| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,468,165 | A→G | 70.7% | intergenic (‑37/‑125) | argI ← / → rraB | ornithine carbamoyltransferase 1/protein inhibitor of RNase E |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,468,165 | 0 | A | G | 70.7% | 337.3 / 177.3 | 205 | intergenic (‑37/‑125) | argI/rraB | ornithine carbamoyltransferase 1/protein inhibitor of RNase E |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/29); new base G (71/74); total (102/103) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.13e-01 | |||||||||||
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
TTACCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTGGAAG > CP009273/4468016‑4468314 | ttACCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTaaaa < 1:1939676/150‑1 (MQ=255) aCCGCTGTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGtt < 2:4258795/150‑1 (MQ=255) cTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAt > 2:3210782/1‑150 (MQ=255) cTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAt > 1:1783749/1‑150 (MQ=255) ttttCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAtt < 1:2429263/150‑1 (MQ=255) ttttCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAtt < 1:1711127/150‑1 (MQ=255) ttCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTta < 1:4452074/150‑1 (MQ=255) ttCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTta < 1:4857343/150‑1 (MQ=255) tATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATg < 2:555205/150‑1 (MQ=255) tATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATg < 2:4604227/150‑1 (MQ=255) tATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATg > 2:2850700/1‑150 (MQ=255) tCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGga > 2:3090619/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGgat > 2:3059128/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGgat > 2:3058656/1‑150 (MQ=255) ggCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatg > 2:3350002/1‑150 (MQ=255) ggCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatg < 2:1340283/150‑1 (MQ=255) tttCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGatt > 2:2057207/1‑150 (MQ=255) tttCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGatt < 1:3538712/150‑1 (MQ=255) tCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGattat < 1:2315608/150‑1 (MQ=255) cAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGattatt > 2:830581/1‑150 (MQ=255) aGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTc > 1:1621771/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCa < 1:3825709/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCAtt < 1:2802779/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCAttt < 1:4085474/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCAttt < 1:4523516/150‑1 (MQ=255) cgcgGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTg > 2:767796/1‑150 (MQ=255) cgcgGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTg > 2:109375/1‑150 (MQ=255) gcgGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGc < 1:1418163/150‑1 (MQ=255) gcgGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGc < 2:4152126/150‑1 (MQ=255) cgGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCa > 1:4869146/1‑150 (MQ=255) ggCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGaaa > 2:3859630/1‑150 (MQ=255) cTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGt < 2:1170624/150‑1 (MQ=255) cTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGt > 2:4866953/1‑150 (MQ=255) cTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGt > 1:2096582/1‑150 (MQ=255) tAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTc > 2:4574251/1‑150 (MQ=255) aaCTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCt < 1:1439146/150‑1 (MQ=255) aaCTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCt > 1:3820783/1‑150 (MQ=255) aCTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTa < 2:1930885/150‑1 (MQ=255) aCTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATAGAGTAATTTCAGGAATTGATTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTTTGGCTAACGCCTAAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTa < 1:4106080/150‑1 (MQ=255) tGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTaaa > 1:2534411/1‑150 (MQ=255) cagcagGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGc < 1:20582/150‑1 (MQ=255) gcagGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCAt < 1:1013778/150‑1 (MQ=255) gcagGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCAt > 2:3965046/1‑150 (MQ=255) agGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATaa < 2:589619/150‑1 (MQ=255) gCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAAt < 1:4715891/150‑1 (MQ=255) gCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAAt > 2:1317716/1‑150 (MQ=255) tGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCt > 1:4021935/1‑150 (MQ=255) gTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCtt < 1:647218/150‑1 (MQ=255) tCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAATTATTTGTcaca > 2:4030971/1‑150 (MQ=255) cGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGa > 1:3091279/1‑150 (MQ=255) cGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGa > 1:659598/1‑150 (MQ=255) tGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAgg > 1:2245004/1‑150 (MQ=255) cGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGt > 1:907585/1‑150 (MQ=255) gAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTc > 1:1792457/1‑150 (MQ=255) aaTTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAgtg < 1:1064187/150‑1 (MQ=255) aaTTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAgtg > 2:3295273/1‑150 (MQ=255) ttCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAgtggtg < 2:293260/150‑1 (MQ=255) tCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGgtgt < 2:4021935/150‑1 (MQ=255) tCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGgtgt < 2:4522898/150‑1 (MQ=255) cgggAACTGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGgtgtg < 2:3926274/148‑1 (MQ=255) cAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGgtgtg > 2:157539/1‑150 (MQ=255) aGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGgtgtgt > 1:593593/1‑150 (MQ=255) ggAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGtgtgtg > 1:2121660/1‑150 (MQ=255) aaaTGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGAc < 2:4576228/150‑1 (MQ=255) aaaTGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGAc > 1:3983283/1‑150 (MQ=255) cTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATaa > 1:1235922/1‑150 (MQ=255) tATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAaga > 2:629561/1‑150 (MQ=255) tATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAaga < 2:1781384/150‑1 (MQ=255) aTAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTAt > 1:2712326/1‑150 (MQ=255) aTAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTAt > 1:3709601/1‑150 (MQ=255) aTAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTAt > 1:3578649/1‑150 (MQ=255) aaaaCCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCg > 2:3452371/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCgg > 1:4656942/1‑150 (MQ=255) cccGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAg > 2:1180836/1‑150 (MQ=255) cccGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAg < 1:784964/150‑1 (MQ=255) aCATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACAt < 2:2245004/150‑1 (MQ=255) cATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACAtt > 2:3734022/1‑150 (MQ=255) aTAGTTCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTa > 2:4699068/1‑150 (MQ=255) aTAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTa < 1:226860/150‑1 (MQ=255) aGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAag < 1:3350002/150‑1 (MQ=255) aGATCCCTCCTGTGGCTAACGCATCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAag < 1:4863171/150‑1 (MQ=255) gATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAaga < 1:1937891/150‑1 (MQ=255) gATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAaga < 1:1937697/150‑1 (MQ=255) tCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAgg < 1:1097018/150‑1 (MQ=255) tCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAgg < 1:1097143/150‑1 (MQ=255) tCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAgg > 2:4509661/1‑150 (MQ=255) cctcctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGaa < 1:3090490/150‑1 (MQ=255) ctcctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAAt < 1:3460672/150‑1 (MQ=255) ctcctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAAt > 1:4195463/1‑150 (MQ=255) tcctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATg < 2:3479520/150‑1 (MQ=255) tcctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATg < 2:253040/150‑1 (MQ=255) tgtgGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTATAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGc < 2:4869146/150‑1 (MQ=255) gCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATg < 2:2718833/150‑1 (MQ=255) aaCGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCa < 1:4712674/150‑1 (MQ=255) aaCGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCa < 1:1149985/150‑1 (MQ=255) aaCGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCa > 1:337492/1‑150 (MQ=255) tCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCg < 2:4378878/150‑1 (MQ=255) cAATGAATTAAAGTTCAAGTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCgg > 2:2471809/1‑150 (MQ=255) aTGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaa < 1:1611151/150‑1 (MQ=255) aaagTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTgg > 1:3515634/1‑150 (MQ=255) | TTACCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTGGAAG > CP009273/4468016‑4468314 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |