| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,995,906 | G→T | 23.5% | S85Y (TCT→TAT) | yigF ← | putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,995,906 | 0 | G | T | 23.5% | 497.4 / 127.6 | 203 | S85Y (TCT→TAT) | yigF | putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (62/93); new base T (18/30); total (80/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
GTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTC > CP009273/3995757‑3996054 | gTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATagag < 2:266801/150‑1 (MQ=255) tCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAgaga < 1:40103/150‑1 (MQ=255) cTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGatat > 2:2703857/1‑150 (MQ=255) tGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATa < 1:712248/150‑1 (MQ=255) tGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATa < 1:3106968/150‑1 (MQ=255) tGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATa > 1:2692822/1‑150 (MQ=255) tGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATa > 1:2692452/1‑150 (MQ=255) tGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATa < 2:4607307/150‑1 (MQ=255) aaGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATa < 2:4366453/150‑1 (MQ=255) aaGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATa < 1:1039742/150‑1 (MQ=255) aGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATAc < 1:1701526/150‑1 (MQ=255) aGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATAc < 1:1263007/150‑1 (MQ=255) gCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATAcc < 1:637587/150‑1 (MQ=255) ccACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCa > 2:4519282/1‑150 (MQ=255) ccACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCa > 1:2962599/1‑150 (MQ=255) aCCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAg < 2:4068333/150‑1 (MQ=255) aCCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAg < 2:3310254/150‑1 (MQ=255) cTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTa < 1:1156658/150‑1 (MQ=255) tATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAg > 2:3505243/1‑150 (MQ=255) tATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAg < 1:1796652/150‑1 (MQ=255) aTTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGa < 2:2113267/150‑1 (MQ=255) ttCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGaa < 2:2350616/150‑1 (MQ=255) tCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAAc > 2:3414028/1‑150 (MQ=255) aaaGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACta > 1:4032598/1‑150 (MQ=255) aaaGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACta < 1:4532364/150‑1 (MQ=255) aaaGGATCCTGGTATTTAACCCTTTTTCCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATTGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACta < 2:4799618/150‑1 (MQ=255) cTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAAtt < 2:4409780/150‑1 (MQ=255) tCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTg < 2:4712075/150‑1 (MQ=255) cAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCt < 1:3775078/150‑1 (MQ=255) aGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCtt < 2:4078711/150‑1 (MQ=255) aGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCtt < 1:2535972/150‑1 (MQ=255) tttAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTc < 2:774466/150‑1 (MQ=255) tttAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTc > 1:4386407/1‑150 (MQ=255) tttAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAAATATAATTGCTTTTTTc > 1:1792978/1‑150 (MQ=255) ttAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTcc < 2:1096950/150‑1 (MQ=255) tAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCa > 1:1532516/1‑150 (MQ=255) tAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCa > 1:2270611/1‑150 (MQ=255) tAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCa > 2:2320596/1‑150 (MQ=255) aCCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATa < 1:916182/150‑1 (MQ=255) cccTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATaa > 1:4752543/1‑150 (MQ=255) cTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAAcc < 1:3998224/150‑1 (MQ=255) tttACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAAcccc > 2:2612708/1‑150 (MQ=255) tttACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAAcccc < 1:4680885/150‑1 (MQ=255) tctTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACa < 2:1701633/150‑1 (MQ=255) tctTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACa < 1:2576451/150‑1 (MQ=255) tttCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACaaa < 2:2184680/150‑1 (MQ=255) tttCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACaaa > 1:3873163/1‑150 (MQ=255) tttCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACaaa > 1:2668056/1‑150 (MQ=255) ttCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACaaat > 1:1756453/1‑150 (MQ=255) tctcATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACaaata < 2:2283298/150‑1 (MQ=255) tcATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTTCTTTTTTCCATAACCCCAGGACacataaa > 2:3029862/1‑150 (MQ=255) tAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAatat > 2:870315/1‑150 (MQ=255) gAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAatatat < 2:3487438/150‑1 (MQ=255) aaCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATc > 2:1249971/1‑150 (MQ=255) ccATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCa < 2:2503066/150‑1 (MQ=255) cATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAg > 2:1826316/1‑150 (MQ=255) aTTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAgg > 2:3306106/1‑150 (MQ=255) tGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGacc > 1:248158/1‑148 (MQ=255) gTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACa > 2:3338255/1‑150 (MQ=255) tCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACaga > 2:4019448/1‑150 (MQ=255) tgtTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACagaaga < 2:1337543/150‑1 (MQ=255) tAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAATGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAg > 1:1853255/1‑150 (MQ=255) tAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAg > 2:1815626/1‑150 (MQ=255) cAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCaa > 2:1056075/1‑150 (MQ=255) aGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAAt > 1:3494703/1‑150 (MQ=255) gCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATg < 2:1460891/150‑1 (MQ=255) cAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGa < 1:1173012/150‑1 (MQ=255) cATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAAt > 1:101618/1‑150 (MQ=255) cATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAAt < 2:678254/150‑1 (MQ=255) cATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAAt < 1:800590/150‑1 (MQ=255) aTAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAAtt < 1:213094/150‑1 (MQ=255) ttggCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTACAGCCAATTATTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTCATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTc < 1:2752748/148‑1 (MQ=255) tAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTc > 2:3066859/1‑150 (MQ=255) tAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTc < 1:319051/150‑1 (MQ=255) aGGCTGCTACGGCAAGTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCa < 1:496262/150‑1 (MQ=255) gctgctACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCAtt < 2:1923824/150‑1 (MQ=255) tgctACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTg > 1:356018/1‑150 (MQ=255) ctACGGATATTCCCAGAATGTTAACGACAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTACATAACCACAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATTAAATTCATTTGaa < 2:257035/150‑1 (MQ=255) tACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAAt > 1:3462914/1‑150 (MQ=255) aCGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATa < 2:634517/150‑1 (MQ=255) cAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTa > 1:4206919/1‑150 (MQ=255) aTTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAg < 1:2806729/150‑1 (MQ=255) aTTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAg > 2:760070/1‑150 (MQ=255) cccAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGt > 1:3111012/1‑150 (MQ=255) cccAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGt < 2:3836434/150‑1 (MQ=255) aTGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCtt < 2:1601243/150‑1 (MQ=255) tGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTa < 1:1237206/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACttt < 2:3982618/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACttt < 1:2397791/150‑1 (MQ=255) aTTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCt < 2:2270611/150‑1 (MQ=255) aTTAGTGCACCAACAAATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCt < 2:1532516/150‑1 (MQ=255) tGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTaaa < 1:1439427/150‑1 (MQ=255) cACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAAtg < 1:108444/150‑1 (MQ=255) aacaaATAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAAtgctgc > 2:4873078/1‑150 (MQ=255) aaTAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTta < 1:1805611/150‑1 (MQ=255) aaTAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTta < 2:2962599/150‑1 (MQ=255) aTAGATATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTtat < 1:576167/150‑1 (MQ=255) tAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTtata > 1:2215775/1‑150 (MQ=255) agagATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTatat < 2:3426522/150‑1 (MQ=255) agaTAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTc < 1:3282336/150‑1 (MQ=255) | GTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTC > CP009273/3995757‑3996054 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |