ=255) aaTACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAata > 2:3089260/1‑150 (MQ=255) aaTACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAata > 2:2935630/1‑150 (MQ=255) aTACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAatat < 2:336454/150‑1 (MQ=255) aTACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAatat < 2:336089/150‑1 (MQ=255) tACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAatata < 1:4411919/150‑1 (MQ=255) cGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATatg > 2:1557813/1‑150 (MQ=255) cGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATatg > 2:1557929/1‑150 (MQ=255) tataACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGACCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTACCGTACTACTCAAGACTGATTATGCGTTCTAATAATAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATatgat > 2:4345613/1‑150 (MQ=255) taACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATAtgatga < 1:1237155/150‑1 (MQ=255) aaCATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGAc < 2:1840382/150‑1 (MQ=255) aaCATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGAc < 1:3460764/150‑1 (MQ=255) aCATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACa < 2:2261605/150‑1 (MQ=255) aCATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACa > 1:1847955/1‑150 (MQ=255) aCATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACa > 1:1849370/1‑150 (MQ=255) tAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAg > 1:854307/1‑150 (MQ=255) tAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACTTACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAg > 1:1967501/1‑150 (MQ=255) tAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAg > 1:1967140/1‑150 (MQ=255) aTGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCa > 1:1874473/1‑150 (MQ=255) aaaTTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATgg > 1:2483742/1‑150 (MQ=255) aaaTTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATgg > 1:2483688/1‑150 (MQ=255) aTTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGaa > 1:2140834/1‑150 (MQ=255) cTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAAtt > 1:4318089/1‑150 (MQ=255) cTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAAtt > 2:2096554/1‑150 (MQ=255) cTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAAtt > 2:2095482/1‑150 (MQ=255) cTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAAtt > 2:2095238/1‑150 (MQ=255) cTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAAtt > 2:1692841/1‑150 (MQ=255) cTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAAtt > 2:1694961/1‑150 (MQ=255) tAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTAt > 1:3604245/1‑150 (MQ=255) tAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTAt < 1:4343949/150‑1 (MQ=255) tAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTAt < 1:4343961/150‑1 (MQ=255) aCGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCt < 1:1472731/150‑1 (MQ=255) cGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCtt < 1:11039/150‑1 (MQ=255) cGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCtt > 2:4149960/1‑150 (MQ=255) gggTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTc < 2:1326301/150‑1 (MQ=255) gggTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTc > 1:4804463/1‑150 (MQ=255) ttttttACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACt > 1:1429878/1‑150 (MQ=255) tttttACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTg > 2:62271/1‑150 (MQ=255) tttttACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTg > 2:61073/1‑150 (MQ=255) ttttACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTga > 1:2682591/1‑150 (MQ=255) ttttACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTga > 1:2682350/1‑150 (MQ=255) tttACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTgag > 1:3723768/1‑150 (MQ=255) tttACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTgag > 2:2819183/1‑150 (MQ=255) tttACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTgag > 2:2822297/1‑150 (MQ=255) ttACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTgaga > 1:564947/1‑150 (MQ=255) tGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAAc > 1:740379/1‑150 (MQ=255) ccTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAgg < 2:3232164/150‑1 (MQ=255) tAAAACCATATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTa < 1:4625135/150‑1 (MQ=255) tAAAACCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTa < 2:2617592/150‑1 (MQ=255) tAAAACAAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTa < 1:4626099/150‑1 (MQ=255) aaaaCCAGATGATATTATTAATTATAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTAt < 2:1044559/150‑1 (MQ=255) aaaaCCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTAt < 1:1712829/150‑1 (MQ=255) atatgatATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCa < 1:4475918/148‑1 (MQ=255) atgatATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGt > 1:4248803/1‑150 (MQ=255) atgatATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGt > 1:4248089/1‑150 (MQ=255) tgatATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGtt < 2:1181040/150‑1 (MQ=255) attattAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGt > 1:2745320/1‑150 (MQ=255) ttattaATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTa < 2:3756687/150‑1 (MQ=255) tattaATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTAt > 2:2361824/1‑150 (MQ=255) ttaattaTAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTATCa < 1:1618322/150‑1 (MQ=255) ttaattaCAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTATCa < 2:4366688/150‑1 (MQ=255) ttaattaCAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTATCa < 2:4368148/150‑1 (MQ=255) aattaCAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTATCAAc > 2:3308194/1‑150 (MQ=255) aattaCAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTATCAAc < 1:2757947/150‑1 (MQ=255) | CATGTTGCACCTCTATCTAGGCTTGATAAAAATAAGAAGATGAAGTGTGAATACCAGCAAATATCGGATTTAACAAATACGTATAACATTAATGCAAATTACTTAACGGGTTTTTTACTTGTCCTAAAACCAGATGATATTATTAATTACAACAATAGCCCTTCCGTACTACTCAAGACTGATTTTGCGTTCTATAAAAAAACATACCAGAAGCTTGATAAAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTATCAAC > CP009273/2767790‑2768083 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |