Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | ACB122 | 3,957,240 | C→T | G137R (GGG→AGG) | dmlR_13 ← | HTH‑type transcriptional regulator DmlR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB122 | 3,957,240 | 0 | C | T | 97.3% | 259.4 / ‑1.9 | 73 | G137R (GGG→AGG) | dmlR_13 | HTH‑type transcriptional regulator DmlR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (38/33); total (39/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.60e-01 |
GCTCCGGTACACCGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAAC > ACB122/3957111‑3957365 | gcTCCGGTACACCGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGc < 7:403172/136‑1 (MQ=255) cTCCGGTACACCGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGc < 1:269757/135‑1 (MQ=255) tCCGGTACACCGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCCCGTCATGCCTTTCGGc > 8:135347/1‑134 (MQ=255) tCCGGTACACCGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCgg > 1:246807/1‑133 (MQ=255) ggTACACCGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCg < 7:426733/136‑1 (MQ=255) gggTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGt > 6:403541/1‑135 (MQ=255) gggTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGt > 1:270041/1‑135 (MQ=255) ggTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGtt < 3:317617/135‑1 (MQ=255) gtgtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACTCCGATCAGTTGCGAATCCGTCAGCGCACCGTCCACGGTGATCAGCACGTCATGCCTTTCGGCCTGCGGGTCGGGCTTg > 6:271813/1‑135 (MQ=255) gtgtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTgc > 7:240063/1‑136 (MQ=255) gtgtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTgc > 8:60789/1‑136 (MQ=255) gtgtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTgc > 8:402027/1‑136 (MQ=255) gtgtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTg > 3:60343/1‑135 (MQ=255) gtgtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTg > 2:362194/1‑135 (MQ=255) gtgtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTg > 2:265326/1‑135 (MQ=255) gtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTgcg > 4:287664/1‑135 (MQ=255) gtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTgcg > 3:208144/1‑135 (MQ=255) cAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTg < 4:245072/135‑1 (MQ=255) cAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGATGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGGTGCGCTg < 7:445996/135‑1 (MQ=255) aGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGc > 5:438131/1‑135 (MQ=255) aGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGc > 2:387527/1‑135 (MQ=255) ggTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCg > 1:251782/1‑135 (MQ=255) gTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGa > 1:364675/1‑135 (MQ=255) cGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCg > 5:130732/1‑135 (MQ=255) gggggCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCg > 3:57434/1‑134 (MQ=255) gggCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCa > 6:367169/1‑135 (MQ=255) gggCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCa < 1:23776/135‑1 (MQ=255) cgcAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGa < 4:218695/135‑1 (MQ=255) ggATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATcaccac < 8:75240/136‑1 (MQ=255) gATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATcaccac < 2:270041/135‑1 (MQ=255) tGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCg < 3:287664/135‑1 (MQ=255) gAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCggg > 8:405303/1‑136 (MQ=255) gAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCgg > 1:321359/1‑135 (MQ=255) aaTATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATGCGGCAGCGCACCGTCGACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGt < 3:346068/134‑1 (MQ=255) tatTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAg > 8:349932/1‑136 (MQ=255) ccAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCAtgtt > 7:294350/1‑136 (MQ=255) ccAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCAtgtt > 7:79888/1‑136 (MQ=255) ccAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCAtgt > 4:383615/1‑135 (MQ=255) cAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCAtgtt > 1:396872/1‑135 (MQ=255) ggCACAGCGAGCAGTGGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAg < 1:175375/135‑1 (MQ=255) cacaGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCt < 1:213997/86‑1 (MQ=255) cacaGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCt > 2:213997/1‑86 (MQ=255) aTCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGccacca < 7:59949/136‑1 (MQ=255) tCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGGCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGccacca < 5:231907/135‑1 (MQ=255) gTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGc < 2:364675/134‑1 (MQ=255) aaTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 8:176347/136‑1 (MQ=255) aaTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 7:402027/136‑1 (MQ=255) aaTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 7:31251/136‑1 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCCCCAGCGGCATCAGc > 7:308724/1‑136 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 4:349402/135‑1 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTa > 5:43182/1‑102 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTa < 6:43182/102‑1 (MQ=255) ccGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCa < 4:60343/135‑1 (MQ=255) gcgcACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGccc < 7:16876/136‑1 (MQ=255) gcgcACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGccc < 8:265271/136‑1 (MQ=255) cgcACCTTCCACGGTGATCACCACGGCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGccc < 5:170497/135‑1 (MQ=255) cgcACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGccc < 1:79531/135‑1 (MQ=255) cgcACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGccc < 5:403541/135‑1 (MQ=255) cACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCa < 3:383615/135‑1 (MQ=255) aCCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGc < 4:396744/70‑1 (MQ=255) aCCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGc > 3:396744/1‑70 (MQ=255) aCGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCg < 7:349932/136‑1 (MQ=255) aCGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACACCCCCATGCCTTGCg > 8:334573/1‑136 (MQ=255) aCGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGGAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGc > 4:184844/1‑135 (MQ=255) aCGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCGGCGACAGCGGCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCg < 8:15263/136‑1 (MQ=255) caccacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTg < 3:543/135‑1 (MQ=255) caccacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTg < 2:246807/135‑1 (MQ=255) accacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTg > 5:7894/1‑134 (MQ=255) ccacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGc > 6:263199/1‑134 (MQ=255) ccacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGc > 6:219888/1‑134 (MQ=255) ccacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGc > 2:232830/1‑134 (MQ=255) aTGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAAc > 4:427240/1‑131 (MQ=255) aTGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAAc > 1:254606/1‑131 (MQ=255) | GCTCCGGTACACCGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAAC > ACB122/3957111‑3957365 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |