| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB122 | 3,697,188 | G→A | 5.4% | P624L (CCG→CTG) | paaZ_2 ← | Bifunctional protein PaaZ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB122 | 3,697,188 | 0 | G | A | 5.4% | 245.4 / 3.0 | 74 | P624L (CCG→CTG) | paaZ_2 | Bifunctional protein PaaZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/39); new base A (2/2); total (33/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.52e-01 | |||||||||||
CCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGTAACCGTGGGCAATGCGTTTACCGAACTGCGAGGCCTTG > ACB122/3697059‑3697322 | cccAGCTGATTGGTTACTTCCACATCGCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCGGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGtt < 4:203836/134‑1 (MQ=255)cccAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGtt < 8:117287/134‑1 (MQ=255) ccAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTtga > 8:345743/1‑135 (MQ=255) tGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAg < 4:102951/135‑1 (MQ=255) tACTTCCACCTCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGgt < 1:324271/135‑1 (MQ=255) tACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGgt < 3:239222/135‑1 (MQ=255) tACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGgt < 7:245969/135‑1 (MQ=255) tACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGgt < 1:363783/135‑1 (MQ=255) tACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGgt < 2:28252/135‑1 (MQ=255) tACTTCCACATCACACGCCACCACCACCTGCGGCAGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGAGCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGgt < 2:299156/135‑1 (MQ=255) tCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCGGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTcc > 3:13567/1‑135 (MQ=255) cacaTCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAg < 3:303190/135‑1 (MQ=255) tCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCa < 5:422976/135‑1 (MQ=255) tCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCa < 4:141867/135‑1 (MQ=255) tCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCa < 4:13567/135‑1 (MQ=255) tCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCa < 7:158800/135‑1 (MQ=255) tCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCa < 2:388896/135‑1 (MQ=255) tCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGGTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCa < 7:118677/135‑1 (MQ=255) tCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCGTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCa < 5:415051/135‑1 (MQ=255) tCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCGGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCa < 3:311766/135‑1 (MQ=255) cccACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCAt < 1:365131/135‑1 (MQ=255) gCCACCACCACCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGGCGATCTTGCGCTTGCAGGTCTGGCGCGCCTGGATTGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTg < 1:153250/135‑1 (MQ=255) ccccTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGCGTTGATGAACCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAAtcc > 5:119323/1‑133 (MQ=255) gCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTc > 3:59914/1‑135 (MQ=255) ggCTGCCCCCGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGCTCTTGCGCGTGCAGGTCCGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCACTGCCCCCCGGGTTGCTGCAGCGCAGGGTGGACCGCCCATAGTTGGCCAATCCCGGTCCg > 6:106419/1‑135 (MQ=255) ggCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCg > 4:334547/1‑135 (MQ=255) ggCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCg > 6:192047/1‑135 (MQ=255) ggCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCAAGCCGATAGTTGGCCAATACAGGTCCg > 8:97477/1‑135 (MQ=255) ggCTGCCCCAGCGGGCTGGGCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCCGGCGCGCCGGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGGTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGGTGGCCAAGACCCGTCCg > 1:422475/1‑135 (MQ=255) cTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGgc > 1:111335/1‑135 (MQ=255) ccccAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGGCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGcc > 6:63552/1‑135 (MQ=255) ccccAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGgt < 1:383572/99‑1 (MQ=255) ccccAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGgt > 2:383572/1‑99 (MQ=255) ccgaGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCGAGCCCTTAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCg < 6:163129/132‑1 (MQ=255) cAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCggg > 5:95397/1‑135 (MQ=255) cAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCggg > 5:14596/1‑135 (MQ=255) cAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCggg < 4:219699/135‑1 (MQ=255) cAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGGTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAAGACCGGTCCGGCGCCggg > 4:216954/1‑135 (MQ=255) tCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACa > 2:148368/1‑135 (MQ=255) tCTTCCCCTGGTCCATCTAGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCAAATTCCCACAGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGACCAGCCCATAGTTGGCCAATACAGGTCCGGCGCCGGACGACACGAAcc > 2:142906/1‑134 (MQ=255) ccTGGTCGATCTTGCGGTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGTATGGTATCCCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCCCCCCATAGTTGGCCACTACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCgg < 2:400437/135‑1 (MQ=255) cGATCTTGCGCTTGCAGGTCTGGCGCGCCTGGAGGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGACGCGCTGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTg < 3:420958/135‑1 (MQ=255) cGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTg > 5:461855/1‑135 (MQ=255) cGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCAGGTTGATGAAGCGCAggg < 8:86851/72‑1 (MQ=255) cGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCAGGTTGATGAAGCGCAggg < 8:448913/72‑1 (MQ=255) cGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCAGGTTGATGAAGCGCAggg > 7:86851/1‑72 (MQ=255) cGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCAGGTTGATGAAGCGCAggg > 7:448913/1‑72 (MQ=255) gATCTTGCGCTTTCAGGTCAGGAGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCTCGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTACGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCTGCCGCTGc > 5:55018/1‑135 (MQ=255) gATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGc > 8:141268/1‑135 (MQ=255) gATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGc < 7:345743/135‑1 (MQ=255) gATCTTGCGCTTGCAGCTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGCTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGCTCCGCCGCCGGGCGCCACGAACAGCCCGGCCGCTGc > 4:162816/1‑135 (MQ=255) gATCTTGCGCTGGCAGGGCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGc < 3:346772/135‑1 (MQ=255) tGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGgt > 6:68933/1‑67 (MQ=255) tGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGgt < 5:68933/67‑1 (MQ=255) cgcTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGGATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGAc < 7:105288/132‑1 (MQ=255) cgcTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGAGGGTCTCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACa < 4:231906/133‑1 (MQ=255) cgcTTGCAGGGCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGGTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACa < 5:368569/133‑1 (MQ=255) ttGCCGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGGTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACg < 7:387931/135‑1 (MQ=255) ttGCAGGGCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACACTACg < 1:386019/135‑1 (MQ=255) aGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGt < 2:111335/135‑1 (MQ=255) ggTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCATGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTCCGAAGTa > 2:352853/1‑135 (MQ=255) ggTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGTa > 1:67762/1‑135 (MQ=255) gcgcGTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGTAACCGTggg < 2:67762/135‑1 (MQ=255) aTGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGTAACCGTGGGCAATGCGt < 1:148368/135‑1 (MQ=255) tATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGTAACCGTGGGCAATGCGTTTa < 4:59914/134‑1 (MQ=255) cGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCg > 3:86609/1‑65 (MQ=255) cGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCg < 4:86609/65‑1 (MQ=255) cGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGCCACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGTAACCGTGGGCAATGCGTTTACCGa > 4:403632/1‑135 (MQ=255) cGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGTAACCGTGGGCAATGCGTTTACCgc > 2:17720/1‑134 (MQ=255) cGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGCGCGCCACGAACAGCCCGTCCGCTGCAGACAGTACGAAGTAACCGTGGGCAATGCGTTTACCGa > 4:163885/1‑135 (MQ=255) ccAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGgcgc > 7:395173/1‑67 (MQ=255) ccAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGgcgc < 8:395173/67‑1 (MQ=255) aTGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCGGCCGACAGTACGAAGTACCCGGGGGCAATGCGTTTACCGAACTGc > 1:230282/1‑135 (MQ=255) ccACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGCCACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGTAACCGTTGGCAATGCGTTTACCGAACTGCGAgg > 1:400382/1‑135 (MQ=255) gggTTGATGAAGCGCCGGGTGTACAGCCCATAGATGGCCAATCCCGGGCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCGGCCGACAGTACGAAGTAACCGTGGGCAATGCGTTTACCGAACTGCGAGGCCTTg < 2:339190/135‑1 (MQ=255) gggTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGCCAGTACGAAGTAACCGTGGGCAATGCGTTTACCGAACTGCGAGGCCTTg > 1:144722/1‑135 (MQ=255) gggTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGTAACCGTGGGCAATGCGTTTACCGAACTGCGAGGCCTTg > 5:302631/1‑135 (MQ=255) | CCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGTAACCGTGGGCAATGCGTTTACCGAACTGCGAGGCCTTG > ACB122/3697059‑3697322 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |