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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 401,692 | 0 | T | C | 22.4% | 520.3 / 159.5 | 246 | intergenic (+14/‑169) | yaiI/aroL | UPF0178 family protein/shikimate kinase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (74/117); new base C (18/37); total (92/154) | |||||||||||
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Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
GCGCGATTTTATGGATACCTTACGTGCCAGTGGGATCCAGACCGGCGGACCAGATAGCCTTTCACAACGTGACCGCCAGGCCTTTGCCGCGGAGCTGGAGAAGTGGTGGCTGGAAGTGCAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAATATTTATTGGTATAGTAAGGGGTGTATTGAGATTTTCACTTTAAGTGGAATTTTTTCTTTACAATCGAAATTGTACTAGTTTGATGGTATGATCGCTATTCTCATGACACCGGCTTTCGCCGCATTGCGAC > CP009273/401543‑401841 | gcgcGATTTTATGGATACCTTACGTGCCAGTGGGATCCAGACCGGCGGACCAGATAGCCTTTCACAACGTGACCGCCAGGCCTTTGCCGCGGAGCTGGAGAAGTGGTGGCTGGAAGTGCAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTtattat > 2:237659/1‑150 (MQ=255) cgcgATTTTATGGATACCTTACGTGCCAGTGGGATCCAGACCGGCGGACCAGATAGCCTTTCACAACGTGACCGCCAGGCCTTTGCCGCGGAGCTGGAGAAGTGGTGGCTGGAAGTGCAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTattatt < 1:3069838/150‑1 (MQ=255) cgcgATTTTATGGATACCTTACGTGCCAGTGGGATCCAGACCGGCGGACCAGATAGCCTTTCACAACGTGACCGCCAGGCCTTTGCCGCGGAGCTGGAGAAGTGGTGGCTGGAAGTGCAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTattatt < 1:2183526/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |