Missing coverage evidence...
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*	*	÷	ACB122	5193572	5193712	141	19 [17]	[17] 19	[gltR_4]–[CJ019_04888]	[gltR_4],[CJ019_04888]

TGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGC  >  ACB122/5193442‑5193617                                                                                                                                  |                                               tgctgGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGc                                           <  5:84723/135‑1 (MQ=255) tgctgGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGc                                           <  4:193700/135‑1 (MQ=255) tgcggGAAGGGGTCCAGGCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGGGGGGGCGTGGGAGAGCGGGGGGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGc                                           <  5:185309/135‑1 (MQ=255) ggctgGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGc                                           <  7:373341/134‑1 (MQ=255)      gAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGCCCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATc                                      >  1:257337/1‑135 (MQ=255)           gtggCAGCCGCCGCCGAGCCGTGAGCTGGTGGGGGCGTGGCAGACCGGGGGGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGGTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCt                                 <  4:123585/132‑1 (MQ=255)           ggtGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGGGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGGGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCt                                 <  4:174732/133‑1 (MQ=255)           gTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGGGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCt                                 <  1:277018/135‑1 (MQ=255)              gtaGCCGACGCCGAGCCGTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGTCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTTGGCAGCGGATCGTGCTGGt                              <  2:369296/133‑1 (MQ=255)                aGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTc                             >  7:155985/1‑134 (MQ=255)                    gccgccgAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGAc                         >  4:149537/1‑134 (MQ=255)                        ccgAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATgtgggtgg                                                <  3:121161/107‑1 (MQ=255)                        ccgAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATgtgggtgg                                                >  4:121161/1‑107 (MQ=255)                        ccgAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACa                    >  1:256805/1‑135 (MQ=255)                        ccgAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACa                    <  1:265815/135‑1 (MQ=255)                              cTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTcc              <  2:12244/135‑1 (MQ=255)                                   gCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCt          >  5:69409/1‑134 (MQ=255)                                        tggtggCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGAGGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCg    <  8:252584/135‑1 (MQ=255)                                          gtggcgtggcAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCggg  >  3:97430/1‑134 (MQ=255)                                                                                                                                  |                                               TGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGC  >  ACB122/5193442‑5193617

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑