| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 267,806 | 0 | G | T | 15.9% | 1190.5 / 147.6 | 377 | pseudogene (332/426 nt) | insN | pseudogene, IS911 transposase A;IS, phage, Tn; Transposon‑related functions; extrachromosomal; transposon related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (144/172); new base T (35/26); total (179/198) | |||||||||||
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Only 100 of 378 total aligned reads displayed.
GCATGGCATCAGCCACGGCTCTGCCGGAGCAAGAAGCATCGCCACAATGGCAACCCAGAGAGGATACCAGATGGGGCGCTGGCTTGCTGGCAGACTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGTTGCCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAGCGTGGCGGTCATGAGCACGTTGCTATCCCGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATAGTGTGCCCGGAGTTCAGGGCGGGCATGGATGCTTAAATGAACCGCGAGTCTGT > CP009273/267657‑267954 | cATGGCATCAGCCACGGCTCTGCCGGAGCAAGAAGCATCGCCACAATGGCAACCCAGAGAGGATACCAGATGGGGCGCTGGCTTGCTGGCAGACTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGTTGCCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAGCGt < 1:1578599/150‑1 (MQ=255) gCATCAGCCACGGCTCTGCCGGAGCAAGAAGCATCGCCACAATGGCAACCCAGAGAGGATACCAGATGGGGCGCTGGCTTGCTGGCAGACTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGTTGCCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAGCGTGGCg < 1:4076136/150‑1 (MQ=255) cATCAGCCACGGCTCTGCCGGAGCAAGAAGCATCGCCACAATGGCAACCCAGAGAGGATACCAGATGGGGCGCTGGCTTGCTGGCAGACTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGTTGCCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAGCGTGGCgg > 1:719659/1‑150 (MQ=255) 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cGTGGCGGTCATGAGCACGTTGCTATCCCGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATAGTGTGCCCGGAGTTCAGGGCGGGCATGGATGCTTAAATGAACCGCGAgtctgt > 1:2448189/1‑150 (MQ=255) cGTGGCGGTCATGAGCACGTTGCTATCCCGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATAGTGTGCCCGGAGTTCAGGGCGGGCATGGATGCTTAAATGAACCGCGAgtctgt > 1:1258391/1‑150 (MQ=255) | GCATGGCATCAGCCACGGCTCTGCCGGAGCAAGAAGCATCGCCACAATGGCAACCCAGAGAGGATACCAGATGGGGCGCTGGCTTGCTGGCAGACTCATGAAAGAGCTGGGGCTGGTCAGTTGCCAGCAGCCGACTCACCGGTATAAGCGTGGCGGTCATGAGCACGTTGCTATCCCGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACCTATAGTGTGCCCGGAGTTCAGGGCGGGCATGGATGCTTAAATGAACCGCGAGTCTGT > CP009273/267657‑267954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |