| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,106,398 | 0 | A | C | 23.1% | 469.9 / 189.3 | 242 | intergenic (‑98/+28) | yghF/yghG | pseudogene, secretion pathway protein, C‑type protein homology;putative transport; Not classified; putative general secretion pathway for protein export (GSP)/secretin (GspDbeta) OM localization lipoprotein pilotin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (110/76); new base C (36/20); total (146/96) | |||||||||||
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Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |