Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,424,241 | T→G | 23.3% | A104A (GCT→GCG) | ytfH → | DUF24 family HxlR‑type putative transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,424,241 | 0 | T | G | 23.3% | 680.4 / 289.7 | 360 | A104A (GCT→GCG) | ytfH | DUF24 family HxlR‑type putative transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (159/117); new base G (47/37); total (206/154) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.02e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.93e-01 |
Only 100 of 368 total aligned reads displayed.
ATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAGGGCGGATAAGATGCGCCAGCATCGCATCCGCCA > CP009273/4424092‑4424390 | ggTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGTGCGAAAAGGTTTCGGCa > 1:2088296/1‑150 (MQ=255) gTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCAc > 1:4210048/1‑150 (MQ=255) tGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACt < 1:150685/150‑1 (MQ=255) tGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTATTAAACGTATAGCGTATACGGTGGTGCCGCCGCAGGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCCCt > 1:4095895/1‑150 (MQ=255) ggggTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTg < 2:3682441/150‑1 (MQ=255) gtgagtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCg < 2:3589270/150‑1 (MQ=255) gtgagtgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTATTAAACGTATCGCGTATCCGGGGGTTCCGCCGCATGTGGAATATATCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCACTGGCg > 1:962059/1‑150 (MQ=255) tgaAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTg > 1:3516600/1‑150 (MQ=255) aaaGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGAt < 2:699838/150‑1 (MQ=255) aaaGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCACTGGCGGACTGGAt < 2:2412297/150‑1 (MQ=255) aGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCCTATAGCGTATCCGGGGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGCAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTg > 1:179352/1‑150 (MQ=255) aTGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAg < 2:3899366/150‑1 (MQ=255) tGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGt < 2:2988149/150‑1 (MQ=255) cTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTg < 1:769278/150‑1 (MQ=255) cTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTg < 1:3331334/150‑1 (MQ=255) cTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTg > 2:2456618/1‑150 (MQ=255) ttGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTGACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAACGGTTGCGGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGa < 2:2803369/150‑1 (MQ=255) cgcAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAAtt < 2:2363451/150‑1 (MQ=255) cgcAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAAtt < 1:585754/150‑1 (MQ=255) gTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGcc < 1:1966079/150‑1 (MQ=255) aCAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGgt < 2:412698/150‑1 (MQ=255) aCAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGgt > 1:1029622/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGgtgt > 2:2908607/1‑150 (MQ=255) ggCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGtt > 2:1097916/1‑150 (MQ=255) gCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTg > 1:3619097/1‑150 (MQ=255) tAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCgg > 1:2271281/1‑150 (MQ=255) tAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCgg < 1:111457/150‑1 (MQ=255) aGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGt > 1:3991243/1‑150 (MQ=255) aGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGt > 2:1270687/1‑150 (MQ=255) aaCAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGc > 2:4425616/1‑150 (MQ=255) cAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCgg > 2:342863/1‑150 (MQ=255) aGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCggg > 1:1759481/1‑150 (MQ=255) aGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCggg > 2:2336127/1‑150 (MQ=255) ggATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGa > 1:3843521/1‑150 (MQ=255) ggATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGa > 2:3119724/1‑150 (MQ=255) aTGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATg < 2:3881623/150‑1 (MQ=255) aTGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATg < 2:461402/150‑1 (MQ=255) aTGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGGGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATg > 2:661958/1‑150 (MQ=255) ggTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGaa < 1:4616075/150‑1 (MQ=255) gTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAAc < 1:2661741/150‑1 (MQ=255) ttCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTg > 2:1556859/1‑150 (MQ=255) cTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCg > 1:59703/1‑150 (MQ=255) cTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCg < 2:4038207/150‑1 (MQ=255) 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aTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTg > 1:3803565/1‑150 (MQ=255) cgcgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGcc > 1:3025283/1‑150 (MQ=255) gcgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCg < 1:3119724/150‑1 (MQ=255) gcgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCg < 1:4521053/150‑1 (MQ=255) cgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCgg > 2:756482/1‑150 (MQ=255) cgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCgg > 2:27585/1‑150 (MQ=255) cgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCgg < 2:1026968/150‑1 (MQ=255) tATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGAt > 1:1346555/1‑150 (MQ=255) ccGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcg < 2:4361141/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcg < 2:3964406/150‑1 (MQ=255) 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ccgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCGGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAgg < 2:1888980/150‑1 (MQ=255) ggCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAGGGCGGAt < 2:2450035/150‑1 (MQ=255) ggCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAGGGCGGAt < 2:1668224/150‑1 (MQ=255) ggCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAGGGCGGAt < 2:4236962/150‑1 (MQ=255) gCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGGTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAGGGCGGATa < 2:2071477/150‑1 (MQ=255) 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ggTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAGGGCGGATAAGATgcg > 2:1832558/1‑150 (MQ=255) aGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAGGGCGGATAAGATGCGCCAg > 2:4558367/1‑150 (MQ=255) gAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAGGGCGGATAAGATGCGCCAgcat > 1:3236440/1‑150 (MQ=255) aaaGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAGGGCGGATAAGATGCGCCAgcatcg < 1:4749276/150‑1 (MQ=255) aaaGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAGGGCGGATAAGATGCGCCAgca > 1:298239/1‑147 (MQ=255) 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ggTTGCGGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAGGGCGGATAAGATGCGCCAgcatcgcat > 2:4341823/1‑150 (MQ=255) ttGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAGGGCGGATAAGATGCGCCAGCATCGCATcc > 2:2873354/1‑150 (MQ=255) | ATCGGTGGGGTGAGTGAAAAGATGCTTGCGCAGTCGTTACAGGCGTTAGAACAGGATGGTTTTCTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTTGTAGGGCGGATAAGATGCGCCAGCATCGCATCCGCCA > CP009273/4424092‑4424390 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |