Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,510,428 | G→T | 20.4% | intergenic (‑287/+60) | yjhU ← / ← yjhF | putative DNA‑binding transcriptional regulator; KpLE2 phage‑like element/putative transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,510,428 | 0 | G | T | 20.4% | 738.1 / 147.2 | 268 | intergenic (‑287/+60) | yjhU/yjhF | putative DNA‑binding transcriptional regulator; KpLE2 phage‑like element/putative transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (108/105); new base T (35/20); total (143/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.67e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
GCGATCGCCCGCTGTTCCCCCATACTGTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAACAGCGTTTCTT > CP009273/4510279‑4510576 | gCGATCGCCCGCTGTTCCCCCATACTGTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCg < 2:1691677/150‑1 (MQ=255) tCGCCCGCTGTTCCCCCATACTGTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGtcac > 1:3542248/1‑150 (MQ=255) cGCCCGCTGTTCCCCCATACTGTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGtcact > 1:2415951/1‑150 (MQ=255) cGCCCGCTGTTCCCCCATACTGTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGtcact < 1:2973637/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTGTTCCCCCATACTGTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGtcactc > 1:1881445/1‑150 (MQ=255) cGCTGTTCCCCCATACTGTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTcactcact > 2:759105/1‑150 (MQ=255) cTGTTCCCCCATACTGTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTaa > 2:1895677/1‑150 (MQ=255) cccccATACTGTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTAt < 2:275117/150‑1 (MQ=255) cccATACTGTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATgg < 1:723361/150‑1 (MQ=255) cATACTGTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCCGACGGTTGCCGTCACTCACTCAATTATgggg > 2:4433487/1‑150 (MQ=255) aTACTGTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATggggg < 1:4776137/150‑1 (MQ=255) gTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGt > 2:2040360/1‑150 (MQ=255) gTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGt > 1:1815399/1‑150 (MQ=255) gTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGt < 1:2271112/150‑1 (MQ=255) tAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTg > 1:3379254/1‑150 (MQ=255) gCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATCTCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGaaca < 1:1745889/150‑1 (MQ=255) gCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGaaca < 2:3041877/150‑1 (MQ=255) ccGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGaacaa < 2:4277303/150‑1 (MQ=255) cGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGaacaac > 2:4550498/1‑150 (MQ=255) agaCATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAgg < 2:2743780/150‑1 (MQ=255) aCATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGtt > 2:2300924/1‑150 (MQ=255) aCATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGtt < 1:4740635/150‑1 (MQ=255) cATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTg < 2:2702054/150‑1 (MQ=255) cGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACt > 1:543217/1‑150 (MQ=255) ggCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTg > 2:2288700/1‑150 (MQ=255) tttACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCa < 1:1953799/150‑1 (MQ=255) ttACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCaa < 2:304127/150‑1 (MQ=255) cAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGaa < 1:3767980/150‑1 (MQ=255) cAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGaa > 2:1183488/1‑150 (MQ=255) gTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAAcc < 2:1141000/150‑1 (MQ=255) tATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAAccc > 1:1040334/1‑150 (MQ=255) tATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAAccc < 2:2852584/150‑1 (MQ=255) ttACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGa > 1:2529229/1‑150 (MQ=255) tACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGAt < 1:2618874/150‑1 (MQ=255) aCTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGAtt > 2:3210894/1‑150 (MQ=255) gagaATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATtata > 2:3715261/1‑150 (MQ=255) gaATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATaaa < 2:3269018/150‑1 (MQ=255) aaTACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATaaaa > 1:860131/1‑150 (MQ=255) aaTACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATaaaa > 2:2577906/1‑150 (MQ=255) aTACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAAc > 2:4108575/1‑150 (MQ=255) tACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACt < 1:4783626/150‑1 (MQ=255) acCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAg < 1:754237/150‑1 (MQ=255) cATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTg > 2:555481/1‑150 (MQ=255) cAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCg > 2:132016/1‑150 (MQ=255) cAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCg < 2:4253254/150‑1 (MQ=255) cATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCa > 1:4460566/1‑150 (MQ=255) aTAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAg > 2:1082384/1‑150 (MQ=255) aTAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGAAGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAg > 1:3174325/1‑150 (MQ=255) aaTCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGaa > 2:4783922/1‑150 (MQ=255) aTCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAAt < 1:1562896/150‑1 (MQ=255) aTCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAAt < 2:3670264/150‑1 (MQ=255) aTCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAAt < 2:2901414/150‑1 (MQ=255) aTCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAAt < 2:4292913/150‑1 (MQ=255) gAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATaaa > 2:2262296/1‑150 (MQ=255) aGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATaaaaa > 1:2968545/1‑150 (MQ=255) aGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATaaaaa > 2:934252/1‑150 (MQ=255) ggTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAAt < 2:2430960/150‑1 (MQ=255) ggTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAAt > 1:1273/1‑150 (MQ=255) ttCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCa < 1:4222894/150‑1 (MQ=255) tCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAg < 1:1592018/150‑1 (MQ=255) cAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGc > 1:4627139/1‑150 (MQ=255) aaTATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGcc < 2:4692762/150‑1 (MQ=255) tatCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCa > 2:3488695/1‑150 (MQ=255) gCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGa < 2:1881445/150‑1 (MQ=255) gCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGa < 2:314592/150‑1 (MQ=255) ccccTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACCGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGAt < 2:192299/150‑1 (MQ=255) ccccTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGAt > 2:3316484/1‑150 (MQ=255) ccccTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGAt < 1:1462761/150‑1 (MQ=255) ccccTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGAt > 2:881208/1‑150 (MQ=255) ccccTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGAt < 2:3783425/150‑1 (MQ=255) cTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGa < 2:4663415/150‑1 (MQ=255) tttGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATaa < 1:1179985/150‑1 (MQ=255) ttGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAag < 2:1663723/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAgtgt > 1:2604084/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGtgtg < 1:2665097/150‑1 (MQ=255) ccAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGGTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTgg < 2:1412230/150‑1 (MQ=255) cGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACAt < 2:64865/150‑1 (MQ=255) cGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACAt < 1:3976677/150‑1 (MQ=255) aTTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCa > 1:3568380/1‑150 (MQ=255) gTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGt > 2:3952648/1‑150 (MQ=255) tCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGCACATCAGGTTGGCTCACTGGCAAGACCCCGATTATAAAACTAAGCGGGCGAGCTGAATAAAAATCAGCCCACTGAGGGAGAAGAGTGTGGACCTCAGCGTc > 2:3248719/1‑150 (MQ=255) ccGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAg < 1:132019/150‑1 (MQ=255) cGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAgg > 2:2063865/1‑150 (MQ=255) cGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAgg > 1:2786776/1‑150 (MQ=255) gTGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGa > 1:1971390/1‑150 (MQ=255) gTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGa < 1:2288783/150‑1 (MQ=255) tGCAGACGGTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGAt < 2:3181814/150‑1 (MQ=255) tGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGAt < 1:2439760/150‑1 (MQ=255) aGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAAc > 1:2480319/1‑150 (MQ=255) aGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAAc > 2:3100265/1‑150 (MQ=255) aGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAAc > 1:1856533/1‑150 (MQ=255) aGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAAc > 2:2600877/1‑150 (MQ=255) aGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAAc > 2:3613943/1‑150 (MQ=255) gACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAACa > 2:4853768/1‑150 (MQ=255) cGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAACAGc > 1:4113930/1‑150 (MQ=255) cGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAACAGc > 1:1658256/1‑150 (MQ=255) gTTGCCTTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAACAGCGt < 1:2909934/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAACAGCGt < 2:2783948/150‑1 (MQ=255) ttGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAACAGCGtt > 1:401726/1‑150 (MQ=255) cGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACCACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAACAGCGTTTCtt < 2:1331582/150‑1 (MQ=255) | GCGATCGCCCGCTGTTCCCCCATACTGTAAAGCCGGAGACATGCTCCGGCTTTACAGTATTACTGAGAATACACCCATCAAGCATAATCGAAGGTTCAATATCGCCCCTTTTTGATCGCCAGCGATTCGTCACCGTGCAGACGGTTGCCGTCACTCACTAAATTATGGGGGACAGTGAACAACAGGTTGGCTCACTGGCAAGAACCCGATTATAAAACTAAGCTGGCGAGCAGAATAAAAATCAGCCCACTGATGGATAAGAGTGTGGACATCAGCGTCCAGGATAACAGCGTTTCTT > CP009273/4510279‑4510576 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |