| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,993,699 | C→A | 59.0% | intergenic (‑449/‑5) | ygeR ← / → xdhA | LysM domain‑containing M23 family putative peptidase; septation lipoprotein/xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,993,699 | 0 | C | A | 59.0% | 121.6 / inf | 266 | intergenic (‑449/‑5) | ygeR/xdhA | LysM domain‑containing M23 family putative peptidase; septation lipoprotein/xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (56/53); new base A (92/65); total (148/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
ACGTCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCCAG > CP009273/2993550‑2993846 | aCGTCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTATGGCGTAAATATTTCCTGCTTAGACTAAATATTTTCCATAAGAAACAAATGTTCAAATCGCGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATc > 1:2720183/1‑150 (MQ=255) gTCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGGAAATCTTGCCTGCGTAGACGAAATCTTTGCCATAAGAACCCAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTCTGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGaataat > 2:3488574/1‑150 (MQ=255) tcatcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCCAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGACGCAACCGCTACGGGTGAATaatg > 1:1861534/1‑150 (MQ=255) catcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATcatgc < 1:3220567/150‑1 (MQ=255) catcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTATGGGGTAAATCTTTGCTGCTTAGACTAAATATTTGCCAAAATAAACAAATGTTAAAAACGGGGGGTTTTCTATTGTAGCGCGGGGAGCAACCCCAACGGGTGTATcatgc > 1:4511269/1‑150 (MQ=255) cacaCTTCCTACCTCCCCTAACGCGTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgcatg < 2:4432577/150‑1 (MQ=255) cacTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATATTGCCTGCGTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCCAATGTTAAAATAGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCTCTAAGGGGGTATAATGCAGgcg > 2:225011/1‑150 (MQ=255) tCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTc < 2:2046909/150‑1 (MQ=255) ccTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCg > 2:3096883/1‑150 (MQ=255) cTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATTTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGcc < 2:4024684/150‑1 (MQ=255) cccTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGACGATGCCAtt < 2:2866250/150‑1 (MQ=255) cTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTATACTAAATCTTTGCCATAAAAACCAAATGTTAAAATCGAGGGGATTTATATTGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGc > 2:484335/1‑150 (MQ=255) aaCGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTTCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCCCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTa > 1:4853440/1‑150 (MQ=255) aaCGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTAAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTa > 2:1035549/1‑150 (MQ=255) cGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAg < 1:2655470/150‑1 (MQ=255) gCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTTCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAgg > 2:3190095/1‑150 (MQ=255) gCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAgg < 2:3006693/150‑1 (MQ=255) tATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCa < 2:3542101/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcg < 1:2446094/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcg > 2:3937207/1‑150 (MQ=255) gtcgtTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgg > 2:1187654/1‑150 (MQ=255) gtTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggcg > 2:3910722/1‑150 (MQ=255) tttCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggcgg < 1:1772825/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggcggg < 1:1990209/150‑1 (MQ=255) tGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCAc > 2:137276/1‑150 (MQ=255) gCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGa < 1:1713956/150‑1 (MQ=255) cGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGat > 2:3794019/1‑150 (MQ=255) gTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGata > 1:3025544/1‑150 (MQ=255) gTAAATCTTGCCTGCTGAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGata > 2:4245665/1‑150 (MQ=255) tAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGatat > 1:964413/1‑150 (MQ=255) aaTCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATAc > 1:3075479/1‑150 (MQ=255) aaTCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATAc > 1:3253158/1‑150 (MQ=255) aaTCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATAc < 2:1763400/150‑1 (MQ=255) cTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGa > 2:1587784/1‑150 (MQ=255) cTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGa > 1:146374/1‑150 (MQ=255) ccTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAt > 1:2826734/1‑150 (MQ=255) cTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtt < 1:4035529/150‑1 (MQ=255) tGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtta < 1:1625879/150‑1 (MQ=255) tGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtta > 2:539960/1‑150 (MQ=255) tGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtta > 1:4216745/1‑150 (MQ=255) cTTAGACTAAATCTGTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatg < 2:1636755/150‑1 (MQ=255) ttAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgt < 2:2373910/150‑1 (MQ=255) aCTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgttatg > 1:1496005/1‑150 (MQ=255) tAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGc < 2:2536487/150‑1 (MQ=255) tAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGc < 1:1916119/150‑1 (MQ=255) tAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGc > 2:2115017/1‑150 (MQ=255) aaaTCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCg > 1:10603/1‑150 (MQ=255) aTCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCggg < 1:2048518/150‑1 (MQ=255) cTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTCTGTTATGGCGGGCa > 1:3847689/1‑150 (MQ=255) tGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCAtgt < 1:2374917/150‑1 (MQ=255) tGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCAtgt < 1:3910722/150‑1 (MQ=255) ccATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATgtgt > 2:218919/1‑150 (MQ=255) tAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTAt > 2:1479323/1‑150 (MQ=255) aaGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATg < 1:4858901/150‑1 (MQ=255) aaCCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGa > 1:1725826/1‑150 (MQ=255) aaCCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGa > 1:3765556/1‑150 (MQ=255) ccAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaaa < 2:4721108/150‑1 (MQ=255) cAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAat < 2:2580127/150‑1 (MQ=255) aaaTGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTCTGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAata > 2:2395144/1‑150 (MQ=255) aaaTGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAata > 1:4084823/1‑150 (MQ=255) aaTGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCGTTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAatat < 2:1273121/150‑1 (MQ=255) ttCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTAc < 2:2399380/150‑1 (MQ=255) tCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACg > 2:1850026/1‑150 (MQ=255) tCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACg > 2:2850426/1‑150 (MQ=255) aaaTCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTa > 1:1648407/1‑150 (MQ=255) tCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGcc < 2:1409573/150‑1 (MQ=255) cGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGccc > 2:1513444/1‑150 (MQ=255) gAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCt < 1:1535723/150‑1 (MQ=255) gggATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATc < 1:2924483/150‑1 (MQ=255) aTTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGca > 1:2203094/1‑150 (MQ=255) aTTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGca > 1:34946/1‑150 (MQ=255) tttCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGcac > 2:888525/1‑150 (MQ=255) tATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATgg > 2:4749015/1‑150 (MQ=255) aTGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGt < 2:2378981/150‑1 (MQ=255) gAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTAt > 1:1278948/1‑150 (MQ=255) aaGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATg > 1:2456805/1‑150 (MQ=255) aGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGc > 2:2502750/1‑150 (MQ=255) aGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGc > 2:3901431/1‑150 (MQ=255) aGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGc > 1:4555891/1‑150 (MQ=255) gcgGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGt < 1:2336751/150‑1 (MQ=255) cgGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTa < 1:3304148/150‑1 (MQ=255) gggAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTaa < 2:625964/150‑1 (MQ=255) gggAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTaa > 2:604478/1‑150 (MQ=255) gggAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTaa > 2:4784626/1‑150 (MQ=255) gggAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTaa > 2:1049398/1‑150 (MQ=255) ggAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAg > 2:4283438/1‑150 (MQ=255) gAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGt < 1:4281864/150‑1 (MQ=255) aaGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCcgtacgta > 1:4723290/1‑150 (MQ=255) gCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTAtt < 1:1815767/150‑1 (MQ=255) cAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTa < 2:947917/150‑1 (MQ=255) cAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTa < 2:1878644/150‑1 (MQ=255) cAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTa > 1:4389907/1‑150 (MQ=255) gCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatgat < 2:3319113/150‑1 (MQ=255) gCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatgat < 1:3937207/150‑1 (MQ=255) tACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAAtgatga > 2:2349221/1‑150 (MQ=255) gggTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACa < 2:2722746/150‑1 (MQ=255) gggTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACa > 1:1036371/1‑150 (MQ=255) gTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAg < 1:137276/150‑1 (MQ=255) tGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGc < 1:70251/150‑1 (MQ=255) aTCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCCAg < 2:1730001/150‑1 (MQ=255) | ACGTCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCCAG > CP009273/2993550‑2993846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |