| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,185,705 | G→T | 15.4% | D47Y (GAT→TAT) | yqiJ → | DUF1449 family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,185,705 | 0 | G | T | 15.4% | 664.6 / 83.2 | 213 | D47Y (GAT→TAT) | yqiJ | DUF1449 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (102/78); new base T (20/12); total (123/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 | |||||||||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
GGAGTGATATATGATTTTATTCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATC > CP009273/3185557‑3185853 | ggAGTGATATATGATTTTATTCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGa > 1:201894/1‑150 (MQ=255) aGTGATATATGATTTTATTCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGAtt > 2:2842629/1‑150 (MQ=255) gTGATATATGATTTTATTCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTc > 1:906610/1‑150 (MQ=255) tatGATTTTATTCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAAc < 1:2265868/150‑1 (MQ=255) tGATTTTATTCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACca > 1:2696763/1‑150 (MQ=255) ttATTCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGt > 2:3249638/1‑150 (MQ=255) ttATTCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGt > 1:1388585/1‑150 (MQ=255) ttATTCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGt < 1:3731265/150‑1 (MQ=255) aTTCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCa > 1:780788/1‑150 (MQ=255) aTTCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCa < 2:190630/150‑1 (MQ=255) tCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCata < 2:4549651/150‑1 (MQ=255) tCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCata > 1:4433041/1‑150 (MQ=255) cGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCatat > 1:2870539/1‑150 (MQ=255) gCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATAtt > 2:3802244/1‑150 (MQ=255) gCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATAtt < 2:2753738/150‑1 (MQ=255) gACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGc > 2:1669375/1‑150 (MQ=255) aCTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGcc > 1:1417849/1‑150 (MQ=255) aCTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGcc > 2:1281156/1‑150 (MQ=255) cTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCa < 1:1986593/150‑1 (MQ=255) tataACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAg > 1:3772472/1‑150 (MQ=255) taACACCCATTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGc < 1:2008721/150‑1 (MQ=255) aaCACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCa > 2:781357/1‑150 (MQ=255) acacCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCAc > 2:2219631/1‑150 (MQ=255) cacCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACt > 2:2761545/1‑150 (MQ=255) cccTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCa > 1:2923427/1‑150 (MQ=255) cccTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCa > 1:3242735/1‑150 (MQ=255) ccTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCAt < 1:281603/150‑1 (MQ=255) ttATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTa < 2:4638144/150‑1 (MQ=255) tATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTAt < 1:2825785/150‑1 (MQ=255) tATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTAt < 2:1787097/150‑1 (MQ=255) aTCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTAtc > 1:3445438/1‑150 (MQ=255) tCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTAtct > 1:609400/1‑150 (MQ=255) cTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTAtctc < 2:1369049/150‑1 (MQ=255) gCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATAtt > 2:3655500/1‑150 (MQ=255) gCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATAtt > 1:3164821/1‑150 (MQ=255) cTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTg < 1:1542468/150‑1 (MQ=255) cTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTg < 2:3457706/150‑1 (MQ=255) tATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTgg > 1:2878546/1‑150 (MQ=255) cTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGAtt < 1:1669375/150‑1 (MQ=255) tGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGcc > 1:401861/1‑150 (MQ=255) tGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATATGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGcc < 1:2504505/150‑1 (MQ=255) gTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCa < 1:4034194/150‑1 (MQ=255) gTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCa > 1:2115819/1‑150 (MQ=255) tACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAg < 2:2892446/150‑1 (MQ=255) cTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGACGATTGCCAGct < 1:1068339/150‑1 (MQ=255) cTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGct > 2:3845375/1‑150 (MQ=255) tGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGctc > 1:4833635/1‑150 (MQ=255) gTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGctct < 2:4332807/150‑1 (MQ=255) gATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCCGCTCtcgt > 1:4610912/1‑150 (MQ=255) gATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCtcgt > 1:2126975/1‑150 (MQ=255) gATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGACACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCtcgt > 2:3756008/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCtcgtc > 1:2986789/1‑150 (MQ=255) cGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTcgtcgt < 1:177162/150‑1 (MQ=255) gCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTGATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTtc < 1:4128677/150‑1 (MQ=255) tGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCTGCTCTCGTCGTTctct < 2:1434095/150‑1 (MQ=255) gTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTg > 2:413661/1‑150 (MQ=255) tAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCt > 1:3102636/1‑150 (MQ=255) gAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTa < 1:1620646/150‑1 (MQ=255) aaaTTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTAc > 2:1977151/1‑150 (MQ=255) aaTTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTAct > 2:2060797/1‑150 (MQ=255) aaTTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTAct < 1:742278/150‑1 (MQ=255) aTTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTActg > 1:1893652/1‑150 (MQ=255) aTTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTActg < 1:2746176/150‑1 (MQ=255) tttGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTActggct > 2:2160506/1‑150 (MQ=255) cgcTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGtt < 2:4464093/150‑1 (MQ=255) cTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGtttt < 2:3217304/150‑1 (MQ=255) tATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGtttttt > 2:2866245/1‑150 (MQ=255) cTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCACTATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTgg < 2:2870539/150‑1 (MQ=255) tGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGt < 2:2603796/150‑1 (MQ=255) cGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCt > 2:2455125/1‑150 (MQ=255) ggTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTTGTCtt > 1:84117/1‑150 (MQ=255) ggTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCtt < 2:905437/150‑1 (MQ=255) ggTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCtt > 2:1052318/1‑150 (MQ=255) gTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTa < 1:1147400/150‑1 (MQ=255) tCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTAt > 1:2400874/1‑150 (MQ=255) tCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTAt > 2:4506051/1‑150 (MQ=255) tCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTAt > 1:2401111/1‑150 (MQ=255) caTGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTgg > 1:1103164/1‑150 (MQ=255) ctctCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTAtt > 1:1866338/1‑144 (MQ=255) ctctCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATc < 1:3945077/150‑1 (MQ=255) ctctCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATc > 2:2115193/1‑150 (MQ=255) tctcCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATcc < 1:4711591/150‑1 (MQ=255) ctcCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCt < 2:1482985/150‑1 (MQ=255) ggTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTg < 1:535096/150‑1 (MQ=255) ctctTGATGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTgcagc > 2:3077445/1‑150 (MQ=255) ctctTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTgcagc > 2:2345099/1‑150 (MQ=255) tGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTTGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATga > 1:2640716/1‑149 (MQ=255) aTGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTAATGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTTGCATCATGTTTCATCATGcca > 1:2536098/1‑149 (MQ=255) tGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTg > 2:4048488/1‑150 (MQ=255) tGCACATCTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTg > 2:590886/1‑150 (MQ=255) cacaTCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGca < 1:3446274/150‑1 (MQ=255) acaTCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGcat > 2:2778394/1‑150 (MQ=255) aTCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCATCATGCCTGcatca > 1:603110/1‑150 (MQ=255) cTTGACCATTATTATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATg > 2:2508459/1‑150 (MQ=255) tGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGt > 1:3792827/1‑150 (MQ=255) tGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGt > 2:1907150/1‑150 (MQ=255) ccATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTg < 1:3685165/150‑1 (MQ=255) ccATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTg < 2:113384/150‑1 (MQ=255) tATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCaa < 2:3046133/150‑1 (MQ=255) tGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATc > 2:3145921/1‑150 (MQ=255) | GGAGTGATATATGATTTTATTCGCCGACTATAACACCCCTTATCTTTTCGCTATTTCCTTTGTACTGTTGATCGGCCTGTTAGAAATTTTTGCGCTTATCTGCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCTGGTTTTTTTGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATC > CP009273/3185557‑3185853 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |