| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,915,397 | A→C | 27.4% | N5K (AAT→AAG) | atpB ← | F0 sector of membrane‑bound ATP synthase, subunit a |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,915,397 | 0 | A | C | 27.4% | 528.9 / 304.6 | 328 | N5K (AAT→AAG) | atpB | F0 sector of membrane‑bound ATP synthase, subunit a |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (122/116); new base C (52/38); total (174/154) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 340 total aligned reads displayed.
AACAGACCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAACACCAACATC > CP009273/3915248‑3915546 | ccgACCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGAGTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCtt < 2:3386805/148‑1 (MQ=255) aGACCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCttt < 2:498249/150‑1 (MQ=255) aGACCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATAttt > 1:1437479/1‑150 (MQ=255) cccAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCt < 2:2614299/150‑1 (MQ=255) cccAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCt > 2:2373397/1‑150 (MQ=255) ccAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTg < 2:810692/150‑1 (MQ=255) gCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAg < 1:2984340/150‑1 (MQ=255) caccacCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGTAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGc > 2:4208877/1‑150 (MQ=255) accaccGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGcc > 2:1990692/1‑150 (MQ=255) ccaccGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCa < 2:4773027/150‑1 (MQ=255) ccaacGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCCGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATACTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCa > 2:1251876/1‑150 (MQ=255) caccGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCat < 2:3460867/150‑1 (MQ=255) caccGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCat < 1:2534572/150‑1 (MQ=255) ccGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCatga > 1:1577013/1‑150 (MQ=255) agaagaACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGc > 2:1680354/1‑150 (MQ=255) agaagaACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGc > 2:3854192/1‑150 (MQ=255) agaagaACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGc > 2:295887/1‑150 (MQ=255) aagaaCATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCt > 2:3890749/1‑150 (MQ=255) gaaCATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCttt < 1:3481300/150‑1 (MQ=255) gaaCATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCttt < 1:1029571/150‑1 (MQ=255) gaaCATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCttt < 1:1951914/150‑1 (MQ=255) aCATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTa < 1:3890540/150‑1 (MQ=255) aCATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTa < 1:1126085/150‑1 (MQ=255) aTGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTAcc > 2:4498839/1‑150 (MQ=255) ggAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCt < 2:3466098/150‑1 (MQ=255) ggAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCt < 2:697340/150‑1 (MQ=255) gAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCtt > 2:1234981/1‑150 (MQ=255) aGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCttt > 1:2909144/1‑150 (MQ=255) gTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTttg < 2:3686994/150‑1 (MQ=255) gTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTttg > 2:2630434/1‑150 (MQ=255) gTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTttg < 1:3035468/150‑1 (MQ=255) cAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTttgtt > 2:4398286/1‑150 (MQ=255) aaTATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTttgttg < 1:2021799/150‑1 (MQ=255) aaTATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTttgttg > 1:614939/1‑150 (MQ=255) attgattgTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTa > 1:3428694/1‑150 (MQ=255) tgattgTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAAt < 2:1343979/150‑1 (MQ=255) tgattgTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTGAAt > 1:4492700/1‑150 (MQ=255) ttgTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTAc > 2:3304828/1‑150 (MQ=255) ttgTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTAc < 1:4044635/150‑1 (MQ=255) gTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAg > 2:2893440/1‑150 (MQ=255) gTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAg < 2:4445311/150‑1 (MQ=255) tCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGc < 1:2469848/150‑1 (MQ=255) cAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCg > 1:2231224/1‑150 (MQ=255) aGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCgg > 2:3089585/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGt > 1:3844639/1‑150 (MQ=255) aaGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTg > 2:4681194/1‑150 (MQ=255) ggTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGcc < 2:1799543/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGt < 2:3158153/150‑1 (MQ=255) gCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTa < 2:2332740/150‑1 (MQ=255) ggTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAac > 1:2732636/1‑150 (MQ=255) gTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAacc < 1:3313949/150‑1 (MQ=255) ttGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAaccacc > 1:4077926/1‑150 (MQ=255) ggATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCa < 2:2784956/150‑1 (MQ=255) gATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCAc > 2:355579/1‑150 (MQ=255) tCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCa > 1:2586954/1‑150 (MQ=255) aGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAAccc > 1:1773708/1‑150 (MQ=255) gCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCa < 1:3542508/150‑1 (MQ=255) cGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCAc < 2:4026199/150‑1 (MQ=255) cGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCAc < 2:2826866/150‑1 (MQ=255) gagaATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACg > 1:2386369/1‑150 (MQ=255) gagaATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACg > 2:4617360/1‑150 (MQ=255) gagaATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACg > 2:2719621/1‑150 (MQ=255) agaATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGt > 1:4513797/1‑150 (MQ=255) agaATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGt < 1:321730/150‑1 (MQ=255) aTGTACGTAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAAc < 1:4208877/150‑1 (MQ=255) aTGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAAc < 2:1050829/150‑1 (MQ=255) tACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGAt < 1:2040675/150‑1 (MQ=255) cGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCa > 2:2462160/1‑150 (MQ=255) aGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCg > 1:181227/1‑150 (MQ=255) ggTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCgg < 2:242362/150‑1 (MQ=255) cAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAg > 1:81191/1‑150 (MQ=255) tGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATa < 2:3698491/150‑1 (MQ=255) tGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATa > 1:2917123/1‑150 (MQ=255) aGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCg > 2:2062348/1‑150 (MQ=255) gTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGcc > 1:992380/1‑150 (MQ=255) ttATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCt > 1:1179726/1‑150 (MQ=255) tATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCCGTATCTGAACCACCCGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCtt > 1:10068/1‑150 (MQ=255) tATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCtt > 1:395867/1‑150 (MQ=255) tATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCtt < 2:4664742/150‑1 (MQ=255) ttCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTa > 2:3321231/1‑150 (MQ=255) tCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTaa < 1:872683/150‑1 (MQ=255) gtggtgTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAAcc < 1:4681194/150‑1 (MQ=255) gtggtgTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAAcc < 2:59706/150‑1 (MQ=255) tggtgTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCg > 1:2860701/1‑150 (MQ=255) tggtgTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCg < 2:3075283/150‑1 (MQ=255) gtgtCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCTcc > 2:3210362/1‑150 (MQ=255) gtgtCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGcc > 2:688888/1‑150 (MQ=255) tCCTATGTAAGCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAAc < 2:4644916/150‑1 (MQ=255) ccTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACg > 1:541581/1‑150 (MQ=255) aTGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGcca < 2:1534293/150‑1 (MQ=255) aaTCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGccaccac > 2:951049/1‑150 (MQ=255) tCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGccaccacca > 2:2360689/1‑150 (MQ=255) gcggcgTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTaa > 1:4868279/1‑150 (MQ=255) ggcgTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAaca < 1:923061/150‑1 (MQ=255) gcgTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAacac < 1:217843/150‑1 (MQ=255) cgTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAACAcc < 2:159052/150‑1 (MQ=255) gTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAACACCa < 2:1102048/150‑1 (MQ=255) cATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAACACCAAc > 1:2712530/1‑150 (MQ=255) cATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTGAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAACACCAAc < 2:4288279/150‑1 (MQ=255) tatTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAACACCAACAt > 1:1893743/1‑150 (MQ=255) | AACAGACCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAACACCAACATC > CP009273/3915248‑3915546 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |