Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 4,317,035 | A→T | 22.9% | E28D (GAA→GAT) | crfC → | clamp‑binding sister replication fork colocalization protein, dynamin‑related |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 4,317,035 | 0 | A | T | 22.9% | 466.1 / 148.4 | 209 | E28D (GAA→GAT) | crfC | clamp‑binding sister replication fork colocalization protein, dynamin‑related |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (100/61); new base T (26/22); total (126/83) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
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AAAACAGAACTCAAAAACAATCTGGCTAAATAAAATAACAAAATTTGCTTTAAGGAAGAATTTTCTATGTACACACAGACCCTGTATGAGTTAAGTCAGGAGGCTGAACGCCTGTTACAGCTTTCTCGCCAACAGTTGCAGTTACTGGAAAAAATGCCTCTCTCTGTACCCGGAGACGACGCGCCACAACTGGCTTTACCCTGGAGTCAGCCTAATATCGCCGAACGTCACGCGATGCTGAATAATGAGTTGCGTAAAATTTCCCGACTGGAAATGGTGCTTGCAATTGTCGGTACCA > CP009273/4316886‑4317183 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |