Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,927,164 | 0 | C | T | 17.9% | 423.8 / 75.2 | 168 | intergenic (‑117/‑430) | fucA/fucP | L‑fuculose‑1‑phosphate aldolase/L‑fucose transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (52/85); new base T (15/15); total (67/101) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.04e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
AATAATCTGACGAGCAAGTTTATTTCGTTCCATTAGCTACCTCTCTCTGATTCAAAACAGGGCAATAATGTTGTTCCTTTCACACTATTGAATTAGCCGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTTATATTTTGTGACCTGGTTCAACTAATCACAGTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACA > CP009273/2927015‑2927313 | aataatCTGACGAGCAAGTTTATTTCGTTCCATTAGCTACCTCTCTCTGATTCAAAACAGGGCAATAATGTTGTTCCTTTCACACTATTGAATTAGCCGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGc < 1:177958/150‑1 (MQ=255) atCTGACGAGCAAGTTTATTTCGTTCCATTAGCTACCTCTCTCTGATTCAAAACAGGGCAATAATGTTGTTCCTTTCACACTATTGAATTAGCCGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGCTtat < 2:2734510/150‑1 (MQ=255) cTGACGAGCAAGTTTATTTCGTTCCATTAGCTACCTCTCTCTGATTCAAAACAGGGCAATAATGTTGTTCCTTTCACACTATTGAATTAGCCGTTTAATTACCCACCATCTTCTTCCTGATTAACAAGAAAGAAATTCACAAGTTTatat < 1:133906/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |