| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB122 | 4,029,454 | A→C | 27.3% | D287A (GAC→GCC) | mcpU_3 → | Methyl‑accepting chemotaxis protein McpU |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB122 | 4,029,454 | 0 | A | C | 27.3% | 98.2 / 6.9 | 74 | D287A (GAC→GCC) | mcpU_3 | Methyl‑accepting chemotaxis protein McpU |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (18/32); new base C (19/4); total (38/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.15e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TAGCCTGCAGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCTGGGGCG > ACB122/4029323‑4029588 | tAGCCTGCAGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCa < 3:420441/135‑1 (MQ=255) aGCCTGCAGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAg > 7:14297/1‑135 (MQ=255) aGCCTGCAGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAg > 4:114308/1‑135 (MQ=255) cTGCAGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTa < 3:448001/135‑1 (MQ=255) aGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCCCCCCGCTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCACGCTCGCCCAGCGCGTCGACCAGGTATAcc > 1:36481/1‑135 (MQ=255) aGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGACAGCAAGCTGGCCCAGCGCGTCGCCCAGGTAGccc > 7:466690/1‑135 (MQ=255) gCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCCGCGCTTCGACCAGGGAGACCCg > 3:289641/1‑135 (MQ=255) gAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCCGCCAGCTGGCCCCGCGCGTCGCCCAGGTAGCCCCGAccca > 7:347556/1‑133 (MQ=255) gCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAg < 5:328812/135‑1 (MQ=255) aggaggCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCCAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGGAGCCCCGACCAAAG‑gcg > 8:357387/1‑135 (MQ=255) ggCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCCGGGAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGa > 3:447950/1‑135 (MQ=255) ggCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCGGGCTACAGGGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGa < 2:431132/135‑1 (MQ=255) gCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCCCCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCCCCCACGTGGCCCAGCCCATGGACCAGGGAGCCCCGCCCAAAG‑GCGGCGAg > 1:103828/1‑135 (MQ=255) gCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGCTTCCCGCAAGCGGGCCCCGCGCGTCGACCAGGTAGACCCCACCAAAG‑GCCCCgc > 3:299767/1‑133 (MQ=255) gCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCCGCAAGCGGGCCCAGCGCGTCGCCCAGGTAGCCCCGCCCACAG‑GCCCCgcg > 3:294037/1‑133 (MQ=255) gCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCCGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGCCCCAAG‑GCGCCGAg > 8:411390/1‑135 (MQ=255) gCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGCCCAGGGAGCCCCGACCAAAG‑GCGCCGAg > 3:16951/1‑135 (MQ=255) aGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGGCGGTCGGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTg < 2:350317/135‑1 (MQ=255) gCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCCTTCTCCCCCCGGTCGGGCTGTTGGCTGGCTACACCGCCGCTGCCAGCAAGCTGCCCCCGCGCTTCGCCCAGGTAGCCCCGACCAAAC‑GCGCCGCGCAgg > 7:219961/1‑135 (MQ=255) gCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCCCCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCCGCGCGTCGCCCCGGGAGGCCCGCCCAAAG‑GCGCCGCGCTgg > 7:17818/1‑135 (MQ=255) cGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCCGCAAGCTGGCCCAGCGCGTCGCCCCGGGAGCCCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTg > 7:135517/1‑135 (MQ=255) cGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCCGCGCTTCGCCCAGGTAGACCCGCCCAAAC‑GCGCCGAGCTGGTg > 6:166937/1‑135 (MQ=255) tctACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCCGCCAGCTGGCCCCGCGCGTCGCCCAGGTAGACCCGCCCAAAG‑GCGCCGCGCTGGTGCGCAAGc > 5:398831/1‑135 (MQ=255) gAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGCCCAGGTAGCCCCGACCAAAG‑GCGCCGCGCTGGTGCGCAAGCTGGcc > 6:224183/1‑135 (MQ=255) gAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGcc > 8:441966/1‑135 (MQ=255) ggCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGAt < 3:409443/135‑1 (MQ=255) ggCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCGGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGAt < 4:410739/135‑1 (MQ=255) cGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCGTCGACCAGGGAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATgg > 3:294103/1‑134 (MQ=255) caccacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTTGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCaa > 3:126139/1‑135 (MQ=255) caccacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCaa < 7:441966/135‑1 (MQ=255) accacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAg > 7:296861/1‑135 (MQ=255) ccacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGCCCAGGTAGCCCCGCCCAAAG‑GCGCCGCGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGc > 8:42613/1‑135 (MQ=255) ccacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAACCTGGCCCCGCGCTTCGCCCAGGTAGCCCCGACCCAAG‑GCGCCGCGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGc > 6:166651/1‑135 (MQ=255) ccacGGTCGGCATTCTCACCCCCGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGAGGCCAGCAAACTGGGCCAGCCCGTGCTCCCCGTATACCCCCCCCAAG‑GCGGCCCGCATGGGCGCAATCAGGCCGATGGCCAGc > 6:5712/1‑135 (MQ=255) cacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCCGCCAGCTGGCCCAGCGCTTAGCCCCGGTAGACCCGCCACAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGCTGGCCAGCt > 8:30773/1‑135 (MQ=255) cacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCCGCGCGTCGCCCAGGTAGACCCGACCCAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGCTGGcccgct > 8:23554/1‑130 (MQ=255) cacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCt < 6:368508/135‑1 (MQ=255) cacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCt < 3:350529/135‑1 (MQ=255) cacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTGGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCt < 2:379464/135‑1 (MQ=255) cacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCGGTGGGCGGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCt < 7:411390/135‑1 (MQ=255) cGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGa < 5:204679/135‑1 (MQ=255) gTCGGCTTTCTCACCCCGGGCGGTCTGTTGGCGGGCTACTGCGCCGATGCCAGCAAGGTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGacc < 7:362800/135‑1 (MQ=255) tCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCCGCGCGTCGCCCAGGTAGCCCCGACCAACG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGacca > 8:259691/1‑135 (MQ=255) ctcACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTcccc > 8:467280/1‑133 (MQ=255) aCCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTGCGCCCAGGGAGACCCGCCCAAAG‑GCGCCCAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCCAGCTGACCCCCCTCCACGAc > 8:335543/1‑135 (MQ=255) ggtcTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAgcgc > 7:262397/1‑135 (MQ=255) ctACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAACG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTg < 8:325322/133‑1 (MQ=255) tACAGCGCCGATGCCCGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGCCCAGGTTGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCCAGCGGACCACCCTCCACGCCCGGCCGCGCGTGAAGGGGCTggcg > 3:139421/1‑135 (MQ=255) tACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGCGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTggcg > 8:141102/1‑135 (MQ=255) tACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCGTCGCCCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGCGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGCTGGCCAGCTGACCACCCGCCCCGCCCCGCAGCGCGTGAAGGTGCTggcg > 4:18055/1‑135 (MQ=255) cgcgcGGATGCCTGCAAGCTGGACCAGGGCTTCGACCAGGTACACCCGACCAACG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCGGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTggcggc < 6:190614/133‑1 (MQ=255) gcCGATGCCAGCAAGCTGGCCCCGCGCGTCGCCCAGGGTGACCCGCCCAAAG‑GCGCCGCGCAGGGGCGCCAGCTGGCCGCTGGCAAGCGGACCACCCACCACGCCCGGCAGCGCGTGAACGTGCTGGCGGCATTc > 2:458968/1‑135 (MQ=255) cggttGCCAGCACGCGGCCCAAGCTCTGCGCCCCGGTAGACCCCACCTACG‑GCTCCGAGAGGGTGCGCAAGCTGCCCGAGGGCAAGCTGCCCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTcc < 4:249965/131‑1 (MQ=255) ccAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGCCCAAAG‑GCGCCGAGCGGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCCCCACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCaa > 4:426813/1‑135 (MQ=255) cAGCAAGCGGGCCCAGCGCTTCGAACAGGTAGACCCGACCAACT‑GCGCCGAGCTGTTGCGCAAGCTGGCCTATGGAAAGCTGACCACACTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAAt < 7:357387/135‑1 (MQ=255) cacgCTGGCCCTGCGCTTCGACGAGGTCTACCCGACCAACG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGATGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATccc < 2:88674/132‑1 (MQ=255) cgggCCCAGGGCTACTCCCCGGTACCCCCTCCAAACG‑GCGCCGAGCGGGTGCGCATGGTGGCCGATGCCAAGCTGACCACCCGCCACGACCGGCAGCGCTTGACGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 2:430250/133‑1 (MQ=255) cgggCCCAGCGCTTCGACCAGGCAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCATGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 8:245028/133‑1 (MQ=255) cgggCCCAGCGCGTCGACCCGGTCGCCCCGCCCAACG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 8:128725/133‑1 (MQ=255) cggccccAGCGCTCCCACCTGGACCCCCCCACCACCG‑GCGCCGAGGTGGTGCGCAAGCTGGCCGAGGGAAAGCTCACCCCCCGCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 3:18055/131‑1 (MQ=255) cTGGCCCTGCGCTTCTCCCCGGAAGCCCCGCCCAACG‑GCGCCGAGCTGGGGCGCAAGCGGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 5:447150/135‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGGGTTTCGACCAGCAATACCCGACAAATG‑GCGCCGAGGTGGTGGGAAAGCTGGCCTATGGCAAGGTTACCACCCCCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 5:23663/135‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTCGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCGGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 8:241131/135‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 8:262397/135‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 7:318029/135‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGACCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 7:393027/135‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTACACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCTATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 8:14297/135‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGCGCTTCCACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑CCGCCGCGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 2:33671/135‑1 (MQ=255) cTGCCCCTGCGCTTCGCCCAGGTAGACCCCACCAAGC‑GCCCCGCGCTGGTGCGAAAGCTGGCCTATTGAAAGCTGACCCCCCACAAAGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 8:402484/135‑1 (MQ=255) tGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGCGCGCCGAGCTGGGGCGCACGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 2:167167/135‑1 (MQ=255) gcTTCGACCAGGTAGACCCGACCAACG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCt < 8:296861/135‑1 (MQ=255) ttCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCTgg > 4:363388/1‑135 (MQ=255) tCGACCCGGTCGACCCGCCACACG‑GGGCGGGGGGGGTGCGCAAGCGGGCCGAGGGCATGCTGCCCACCCTCCCCGACCGGCCGCGCGTGAAGGGGCGGGCGGCATGCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCTggg < 4:299767/135‑1 (MQ=255) gACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCGGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCTggg < 8:17818/133‑1 (MQ=255) caCCAGGAACACCCGACCAACG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCTgggg < 7:41128/133‑1 (MQ=255) aCCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCTGGGGCg > 4:459451/1‑135 (MQ=255) | TAGCCTGCAGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAG‑GCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCTGGGGCG > ACB122/4029323‑4029588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |