Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | ACB122 | 5,778,681 | C→T | 5.5% | T343T (ACC→ACT) | selO → | Protein adenylyltransferase SelO |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB122 | 5,778,681 | 0 | C | T | 5.5% | 242.5 / 3.1 | 73 | T343T (ACC→ACT) | selO | Protein adenylyltransferase SelO |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/26); new base T (2/2); total (44/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.40e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.49e-01 |
ACCTCAGCGCGCTGGCCCAGGCACTGACCACCGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAGGCGCTGAAGGTGGCGCGCGAT > ACB122/5778548‑5778813 | aCCTCAGCGCGCTGGCCCAGGCACTGACCACCGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCAccg > 1:96163/1‑135 (MQ=255) gcgcgcTGGCCCAGGCACTGACCACCGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGTCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGa < 7:243285/133‑1 (MQ=255) cgcgcTGGCCCAGGCACTGACCACCGTGATCGAAGTTGAGCCACTGTAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAga < 6:184810/135‑1 (MQ=255) cgcgcTGGCCCAGGCACTGACCACCGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAga > 3:50284/1‑135 (MQ=255) cgagatGGACCAGGCACTGACCACCGTGATCGTTCTTTAGCGTCTGATGGTTGGGTGGGGCCTGTTCGTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGGGGGCGCGTAGGGCTGATCACAGCCGTAga < 8:444466/130‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCCAGGCACTGACCACCGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCCTTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAga > 6:168882/1‑134 (MQ=255) cgcTGGCCCAGGCACTGACCACCGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGCTGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCCCCGCCGAAgatg > 2:145687/1‑135 (MQ=255) cTGGCCCAGGCACTGACCACCGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAgatgat < 5:27542/135‑1 (MQ=255) ggCCCAGGCACTGACCACCGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGAtgatga < 3:429865/135‑1 (MQ=255) gCCCAGGCACTGACCACCGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGAc > 6:85672/1‑135 (MQ=255) cccAGGCACTGACCACCGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGCCCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGCCCCCCGCCGAAGAGGATGACa > 1:420100/1‑135 (MQ=255) aCTGACCACCGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCt > 7:69627/1‑135 (MQ=255) accGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAg < 3:184682/135‑1 (MQ=255) accGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAg > 3:229237/1‑135 (MQ=255) accGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAg > 3:25889/1‑135 (MQ=255) accGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAg > 4:46179/1‑135 (MQ=255) accGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAg > 1:131012/1‑135 (MQ=255) ccGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGGTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCTTTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAgc < 6:155907/135‑1 (MQ=255) gATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAga < 2:352509/108‑1 (MQ=255) gATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAga > 1:352509/1‑108 (MQ=255) aaGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCGGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCtgctgc < 6:348436/135‑1 (MQ=255) tggAGCCACTGACGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGt < 7:321004/133‑1 (MQ=255) gAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGtgc < 6:202477/135‑1 (MQ=255) cACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGtgcatg > 6:211948/1‑134 (MQ=255) cACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCAGCTGTACCACGACCATTACCTGGACCTGATGCTCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCCAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGATCGCCTGCTGCACtgcatg > 8:62790/1‑134 (MQ=255) tGAAGGAAGCGTTGGGCCGGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGCCCTGACGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAAc < 1:240971/135‑1 (MQ=255) aggaagCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAAcg < 4:460508/133‑1 (MQ=255) aagCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTg < 4:25889/135‑1 (MQ=255) agCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTgg < 2:243979/135‑1 (MQ=255) gTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGt < 8:147451/135‑1 (MQ=255) gTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACAAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGt > 6:165152/1‑135 (MQ=255) tGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAAc < 8:280334/123‑1 (MQ=255) tGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAAc > 7:280334/1‑123 (MQ=255) tGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTgg > 8:44189/1‑135 (MQ=255) gCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGAtgatga > 2:53435/1‑82 (MQ=255) gCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGAtgatga < 1:53435/82‑1 (MQ=255) ccTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGCCCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCt > 4:140512/1‑135 (MQ=255) ccTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACTGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCt > 3:115083/1‑135 (MQ=255) ccTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACTGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCt > 3:108729/1‑135 (MQ=255) ccTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCt > 6:383962/1‑135 (MQ=255) cTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCCCCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGCCTACAGCCTg > 1:306967/1‑135 (MQ=255) cTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACTGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCt < 4:115083/134‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACTGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCt < 4:108729/134‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTg > 2:36841/1‑135 (MQ=255) cGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGttc < 1:36841/134‑1 (MQ=255) gCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCAGGCGCCTAGGGCTGCCCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACCGCCTGgtctt > 3:201021/1‑135 (MQ=255) aCCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCGTGTTCTTCCg < 3:46179/133‑1 (MQ=255) cAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATCGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCGTCCGCaaa > 2:41559/1‑135 (MQ=255) cAGGCCCATTACCTGGACATGATGCGCCGGCGCCTAGAGCTGACCACCGCCGAAGATGAAGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCAGCaaa > 2:41553/1‑135 (MQ=255) ccATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATTATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCctg > 1:226184/1‑79 (MQ=255) ccATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCctg < 2:226184/79‑1 (MQ=255) ccATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTggg > 1:65485/1‑135 (MQ=255) aCCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGa > 6:433573/1‑133 (MQ=255) aCCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGa > 5:206594/1‑133 (MQ=255) aCCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGa > 2:58869/1‑133 (MQ=255) aCCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGAGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACGACAGCCTGATCTTCCGCAAACTGGGGGa > 6:332743/1‑133 (MQ=255) aCCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACAACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTAGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGAGTGGACTACAGCCAGTTCTTACGCACACTGGGTGagc > 1:304038/1‑135 (MQ=255) ccTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGCCCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCg > 7:296162/1‑133 (MQ=255) cTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTa > 7:328187/1‑135 (MQ=255) cTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTa > 2:5291/1‑135 (MQ=255) cTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATCACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTa > 2:13379/1‑135 (MQ=255) tGATGCGCCGGCGCCTCGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAg < 4:427904/135‑1 (MQ=255) tGATGCGCCGGCGCCGAGGGCGGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAg < 1:207937/135‑1 (MQ=255) gcgcCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGCCATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGAGCATGCAACGCGGTGGCGAGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGa > 4:321420/1‑135 (MQ=255) gcgcCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGa > 4:115368/1‑135 (MQ=255) cgcCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACCGCCTGGTCTTCCGCAAACGGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAg > 1:113960/1‑135 (MQ=255) cgcCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAg > 2:88422/1‑135 (MQ=255) cgcCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAg > 4:15017/1‑135 (MQ=255) cgcCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTATTACGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCgcg > 7:167894/1‑133 (MQ=255) gcCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAg < 6:206594/134‑1 (MQ=255) cgcCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAGGCGCTg < 7:44189/135‑1 (MQ=255) gcCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAGGCGCt > 8:12203/1‑133 (MQ=255) tcgggCTGACCACCGCCGAAGAGGAGGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGGGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAGGCGCTGAAgg < 6:44878/133‑1 (MQ=255) tAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAGGCGCTGAAgg < 5:211948/135‑1 (MQ=255) ccaccGCCTAAGATGAGGACATGGTGCTGGGCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAGGCGCTGAAGGTGgcgcg < 4:96208/133‑1 (MQ=255) ccaccGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAGGCGCTGAAGGTGgcgcg < 3:15017/133‑1 (MQ=255) caccGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAGGCGCTGAAGGTGGCGCGCGa < 5:168882/135‑1 (MQ=255) accGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCTCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACGACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAGGCGCTGAAGGTGGCGCGCGa > 3:448340/1‑134 (MQ=255) accGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAGGCGCTGAAGGTGGCGCGCGa > 7:209790/1‑134 (MQ=255) accGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAGGCGCTGAAGGTGGCGCGCGa > 6:302695/1‑134 (MQ=255) accGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAGGCGCTGAAGGTGGCGCGCGAt > 4:235773/1‑135 (MQ=255) | ACCTCAGCGCGCTGGCCCAGGCACTGACCACCGTGATCGAAGTTGAGCCACTGAAGGAAGCGTTGGGCCTGTTCCTGCCGCTGTACCAGGCCCATTACCTGGACCTGATGCGCCGGCGCCTAGGGCTGACCACCGCCGAAGATGATGACATGGTGCTGGTCGAGCGCCTGCTGCAGTGCATGCAACGCGGTGGCGTGGACTACAGCCTGTTCTTCCGCAAACTGGGTGAGCAGCCGGTAGCCGAGGCGCTGAAGGTGGCGCGCGAT > ACB122/5778548‑5778813 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |