| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB122 | 4,329,199 | G→T | 5.8% | V75V (GTG→GTT) | aes → | Acetyl esterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB122 | 4,329,199 | 0 | G | T | 5.8% | 234.9 / 3.0 | 69 | V75V (GTG→GTT) | aes | Acetyl esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/25); new base T (2/2); total (42/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.41e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
ACCCAGGCCTTCCTCGAAGCCCTGGAGAAAGGGGGTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGTTCTTCCACGGCGGCGGTTGGGTGCTGGGCGACTTCCCGACCC > ACB122/4329068‑4329332 | acCCAGGCCTTCCTCGAAGCCCTGGAGAAAGGGGGTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCAAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGaa > 5:306507/1‑134 (MQ=255) cgcccTTCCGCGACGCCCTGTAGAAGGGGGGGGCAAACCCGCTGCAACTGCGCACCCAAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAAc < 7:225064/132‑1 (MQ=255) aGGCCTTCCTCGAAGCCCTGGAGAAAGGGGGTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAAc < 7:253308/135‑1 (MQ=255) aGGCCTTCCTCGAAGCCCTGGAGAAAGGGGGTGGCAAGCCGATGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAAc < 6:76317/135‑1 (MQ=255) cTTCCTCGAAGCCCTGGAGAAAGGGGGTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCa > 5:214794/1‑134 (MQ=255) ttCCTCGAAGCCCTGGAGAAAGGGGGTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACg < 4:439006/135‑1 (MQ=255) tCGAAGCCCTGGAGAAAGGGGGTGGCAAGCCGCTGGCACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTGCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGCACGCGCGAt > 6:81764/1‑133 (MQ=255) cGAAGCCCTGGAGAAAGGGGGTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCa > 1:18764/1‑135 (MQ=255) gAAGCCCTGGAGAAAGGGGGTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTTAAGGAACGCACGATTCAg > 4:310294/1‑135 (MQ=255) gAAGCCCTGGAGAAAGGGGGTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTTAAGGAACGCACGATTCAg > 4:316231/1‑135 (MQ=255) aGCCCTGGAGAAAGGGGGTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAgg > 1:282716/1‑134 (MQ=255) gCCTTGTAGAAGGGGGGGGGAAAGCGGTTGTAACTCCTCACCCCAACCGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAATGGTCGTCGTATCGGGGGTCGATGTGAAGGATCTCACGATTCAGGcc < 4:435163/135‑1 (MQ=255) ccTGGAGAAAGGGGCTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGCCCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCaa > 5:464156/1‑135 (MQ=255) gagaAAGGGGGTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATgg > 2:249672/1‑134 (MQ=255) agaAAGGGGGTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGATTCGGTAAAGGTCGACCTATCGTGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCAAATgg > 3:298954/1‑133 (MQ=255) gggggTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCg < 2:330598/135‑1 (MQ=255) gggTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGa > 3:105167/1‑134 (MQ=255) gggTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGAt < 3:117539/135‑1 (MQ=255) gggTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGAt < 2:282716/135‑1 (MQ=255) aGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAAc < 2:398939/99‑1 (MQ=255) aGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAAc > 1:398939/1‑99 (MQ=255) cTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCg < 5:12507/135‑1 (MQ=255) acacCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCCGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGAc > 7:219784/1‑134 (MQ=255) acgCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAg > 8:300055/1‑135 (MQ=255) cgcgcgGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAAc > 8:374886/1‑67 (MQ=255) cgcgcgGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAAc < 7:374886/67‑1 (MQ=255) cgcgcgGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGAt > 5:339277/1‑135 (MQ=255) gcgcgGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATc < 6:339277/135‑1 (MQ=255) gcgcgGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATc < 6:379929/135‑1 (MQ=255) gcgcgGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATc < 5:127585/135‑1 (MQ=255) gcgGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTg < 6:419396/135‑1 (MQ=255) cgGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTTAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGc < 3:316231/135‑1 (MQ=255) cgGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTTAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGc < 3:310294/135‑1 (MQ=255) cgGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGc < 4:105167/135‑1 (MQ=255) ggTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGca > 6:321019/1‑134 (MQ=255) tACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACTATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTTGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCgg < 8:428441/135‑1 (MQ=255) tGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGgtgt < 7:300055/135‑1 (MQ=255) ccGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTc < 2:60867/134‑1 (MQ=255) ggTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAAc < 1:135879/52‑1 (MQ=255) ggTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAAc > 2:135879/1‑52 (MQ=255) ggTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATg > 3:196328/1‑135 (MQ=255) ggTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATg > 3:216520/1‑135 (MQ=255) ggTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGAGCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGGTCATg > 1:350569/1‑135 (MQ=255) cccAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGttct > 5:116665/1‑135 (MQ=255) ccAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGa < 2:309523/74‑1 (MQ=255) ccAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGa > 1:309523/1‑74 (MQ=255) ccAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGttctt > 7:226938/1‑135 (MQ=255) ccAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGttctt > 4:140883/1‑135 (MQ=255) ccAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGttctt > 1:138515/1‑135 (MQ=255) ccAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGttctt > 5:95309/1‑135 (MQ=255) ccAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGttctt > 5:81290/1‑135 (MQ=255) ttCGGTAAAGGGCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGTTCTTCCAcgg < 7:51549/135‑1 (MQ=255) gTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCACGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGTTCTTCCAcggcggc > 2:251540/1‑135 (MQ=255) gTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATc < 6:292075/106‑1 (MQ=255) gTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATc > 5:292075/1‑106 (MQ=255) gTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCCTGTTCTTCCAcggcggc > 5:65390/1‑135 (MQ=255) gTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGTTCTTCCAcggcggc > 3:383962/1‑135 (MQ=255) gACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGTTCTTCCACGGCGGCGGTTGGGTg > 6:90413/1‑135 (MQ=255) cTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGGTCATGTTCTTCCACGGCGGCGGTTGGGTGCTg > 4:106725/1‑135 (MQ=255) tATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGc > 8:368307/1‑57 (MQ=255) tATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGc < 7:368307/57‑1 (MQ=255) tATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGTTCTTCCACGGCGGCGGTTGGGTGCTgg > 3:313269/1‑135 (MQ=255) ggggTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCg > 5:141601/1‑69 (MQ=255) ggggTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCg < 6:141601/69‑1 (MQ=255) ggggTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGTTCTTCCACGGCGGCGGTTGGGTGCTGGGCGAc > 5:63555/1‑135 (MQ=255) gAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGTTCTTCCACTGAGGCGGTTGGGTGCTGGGCGACTTCCCg > 2:401237/1‑135 (MQ=255) gAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGTTCTTCCACGGCGGCGGTTGGGTGCTGGGCGACTTCCCg > 5:30101/1‑135 (MQ=255) tGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGTTCTTCCACGGCGGCGGTTGGGTGCTGGGCGACTTCCCGAccc > 7:48781/1‑135 (MQ=255) tGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGTTCTTACACGGCGGCGGTTGGGTGCTGGGCGACTTCCCGAccc > 5:187169/1‑135 (MQ=255) | ACCCAGGCCTTCCTCGAAGCCCTGGAGAAAGGGGGTGGCAAGCCGCTGGAACAGCTCACACCAAACGACGCCCGCGCGGTACTGACCGGTGCCCAGGCTTCGGTAAAGGTCGACCTATCGGGGGTCGAGGTGAAGGAACGCACGATTCAGGCCAATGGCCAGTCGATCAAGCTGCAAGTGGTGCGCCCGACTAATGTCAAAGGTGATCTGCCGGTGTTCATGTTCTTCCACGGCGGCGGTTGGGTGCTGGGCGACTTCCCGACCC > ACB122/4329068‑4329332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |