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| * | CP009273 | 268,570 | 0 | G | T | 22.1% | 1034.5 / 243.5 | 394 | pseudogene (13/1108 nt) | ykfC | CP4‑6 prophage; conserved protein;Phage or Prophage Related |
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Only 100 of 397 total aligned reads displayed.
GGGCATGGCTCCGATGACGCGCTGGCTGGCGGAGCTTCCGTAGTAGTCCGCGATGGGGAAAGCCCATTACATGGCGAAGGGAAGCAGTTTGAATGTGTTTGCGACGTGAATTAACTGACCTAACGAGGTGAAGACCTTTGATAATCAGCGAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATACCCCCGGCGTTGAT > CP009273/268421‑268719 | cATGGCTCCGATGACGCGCTGGCTGGCGGAGCTTCCGTAGTAGTCCGCGATGGGGAAAGCCCATTACATGGCGAAGGGAAGCAGTTTGAATGTGTTTGCGACGTGAATTAACTGACCTAACGAGGTGAAGACCTTTGATAATCAGCTaaa < 2:367904/150‑1 (MQ=255) aTGGCTCCGATGACGCGCTGGCTGGCGGAGCTTCCGTAGTAGTCCGCGATGGGGAAAGCCCATTACATGGCGAAGGGAAGCAGTTTGAATGTGTTTGCGACGTGAATTAACTGACCTAACGAGGTGAAGACCTTTGATAATCAGCGAAAt < 1:1082463/150‑1 (MQ=255) tGGCTCCGATGACGCGCTGGCTGGCGGAGCTTCCGTAGTAGTCCGCGATGGGGAAAGCCCATTACATGGCGAAGGGAAGCAGTTTGAATGTGTTTGCGACGTGAATTAACTGACCTAACGAGGTGAAGACCTTTGATAATCAGCTAAATg < 2:2360702/150‑1 (MQ=255) 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aCCTTTGATAATCAGCGAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCa < 2:3984947/150‑1 (MQ=255) ccTTTGATATTCAGCGAAATGCAACGCTAGCTTGCCACATGGTCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTATGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCAt < 1:2247060/150‑1 (MQ=255) cTTTGATAATCAGCTAAATGCAACGCAAGCTTGCCACAGGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATa < 2:1679911/150‑1 (MQ=255) cTTTGATAATCAGCGAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATa < 1:1430350/150‑1 (MQ=255) tttGATAATCAGCTAAATGCAACACAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATAc > 1:234404/1‑150 (MQ=255) tttGATAATCAGCGAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATAc < 1:3363829/150‑1 (MQ=255) tGATAATCAGCTAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATAccc > 2:714040/1‑150 (MQ=255) tGATAATCAGCGAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATAccc > 1:869787/1‑150 (MQ=255) aTAATCAGCTAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATAccccc < 2:813950/150‑1 (MQ=255) tAATCAGCGAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATACCCCCg > 2:526751/1‑150 (MQ=255) aaTCAGCGAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATACCCCCgg > 2:225840/1‑150 (MQ=255) cAGCGAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATCCCCCCGGCGt > 2:2916112/1‑150 (MQ=255) cAGCGAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATACCCCCGGCGt > 2:4356315/1‑150 (MQ=255) cAGCGAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATACCCCCGGCGt < 1:2554826/150‑1 (MQ=255) cGAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATACCCCCGGCGTTGa < 2:2682311/150‑1 (MQ=255) gAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATACCCCCGGCGTTGAt < 2:918213/150‑1 (MQ=255) gAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATACCCCCGGCGTTGAt < 2:3530966/150‑1 (MQ=255) | GGGCATGGCTCCGATGACGCGCTGGCTGGCGGAGCTTCCGTAGTAGTCCGCGATGGGGAAAGCCCATTACATGGCGAAGGGAAGCAGTTTGAATGTGTTTGCGACGTGAATTAACTGACCTAACGAGGTGAAGACCTTTGATAATCAGCGAAATGCAACGCAAGCTTGCCACATGGGCAGCCACCGATCCGTCCCTACGGATTCAACGGCTGCTGCGTCTGATAACACAACCAGAATGGCTGGCTGAAGCGGCGCGGATCACGCTTTCATCAAAGGGGGCCCATACCCCCGGCGTTGAT > CP009273/268421‑268719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |