| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB122 | 4,266,097 | A→C | 100% | D147A (GAC→GCC) | CJ019_04001 → | putative FAD‑linked oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB122 | 4,266,097 | 0 | A | C | 100.0% | 65.2 / NA | 20 | D147A (GAC→GCC) | CJ019_04001 | putative FAD‑linked oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (10/10); total (10/10) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAA > ACB122/4265965‑4266227 | tgctgGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGcccc > 1:6407/1‑136 (MQ=255)tgctgGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGcccc > 7:168535/1‑136 (MQ=255) gcgcTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGCCCCTTCCTCGCaaaat > 3:191102/1‑134 (MQ=255) gggCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACg < 2:6407/136‑1 (MQ=255) gggCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGCCCCTACCTCGCAATTTGCCTGCTCGATCGGTGCCAACGTCGCCGAAAACg < 8:168535/136‑1 (MQ=255) tGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCCCTg > 8:117643/1‑136 (MQ=255) tGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGGCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTg < 1:26399/136‑1 (MQ=255) gTACGCAACCTGGCCATCTCCCTGGCCGCCGCACCCCATGGTCTGTACTACGCCCCCGCCCGTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATGGGGGGCAAGGGGGCCGAACACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACg < 3:22929/136‑1 (MQ=255) gTACGAAACCGGGCCATCTCCCAGGCGGCCGCACCCCTTGTTATTTAATACGCACCCGCCCCTTCCTCGAAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGGCGCCGAACACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACg < 4:191102/136‑1 (MQ=255) aCGCAACATGGCCATCTGCCTGGCCGCCGCTCCCCTTGGTATGTACTACGCACCGGCCAGTTCCTCGCAAATTTCCTCCTCGATCGGTGGCAACGTGGCCGATAACTCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTTCg < 8:62442/134‑1 (MQ=255) cccAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGCACACAAtgt < 4:13967/136‑1 (MQ=255) cccAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGCACACAAtgt > 3:13967/1‑136 (MQ=255) cgccgcACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCCACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAg > 7:67/1‑136 (MQ=255) aCCCCATGGTATGTACTACGCACCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGa > 2:18292/1‑135 (MQ=255) actacGCACCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGGAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTc > 1:198503/1‑134 (MQ=255) tccGCCCCCGCCACTTCCTCGAAAATTGCCTGCTCGAGCGGGGCCAACGGCTCCTAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAgg < 7:182111/134‑1 (MQ=255) tacGCACCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGCCATCCTTACGGTCGCgg > 1:80107/1‑136 (MQ=255) acGCACCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAggg < 3:103242/136‑1 (MQ=255) gCACCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTac > 3:181981/1‑97 (MQ=255) gCACCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTac < 4:181981/97‑1 (MQ=255) gCACCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGc > 7:67668/1‑135 (MQ=255) aCCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGaa > 4:82724/1‑136 (MQ=255) | TGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGGCCTGACCGTACACAATGTGCTCAAGGTGGACATCCTTACGGTCGAGGGCGAA > ACB122/4265965‑4266227 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |