| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB122 | 1,716,354 | T→C | 5.5% | L644P (CTG→CCG) | mdtB_1 → | Multidrug resistance protein MdtB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB122 | 1,716,354 | 0 | T | C | 5.5% | 216.4 / 3.5 | 73 | L644P (CTG→CCG) | mdtB_1 | Multidrug resistance protein MdtB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/37); new base C (2/2); total (34/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.63e-01 | |||||||||||
CTACGTGGCCTATGTGGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGCATATCGAGAAGGCCCGTGCACTGGCCC > ACB122/1716220‑1716488 | cTACGTGGCCTATGTGGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCt < 8:167574/135‑1 (MQ=255)cTACGTGGCCTAGGTGGGCACCGGTGCGCCGCGCGTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCt < 1:384217/135‑1 (MQ=255) cGTGGCCTATGTGGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACAAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGGTGGCTGAt > 2:133654/1‑135 (MQ=255) gTGGCCTATGTGGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGCCCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGa > 2:284941/1‑133 (MQ=255) gTGGCCTATGTGGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGa > 5:81506/1‑133 (MQ=255) gTGGCCTATGTGGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGGTGGCTgc > 2:208921/1‑132 (MQ=255) ggCCTATGTGGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAg > 4:272897/1‑135 (MQ=255) ggCCTATGTGGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAg > 5:292734/1‑135 (MQ=255) ccTATGTGGGCACCGGGTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGGCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCa < 3:32220/135‑1 (MQ=255) tATGTGGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGCAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACg > 7:83365/1‑135 (MQ=255) gtgGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATTGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTg < 5:371457/135‑1 (MQ=255) gtgGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTg < 3:431049/135‑1 (MQ=255) tgGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTgg > 8:355696/1‑135 (MQ=255) tgGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTgg > 7:56754/1‑135 (MQ=255) tgGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCCGATCAGCACGGTgg > 5:111726/1‑135 (MQ=255) tgGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCCGATCAGCACGGTgg > 5:118366/1‑135 (MQ=255) tgGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCACTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATGAGCACGGTgg > 1:186288/1‑135 (MQ=255) cACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACca < 2:135474/135‑1 (MQ=255) cACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACca < 7:464433/135‑1 (MQ=255) cACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGACAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACca < 5:45896/135‑1 (MQ=255) cGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACcagca > 4:408770/1‑135 (MQ=255) cGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACca > 2:31565/1‑132 (MQ=255) cGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACca < 1:31565/132‑1 (MQ=255) gTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCAGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACcagcag > 2:74885/1‑134 (MQ=255) tCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCACCTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGCCCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTc > 1:421549/1‑135 (MQ=255) tCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGCCCAGCAGTTc > 2:103360/1‑135 (MQ=255) tCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTc > 8:344381/1‑135 (MQ=255) cgcgCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGGTGGCTGATCAGCACGGTGGACCCTCAGTTCCCCg > 4:335669/1‑135 (MQ=255) cgcTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGAc < 4:111713/135‑1 (MQ=255) cTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTgcgc < 4:388635/132‑1 (MQ=255) cGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCCGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCggg < 6:118366/135‑1 (MQ=255) cGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCCGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCggg < 6:111726/135‑1 (MQ=255) gTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCggg > 5:441905/1‑134 (MQ=255) tGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGGTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGCTGGAAGCCCGCGCGCGCCTGCGCAGGTGGGTGAGCAGCCCGGTGGACCCGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTcc > 2:189273/1‑134 (MQ=255) ccAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCAcgcg > 7:285085/1‑135 (MQ=255) aGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGcc > 8:274514/1‑135 (MQ=255) cGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTGGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACg < 7:274514/135‑1 (MQ=255) cGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACg < 6:441905/135‑1 (MQ=255) cGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTGGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACg < 8:442422/135‑1 (MQ=255) cGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTGCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACg < 6:194228/135‑1 (MQ=255) cGGCAGCCAGCTTGGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACg < 3:120357/135‑1 (MQ=255) cGGCAGCCAGCTTGGCCCAGTGCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGACGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTGCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACg < 7:240864/135‑1 (MQ=255) gccagcTTTGCCCTGTTCTTGTTGCTGGCCAAGGCGCTGGAAGACCGGGAGCGCCTGCGGAGTTGGATGATCAGCACGGTGGACCTGCAGCTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGgcccg < 2:305299/135‑1 (MQ=255) gccagcTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGgcccg < 3:377132/135‑1 (MQ=255) gccagcTTTGCCCAGTGCGTGGGGCGGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTTATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGgcccg < 3:393233/135‑1 (MQ=255) gcTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGcccgcccg > 3:176411/1‑135 (MQ=255) ccccGTTCGTGGGGCGGGCCAAGTCGATGGAACACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCt < 7:201010/135‑1 (MQ=255) aGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTccc > 4:59394/1‑135 (MQ=255) aGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTAcc > 5:455967/1‑135 (MQ=255) gTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCGCGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTAccc > 3:208459/1‑135 (MQ=255) gtggtgCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGACTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGt > 1:38817/1‑134 (MQ=255) gtgtTGGCCAAGTCGTTGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGAGCAGCAGGGTGGACCAGCTGTTCCCGGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAg < 1:74885/135‑1 (MQ=255) gggCTGGCAAAGGCTTTGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGAAGTTGGCTTATCAGCAGGGTGGACCAGCATTTCCACGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGTAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAg < 5:183308/133‑1 (MQ=255) gcgggCCACGGCGAGGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGAGCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGtt < 6:324103/132‑1 (MQ=255) gCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCgg > 5:55527/1‑135 (MQ=255) ccAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCggg > 8:44827/1‑135 (MQ=255) aaGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCCCGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTc > 6:308221/1‑135 (MQ=255) gATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCCCGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTgg > 7:67605/1‑135 (MQ=255) gATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGACAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTgg > 1:373758/1‑135 (MQ=255) aTGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTgg < 8:18888/134‑1 (MQ=255) aTGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGc < 8:34410/135‑1 (MQ=255) acgACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGc < 4:72200/133‑1 (MQ=255) aaGCCCGCGAGCGCCTGCGCTGTTGGCTGAGCAGCACGGGGGACCAGCAGTGCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGc < 1:153644/135‑1 (MQ=255) aaGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGc < 3:371535/135‑1 (MQ=255) aaGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGAGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCACTTCCGGGTCACTGGCGAg > 2:231119/1‑134 (MQ=255) cgcgAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGCATATc < 7:355696/135‑1 (MQ=255) cgcgAGCGCCTGCGCAGTGGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGCATATc < 6:237522/135‑1 (MQ=255) cgtgcgcCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGTACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGCATATCga < 6:393075/132‑1 (MQ=255) cgAGCGCCTGCTCAGTTGGCTGAGCAGCACGGTGGACCAGCTGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGCATATCga < 1:138270/135‑1 (MQ=255) cgAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGCATATCga < 6:448733/135‑1 (MQ=255) cgAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGCATATCga < 4:176411/135‑1 (MQ=255) cgAGCGCCTGCGATGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTGCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGCATATCga < 1:133118/135‑1 (MQ=255) gcCTGGGCAGTTGGCTGAGCAGCACGGGGGACCCGCAGTTCCCCGCCCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGCATATCGAGAAgg < 3:335669/135‑1 (MQ=255) gcCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGCATATCGAGAAgg < 4:328586/135‑1 (MQ=255) gcCGGCGCTGTTGGCTGAGCAGCACGGTGCACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGCATATCGAGAAgg < 6:292734/135‑1 (MQ=255) tGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGCATATCGAGAAGGCCCGTGCACTGGccc > 8:196848/1‑135 (MQ=255) | CTACGTGGCCTATGTGGGCACCGGTTCGCCGCGCTTCTACCTGCCGTTGGACCAGCAACTGCCGGCAGCCAGCTTTGCCCAGTTCGTGGTGCTGGCCAAGTCGATGGAAGACCGCGAGCGCCTGCGCAGTTGGCTGATCAGCACGGTGGACCAGCAGTTCCCCGACCTGCGCGCCCGGGTCACGCGCCTGGAAAACGGCCCGCCCGTGGGCTACCCGGTGCAGTTCCGGGTCACTGGCGAGCATATCGAGAAGGCCCGTGCACTGGCCC > ACB122/1716220‑1716488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |