| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,006,260 | G→A | 18.9% | intergenic (‑84/‑153) | metR ← / → metE | methionine biosynthesis regulon transcriptional regulator/5‑methyltetrahydropteroyltriglutamate‑ homocysteine S‑methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,006,260 | 0 | G | A | 18.9% | 621.8 / 126.3 | 249 | intergenic (‑84/‑153) | metR/metE | methionine biosynthesis regulon transcriptional regulator/5‑methyltetrahydropteroyltriglutamate‑ homocysteine S‑methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (98/104); new base A (15/32); total (113/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.05e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
AGCGGCTGCGAGCGAGCCGCAGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAA > CP009273/4006111‑4006409 | aGCGGCTGCGAGCGAGCCGCAGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACg < 2:273421/150‑1 (MQ=255) cGGCTGCGAGCGAGCCGCAGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGc < 2:3227470/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGAGCGAGCCGCAGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCGTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCt < 1:4167735/150‑1 (MQ=255) gCTGCGAGCGAGCCGCAGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTa > 1:1690968/1‑150 (MQ=255) gagcgagcCGCAGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATc < 1:2601695/150‑1 (MQ=255) agcgagcCGCAGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATcc > 1:480903/1‑150 (MQ=255) gcgagcCGCAGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCt < 1:921460/150‑1 (MQ=255) gcgagcCGCAGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCt < 1:1594655/150‑1 (MQ=255) cgagcCGCAGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCtt < 1:304382/150‑1 (MQ=255) gagcCGCAGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTc < 1:521092/150‑1 (MQ=255) agcCGCAGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACGTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCg < 2:4677665/150‑1 (MQ=255) aGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGGGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACAGCTAAAATCCTTCGTCtttt > 2:1504289/1‑150 (MQ=255) aGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCtttt < 1:1344133/150‑1 (MQ=255) gTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTa > 2:3136375/1‑150 (MQ=255) gTTCCGCAAAGCTTGTAGCGTTTTCAGGTTTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGTATATTCAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTTGACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTa < 2:4465300/150‑1 (MQ=255) ttCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTaa < 2:1825518/150‑1 (MQ=255) cGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAAtt < 1:1744698/150‑1 (MQ=255) cGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAAtt < 2:1872305/150‑1 (MQ=255) gCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAAttt > 1:1168341/1‑150 (MQ=255) cAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTa < 2:1360938/150‑1 (MQ=255) aCGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATg < 2:3980888/150‑1 (MQ=255) gTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGt > 2:1596535/1‑150 (MQ=255) aGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTg < 2:3381002/150‑1 (MQ=255) aGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTg > 2:1240244/1‑150 (MQ=255) gTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCt > 2:2860947/1‑150 (MQ=255) tttCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGc > 2:901569/1‑150 (MQ=255) tttCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGc < 1:1855360/150‑1 (MQ=255) cAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGtt < 2:4076830/150‑1 (MQ=255) ggTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAAttt > 1:82060/1‑129 (MQ=255) ggTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAAttt < 2:82060/129‑1 (MQ=255) gtgtTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTtct > 2:8138/1‑150 (MQ=255) tgtTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTtctc > 2:4171507/1‑150 (MQ=255) gtcttACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTcc > 2:1936582/4‑150 (MQ=255) ttACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCAcc > 2:1654008/1‑150 (MQ=255) aCTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCAcccc > 2:1079007/1‑150 (MQ=255) tCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGt < 2:3781894/150‑1 (MQ=255) cGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTc < 1:3093228/150‑1 (MQ=255) cGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTc > 2:3053516/1‑150 (MQ=255) gATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCa < 2:1527729/150‑1 (MQ=255) tCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCact < 1:1626302/150‑1 (MQ=255) cATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCactt < 1:3533951/150‑1 (MQ=255) aTGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCactta > 1:3385703/1‑150 (MQ=255) aTGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCactta < 2:4215700/150‑1 (MQ=255) aTGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCactta < 2:1168312/150‑1 (MQ=255) tGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCacttac > 1:3669597/1‑150 (MQ=255) gAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCacttact > 2:3668613/1‑150 (MQ=255) aGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCa > 1:3435468/1‑150 (MQ=255) gTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAg > 2:2698497/1‑150 (MQ=255) aCTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTc < 1:872710/150‑1 (MQ=255) tCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCg < 1:2466161/150‑1 (MQ=255) cATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGa > 2:2835667/1‑150 (MQ=255) cATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGa < 1:3134749/150‑1 (MQ=255) cATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGa < 1:3136375/150‑1 (MQ=255) cATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGa > 2:3514992/1‑150 (MQ=255) aTGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGAt > 1:4520657/1‑150 (MQ=255) tGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATg > 2:4407330/1‑150 (MQ=255) gAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGa > 1:3340071/1‑150 (MQ=255) ataatTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAAt > 2:2530213/1‑150 (MQ=255) ataatTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAAt > 2:3360822/1‑150 (MQ=255) ataatTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAAt < 2:345871/150‑1 (MQ=255) taatTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTACCGGGGATGAATa > 1:2193839/1‑150 (MQ=255) ttGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACt > 1:2180585/1‑150 (MQ=255) cgcTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTgc > 2:2508354/1‑150 (MQ=255) gcTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTgcc < 1:1988390/150‑1 (MQ=255) ttGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTgccgc > 2:3086281/1‑150 (MQ=255) aaTATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTGTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTccc < 1:4223919/150‑1 (MQ=255) atatACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCt < 1:4330030/150‑1 (MQ=255) ataCAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCtt < 2:4602326/144‑1 (MQ=255) ataCAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCtt > 1:4602326/1‑144 (MQ=255) aCAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAAt < 1:3296484/150‑1 (MQ=255) cAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAAtt < 1:994052/150‑1 (MQ=255) aaCCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGACGCCTTCCCAAAATTCaaa > 1:2659439/1‑150 (MQ=255) aCCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCaaaa > 2:2095903/1‑150 (MQ=255) aCCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCaaaa < 1:4408409/150‑1 (MQ=255) ccGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAAt > 1:1395367/1‑150 (MQ=255) ccGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAAt > 1:4642102/1‑150 (MQ=255) cGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATc < 1:771207/150‑1 (MQ=255) cGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATc < 2:3597064/150‑1 (MQ=255) cGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATc > 1:2771380/1‑150 (MQ=255) ccAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCa > 2:3997540/1‑150 (MQ=255) ccAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCa < 1:2242191/150‑1 (MQ=255) cAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCAt < 1:4506591/150‑1 (MQ=255) aaTTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATa < 1:1194764/150‑1 (MQ=255) aaTTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATa < 2:4205590/150‑1 (MQ=255) aTTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAg > 1:3872512/1‑150 (MQ=255) tATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGa < 1:1012438/150‑1 (MQ=255) tGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGAtt > 1:1824770/1‑150 (MQ=255) ggATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGAttt > 2:1815382/1‑150 (MQ=255) ggATGTGTAAACATCTGGACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGAttt < 2:482806/150‑1 (MQ=255) aTGTGTAAACATCTGGACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTAc < 1:2208099/150‑1 (MQ=255) tgtgTAAACATCTGGACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACa < 1:2440195/150‑1 (MQ=255) tgtAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACata < 2:2319277/150‑1 (MQ=255) tgtAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTAACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACata < 2:3933541/150‑1 (MQ=255) tgtAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACata < 2:480903/150‑1 (MQ=255) aaaCATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATaa > 1:2102506/1‑150 (MQ=255) aTCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAATATCCATAGGATTTACATATAATTag < 1:1056281/150‑1 (MQ=255) aTCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATCGGATTTACAGATAATTag > 2:4575675/1‑150 (MQ=255) aTCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTag > 2:3722872/1‑150 (MQ=255) cTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTagag < 2:4751804/150‑1 (MQ=255) ggACAGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGACTAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACCTATAATTAGAGga > 1:3718711/1‑150 (MQ=255) | AGCGGCTGCGAGCGAGCCGCAGTTCCGCAACGCTTGTAGCGTTTTCAGGTGTTTTACTTCGATCATGAAAGTCCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAA > CP009273/4006111‑4006409 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |