Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 347,718 | G→T | 17.3% | E265* (GAA→TAA) | prpD → | 2‑methylcitrate dehydratase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 347,718 | 0 | G | T | 17.3% | 1026.8 / 154.2 | 338 | E265* (GAA→TAA) | prpD | 2‑methylcitrate dehydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (116/163); new base T (21/38); total (137/201) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 340 total aligned reads displayed.
CGAACACCGGCACGCGTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTATGAACAGATGCAGGCAGCAGGCAAAACGGCG > CP009273/347569‑347867 | cGAACACCGGCACGCGTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTg > 1:4045770/1‑150 (MQ=255) gAACACCGGCACGCGTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGa > 1:1355622/1‑150 (MQ=255) gAACACCGGCACGCGTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGa > 1:1818463/1‑150 (MQ=255) gAACACCGGCACGCGTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGa < 2:2700262/150‑1 (MQ=255) acCGGCACGCGTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCg < 2:2832509/150‑1 (MQ=255) cGGCACGCGTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTTAATCGtt > 2:2786893/1‑150 (MQ=255) cGGCACGCGTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGtt > 2:1332927/1‑150 (MQ=255) cACGCGTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTTAATCGTTCCg < 1:1626935/150‑1 (MQ=255) cACGCGTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCg < 1:3796452/150‑1 (MQ=255) aCGCGTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGc < 2:3168235/150‑1 (MQ=255) cgcgTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTTAATCGTTCCGCt < 1:4644571/150‑1 (MQ=255) cgTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTTAATCGTTCCGCTTc < 1:4367732/150‑1 (MQ=255) cgTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTc < 2:4258866/150‑1 (MQ=255) cgTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTc < 1:251058/150‑1 (MQ=255) gTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTcc < 2:3757014/150‑1 (MQ=255) tAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCa > 1:1005661/1‑150 (MQ=255) tAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCa > 2:3510196/1‑150 (MQ=255) aaaTCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTTAATCGTTCCGCTTCCAg < 1:2631448/150‑1 (MQ=255) aaaTCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAg > 1:2216769/1‑150 (MQ=255) aaTCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAgc < 2:1701923/150‑1 (MQ=255) aaTCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCGTTAAAGGTTAATCGTTCCGCTTCCAgc > 1:2968151/1‑150 (MQ=255) aTCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAgcg < 2:3514535/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGcc > 1:3196778/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGccc < 2:1814291/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGccc > 2:2167744/1‑150 (MQ=255) tGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCg > 1:2350133/1‑150 (MQ=255) tGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCg > 2:3623163/1‑150 (MQ=255) ggcggcGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTTAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTa < 2:3469810/150‑1 (MQ=255) ggcggcGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTa < 1:1971737/150‑1 (MQ=255) ggcggcGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTa < 1:4422611/150‑1 (MQ=255) ggcggcGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATAGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTa < 1:1835332/150‑1 (MQ=255) cggcggGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACg < 2:4667518/150‑1 (MQ=255) cgggcgATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGACAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTACAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGtt < 2:1490157/150‑1 (MQ=255) cgggcgATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGtt > 1:1879351/1‑150 (MQ=255) ggcgATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTTAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTcc < 1:1850713/150‑1 (MQ=255) gcgATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCt < 2:2569045/150‑1 (MQ=255) cgATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTa > 2:1106056/1‑150 (MQ=255) gATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTAc < 1:1068818/150‑1 (MQ=255) gATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTAc < 2:815257/150‑1 (MQ=255) gATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTAc < 1:2263364/150‑1 (MQ=255) aTGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACg < 1:4823653/150‑1 (MQ=255) ccACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTa > 2:2304724/1‑150 (MQ=255) cACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTAt < 2:3017645/150‑1 (MQ=255) 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gTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTg < 1:1734402/150‑1 (MQ=255) tACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCTAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGt > 2:1553911/1‑150 (MQ=255) tACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGt < 1:795403/150‑1 (MQ=255) aCGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTTAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGtt < 1:461269/150‑1 (MQ=255) cTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCaaa < 1:63343/150‑1 (MQ=255) ggCACTGTTGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAAt < 1:3444111/150‑1 (MQ=255) gCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAAtc < 1:750776/150‑1 (MQ=255) cACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAAtct < 1:559897/150‑1 (MQ=255) tGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCt < 1:1553484/150‑1 (MQ=255) tGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCt < 2:4396517/150‑1 (MQ=255) aTGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTc > 1:3605033/1‑150 (MQ=255) aTGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTc < 1:3696714/150‑1 (MQ=255) cGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCAcgg > 1:2430274/1‑150 (MQ=255) cGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGGTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCcgg > 2:1297280/1‑150 (MQ=255) gAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCcggc > 1:671318/1‑150 (MQ=255) aaaaCGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCcggcg < 2:2350133/150‑1 (MQ=255) aaaCGGGCGAAATGGGTTACCCGTAAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCcggcgg > 2:566663/1‑150 (MQ=255) aCGGGCTAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAg < 1:340730/150‑1 (MQ=255) cGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGt > 1:130987/1‑150 (MQ=255) cGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGt > 1:2160865/1‑150 (MQ=255) 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tACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGGTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACg < 2:4069294/150‑1 (MQ=255) cccGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGc > 1:1990797/1‑150 (MQ=255) gTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGt < 2:3381410/150‑1 (MQ=255) aGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGa > 2:3250421/1‑150 (MQ=255) ccTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAagc > 1:3586269/1‑150 (MQ=255) cTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAagca > 2:3685567/1‑150 (MQ=255) tGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAagcag < 1:453955/150‑1 (MQ=255) tGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAagcag < 1:2889388/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGa > 2:4849040/1‑150 (MQ=255) tGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGAt < 1:4310342/150‑1 (MQ=255) 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gtgGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTTAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTGATGGAAAATGTGCTGTTCAAACTCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTa < 2:2244448/150‑1 (MQ=255) ttCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTTAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTATGAACAg > 1:4184574/1‑150 (MQ=255) tCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATAGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTATGAACAGa < 2:1583007/150‑1 (MQ=255) acgatgTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTATGAACAGATgc > 2:1426734/1‑150 (MQ=255) acgacgTCTCCTTTAAAGGTTAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTATGAACAGATgc < 2:4188145/150‑1 (MQ=255) gacgTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTATGAACAGATgcag > 2:3178236/1‑150 (MQ=255) gTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTATGAACAGATgcaggca > 2:2153487/1‑150 (MQ=255) ctcCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTATGAACAGATgcaggcagc < 1:3817012/150‑1 (MQ=255) tcCTTTAAAGGTTAATCGTTCCGCGTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTATGAACAGATgcaggcagca < 2:4795121/150‑1 (MQ=255) ttAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTATGAACAGATgcaggcagcaggca < 1:3292723/150‑1 (MQ=255) aaGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTATGAACAGATGCAGGCAGCAGGCaaaa > 2:2709847/1‑150 (MQ=255) gAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTATGAACAGATGCAGGCAGCAGGCAAAAcggcg > 2:3946697/1‑150 (MQ=255) | CGAACACCGGCACGCGTAAATCCTGGGCGGCGGGCGATGCCACTTCCCGCGCGGTACGTCTGGCACTGATGGCGAAAACGGGCGAAATGGGTTACCCGTCAGCCCTGACTGCGCCGGTGTGGGGCTTCTACGACGTCTCCTTTAAAGGTGAATCGTTCCGCTTCCAGCGCCCGTACGGTTCCTACGTTATGGAAAATGTGCTGTTCAAAATCTCCTTCCCGGCGGAGTTCCACTCCCAGACGGCAGTTGAAGCAGCGATGACGCTCTATGAACAGATGCAGGCAGCAGGCAAAACGGCG > CP009273/347569‑347867 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |