| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 21,046 | G→T | 17.2% | A11A (GCC→GCA) | rpsT ← | 30S ribosomal subunit protein S20 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 21,046 | 0 | G | T | 17.2% | 815.4 / 115.1 | 268 | A11A (GCC→GCA) | rpsT | 30S ribosomal subunit protein S20 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (106/115); new base T (20/27); total (126/142) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
ACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCG > CP009273/20899‑21195 | ggTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGgcgc > 2:1522/1‑150 (MQ=255) ggTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGgcgc > 2:2425901/1‑150 (MQ=255) ggTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGgcgc > 2:1435641/1‑150 (MQ=255) gTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGgcgcg < 1:1704134/150‑1 (MQ=255) ccACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGct < 2:2347152/150‑1 (MQ=255) cGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGcttct > 1:4230843/1‑150 (MQ=255) aTCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTa < 1:1394395/150‑1 (MQ=255) cGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGc < 1:2440218/150‑1 (MQ=255) cGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGc > 1:2775334/1‑150 (MQ=255) ggTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCt > 2:3042557/1‑150 (MQ=255) tGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGAt < 2:3764802/150‑1 (MQ=255) aTTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTg < 2:1816080/150‑1 (MQ=255) tttCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGa > 1:873141/1‑150 (MQ=255) ttCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGat < 1:3630811/150‑1 (MQ=255) cGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGatat > 1:2267967/1‑150 (MQ=255) ttAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTa > 2:67271/1‑150 (MQ=255) tAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAg > 1:2492570/1‑150 (MQ=255) aaaTGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGc > 2:3227405/1‑150 (MQ=255) aaaTGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGc < 2:1792836/150‑1 (MQ=255) tttCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGt < 2:3942849/150‑1 (MQ=255) tCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTcc > 2:2276655/1‑150 (MQ=255) tCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTcc < 2:2073236/150‑1 (MQ=255) tCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGAATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTcc > 2:1463680/1‑150 (MQ=255) cTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCa < 1:3504996/150‑1 (MQ=255) gcTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAAt > 2:1640915/1‑150 (MQ=255) cTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAAtg < 2:3125074/150‑1 (MQ=255) ttGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAAtgtg < 1:2619721/150‑1 (MQ=255) ttGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAAtgtg > 1:1125908/1‑150 (MQ=255) ttGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAAtgtg < 1:399110/150‑1 (MQ=255) ttGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAAtgtg > 1:1125459/1‑150 (MQ=255) ttGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAAtgtg < 1:3378613/150‑1 (MQ=255) tGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATgtgt > 2:3857656/1‑150 (MQ=255) gTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGtt < 1:3746077/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTc > 2:3168977/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTc > 1:57580/1‑150 (MQ=255) gCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAACGTGTTCta > 1:2715839/1‑150 (MQ=255) cAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCtata > 2:904747/1‑150 (MQ=255) cTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATgg < 2:2845083/150‑1 (MQ=255) cGATAGCTGCTTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACa < 1:1431882/150‑1 (MQ=255) cGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACa < 1:3891948/150‑1 (MQ=255) gATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACaa > 2:1076514/1‑150 (MQ=255) tAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAAtt > 1:2511063/1‑150 (MQ=255) aGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTc > 1:3874305/1‑150 (MQ=255) gCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCa < 2:2306630/150‑1 (MQ=255) gCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCa < 2:4319392/150‑1 (MQ=255) tGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCaaa < 2:1509502/150‑1 (MQ=255) cGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAgg > 2:3288892/1‑150 (MQ=255) taCTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGa < 2:3797137/150‑1 (MQ=255) taCTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGa > 1:1648041/1‑150 (MQ=255) tCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAat < 2:3672938/150‑1 (MQ=255) cTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAata < 1:2903430/150‑1 (MQ=255) cTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAata > 1:2972229/1‑150 (MQ=255) ttGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAatat < 1:4836137/150‑1 (MQ=255) tgatgaAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATg > 1:4448939/1‑150 (MQ=255) tgatgaAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATg < 1:1246045/150‑1 (MQ=255) atgaAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGcc > 1:3792998/1‑150 (MQ=255) atgaAAGTACGCATCAGAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGcc < 1:1684194/150‑1 (MQ=255) gaAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCt < 2:2048814/150‑1 (MQ=255) aGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCtttt < 2:2399167/150‑1 (MQ=255) aGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCtttt < 1:1464376/150‑1 (MQ=255) aGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCtttt < 1:4089827/150‑1 (MQ=255) aGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCtttt < 1:4090138/150‑1 (MQ=255) gCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCct < 2:627418/150‑1 (MQ=255) gCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCct < 1:4120569/150‑1 (MQ=255) catcatAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCctt < 2:3895180/150‑1 (MQ=255) catcatAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCctt < 2:515678/150‑1 (MQ=255) atcatAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCcttc > 1:2106869/1‑150 (MQ=255) tcatAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCcttct > 2:4470588/1‑150 (MQ=255) atAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCttt > 2:260341/1‑150 (MQ=255) agagCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTg > 1:114851/1‑150 (MQ=255) gagCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGt < 1:1992802/150‑1 (MQ=255) gagCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGt < 1:4559692/150‑1 (MQ=255) cGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCaa > 1:1885810/1‑150 (MQ=255) gACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAAt > 2:4847979/1‑150 (MQ=255) gACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAAt < 2:414408/150‑1 (MQ=255) aCGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATg < 2:764854/150‑1 (MQ=255) ggCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGa < 1:111346/150‑1 (MQ=255) ggCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGa < 2:4024834/150‑1 (MQ=255) gCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGAt < 1:2862194/150‑1 (MQ=255) ttGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGAttt < 1:1945129/150‑1 (MQ=255) tGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTtg < 2:695628/150‑1 (MQ=255) gTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGc > 2:2260879/1‑150 (MQ=255) ttGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCa < 2:4114401/150‑1 (MQ=255) tACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAgc > 2:4657373/1‑150 (MQ=255) aCGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAgcg < 1:1522/150‑1 (MQ=255) aCGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAgcg < 1:2425901/150‑1 (MQ=255) gAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAATGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGcc < 2:2121568/150‑1 (MQ=255) aGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCg > 1:2401210/1‑150 (MQ=255) ccTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGtt < 2:3528530/150‑1 (MQ=255) ttttCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTaa > 2:69086/1‑150 (MQ=255) ttCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTATATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTAAATGGATTTGTGAAAATAAGCGCCGTTAAtg < 1:3261039/150‑1 (MQ=255) tCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAAtgt < 1:489437/150‑1 (MQ=255) cAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAAtgtg > 1:2252584/1‑150 (MQ=255) cAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAAtgtg > 1:2252632/1‑150 (MQ=255) aGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGc > 2:421391/1‑150 (MQ=255) aCTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCg > 1:3044662/1‑150 (MQ=255) tGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGc > 1:3314965/1‑150 (MQ=255) gAATTGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCa > 2:3838335/1‑150 (MQ=255) aaTGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCAc > 1:4774238/1‑150 (MQ=255) tGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCACATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTc < 2:4231777/150‑1 (MQ=255) | ACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCG > CP009273/20899‑21195 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |