| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,902,982 | C→A | 23.0% | S259S (TCG→TCT) | pstC ← | phosphate transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,902,982 | 0 | C | A | 23.0% | 818.2 / 209.1 | 321 | S259S (TCG→TCT) | pstC | phosphate transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (122/125); new base A (42/32); total (164/157) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
ATCATAAACTTCGATGCGGCGAGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATAACTTCCCAGGTG > CP009273/3902833‑3903129 | aTCATAAACTTCGATGCGGCGAGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCACTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGc > 2:2081376/1‑150 (MQ=255) aaCTTCGATGCGGCGAGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGgcg > 1:2512432/1‑150 (MQ=255) aCTTCGATGCGGCGAGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGgcgc > 2:3794928/1‑150 (MQ=255) tCGATGCGGCGAGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGt < 1:3867806/150‑1 (MQ=255) cGATGCGGCGAGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTc < 1:475712/150‑1 (MQ=255) aTGCGGCGAGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGa > 1:3785980/1‑150 (MQ=255) aTGCGGCGAGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGa > 2:1371311/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGAGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAg > 2:514273/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGAGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAg < 1:4415171/150‑1 (MQ=255) ggcgAGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTg > 2:3991003/1‑150 (MQ=255) cgAGGACGATGAAGGTAATCACACCCAGGATCAGGCCCAGGTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGt < 2:174051/150‑1 (MQ=255) aGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAg < 1:1820886/150‑1 (MQ=255) aGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAg < 2:691690/150‑1 (MQ=255) aCGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGgtg > 1:131093/1‑150 (MQ=255) aCGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGgtg > 2:2429393/1‑150 (MQ=255) gATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGtt > 2:1463254/1‑150 (MQ=255) aTGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTa < 1:3832865/150‑1 (MQ=255) tGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTAc > 2:289913/1‑150 (MQ=255) aaGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCg > 2:305946/1‑150 (MQ=255) ggTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCgat < 1:4267980/150‑1 (MQ=255) gTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCgatg < 2:2066278/150‑1 (MQ=255) acaAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAg < 2:2367899/150‑1 (MQ=255) acaAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAg < 1:1118333/150‑1 (MQ=255) cAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCAc > 1:2329512/1‑150 (MQ=255) ggATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCg > 2:4497156/1‑150 (MQ=255) gATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGc > 1:2111832/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGcc > 1:368579/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGcc > 1:369437/1‑150 (MQ=255) aGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATg > 2:4059584/1‑150 (MQ=255) ggCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATgg < 1:3933728/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGttt < 1:3311020/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGttt < 2:2688505/150‑1 (MQ=255) cAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTc < 2:3405696/150‑1 (MQ=255) cAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTc < 1:797663/150‑1 (MQ=255) gTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCAc < 2:1983206/150‑1 (MQ=255) ttCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCAcc < 2:1975818/150‑1 (MQ=255) ccATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGa > 1:1065182/1‑150 (MQ=255) cATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAg > 1:2768679/1‑150 (MQ=255) cATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAg < 1:1438126/150‑1 (MQ=255) aGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAgcgcg > 1:2649177/1‑150 (MQ=255) ggCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGcc > 2:56966/1‑150 (MQ=255) cAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGccca < 1:4493776/150‑1 (MQ=255) aaCGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGcccag > 1:4737196/1‑150 (MQ=255) gTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGcccagccc > 1:2231686/1‑150 (MQ=255) gCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGcccagcccca > 1:3487572/1‑150 (MQ=255) aGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGcccagccccagc > 2:1492275/1‑150 (MQ=255) aCCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCat > 2:4430692/1‑150 (MQ=255) aCCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCat < 1:493237/150‑1 (MQ=255) ccGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCatg < 1:1142794/150‑1 (MQ=255) cGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCatga < 1:3119357/150‑1 (MQ=255) cGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCatga < 1:687898/150‑1 (MQ=255) ggATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCatgat < 1:2057783/150‑1 (MQ=255) ttccgcttccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATgcc < 2:1663688/150‑1 (MQ=255) ttccgcttccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATgcc > 2:1241073/1‑150 (MQ=255) ttccgcttccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATgcc < 2:2803231/150‑1 (MQ=255) tccgcttccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATgccg < 2:1042918/150‑1 (MQ=255) tccgcttccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATgccg < 2:3898043/150‑1 (MQ=255) tccgcttccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATgccg < 1:1607823/150‑1 (MQ=255) tccgcttccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACAGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATgccg > 1:2989715/1‑150 (MQ=255) ccgcttccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATgccgc > 2:1422780/1‑150 (MQ=255) cgcttccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATgccgcc < 2:1177904/150‑1 (MQ=255) cgcttccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATgccgcc < 1:3560608/150‑1 (MQ=255) tccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATa > 2:2653677/1‑150 (MQ=255) tccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATa < 1:289913/150‑1 (MQ=255) ccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCAGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATaa > 2:1096807/1‑150 (MQ=255) ccgcAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATaa > 1:1269520/1‑150 (MQ=255) aaaTTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACAcc < 1:1745585/150‑1 (MQ=255) ttcgttcgCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCAtt < 2:3163542/150‑1 (MQ=255) tcgttcgCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCAttt < 1:3021880/150‑1 (MQ=255) cgttcgCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCAtttt > 1:467490/1‑150 (MQ=255) cgttcgCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGAGAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCAtttt > 2:777148/1‑150 (MQ=255) tcgCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTgg > 1:3457975/1‑150 (MQ=255) tcgCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTgg > 1:83413/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTg > 1:4086270/1‑150 (MQ=255) aGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAAc > 1:3380917/1‑150 (MQ=255) cgcAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACgg < 1:153196/150‑1 (MQ=255) cgcAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACgg < 1:2712974/150‑1 (MQ=255) agagGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGgaag > 1:4162306/1‑150 (MQ=255) agGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGgaagaa > 1:605074/1‑150 (MQ=255) ggTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAAc > 1:3987849/1‑150 (MQ=255) gTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACg < 2:2033174/150‑1 (MQ=255) gATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGAt < 1:1482334/150‑1 (MQ=255) gATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGAt < 1:3653582/150‑1 (MQ=255) gATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGAt < 2:3690307/150‑1 (MQ=255) gATACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGAt < 2:1635211/150‑1 (MQ=255) tACTGTTGCCCGGCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATAc < 2:4487723/150‑1 (MQ=255) tGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGcc < 2:4768652/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAg < 2:2234481/150‑1 (MQ=255) cccGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATa < 2:1490235/150‑1 (MQ=255) cGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATAAc < 1:90287/150‑1 (MQ=255) cGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATAAc > 2:4357345/1‑150 (MQ=255) ggCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATAACt > 2:3950795/1‑150 (MQ=255) ggCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATAACt < 2:2329512/150‑1 (MQ=255) gCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATAACtt < 2:3631695/150‑1 (MQ=255) gCATATACAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATAACtt > 2:2921641/1‑150 (MQ=255) cATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATAACTTc > 2:3580222/1‑150 (MQ=255) cATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATAACTTc < 2:1699836/150‑1 (MQ=255) atatACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATAACTTcc > 2:2581792/1‑150 (MQ=255) tataCAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATAACTTccc > 2:4091933/1‑150 (MQ=255) taCAGAGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATAACTTCCCAg < 2:1034360/150‑1 (MQ=255) | ATCATAAACTTCGATGCGGCGAGGACGATGAAGGTAATCACAAACAGGATCAGGCCCAGTTCCATCAGTGCGGCAACGTGCAGACCGGATTCCGCTTCCGCAAATTCGTTCGCCAGCGCAGAGGTGATACTGTTGCCCGGCATATACAGCGAGGCGCTGTCGAGCTGGTAGGTGTTACCGATGATAAAGGTCACCGCCATGGTTTCACCGAGCGCGCGGCCCAGCCCCAGCATGATGCCGCCGATAACACCATTTTTGGTGAACGGAAGAACGATACGCCAGATAACTTCCCAGGTG > CP009273/3902833‑3903129 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |