| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB122 | 1,021,440 | A→T | 5.5% | F117Y (TTC→TAC) | dppA_3 ← | Periplasmic dipeptide transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB122 | 1,021,440 | 0 | A | T | 5.5% | 258.4 / 4.0 | 83 | F117Y (TTC→TAC) | dppA_3 | Periplasmic dipeptide transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/36); new base T (3/2); total (45/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.46e-01 | |||||||||||
TTCACCGTGTGCTCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCGTCGTCGGACACTTCCCATTTGGTC > ACB122/1021308‑1021562 | ttCACCGTGTGCTCGTCAAGCTTCTCCACCTTCGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTAGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACa > 4:30298/1‑136 (MQ=255) tgtgCTCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCAcgt < 1:371979/135‑1 (MQ=255) gCTCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACTCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCAcgtcgt > 5:51675/1‑135 (MQ=255) gCTCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCAcgtcgt > 1:213758/1‑135 (MQ=255) gCTCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCAcgtcgt > 1:366294/1‑135 (MQ=255) gCTCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACgtcgtc > 7:37488/1‑136 (MQ=255) gCTCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACgtcgtc > 7:196402/1‑136 (MQ=255) tCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGATGTATGGAAAGTCGGTGGGGTACGCGTTGCGGCAGGGGTTGTCGTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGtcgtcg > 5:3604/1‑135 (MQ=37) tCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAATGTGAACAGCCCGTCGTCgg > 8:234739/1‑136 (MQ=255) tCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCgg > 4:153088/1‑136 (MQ=255) tCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCgg > 7:240616/1‑136 (MQ=255) tCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGAGGAACGGGTTGTCCTTTTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGATCAGCACGtcgtcg > 2:317778/1‑135 (MQ=255) tCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTATTGTCAATGAACATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGACTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGCACAGCACGtcgtcg > 2:321627/1‑135 (MQ=37) aGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTg > 3:204323/1‑135 (MQ=255) cACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGTGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCTTGGGGTTGATGGTGAACAGCACGTCGTCTGCGTTGAACGGGc < 3:50584/134‑1 (MQ=255) cACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGc < 4:1268/134‑1 (MQ=255) aCCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGa > 7:73720/1‑135 (MQ=255) aCCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACATCGTCGGCGTTGAACGGGCGa > 2:94745/1‑135 (MQ=255) ttGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACCTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTg < 1:94745/135‑1 (MQ=255) ggCAATGTTCTTGTCCTTGCCCAAGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTcgg > 5:99838/1‑135 (MQ=255) cAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCtt < 8:196402/136‑1 (MQ=255) cAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTAGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCt > 6:48807/1‑135 (MQ=255) aTGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCtt > 2:372835/1‑134 (MQ=255) tCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGaa > 6:178735/1‑133 (MQ=255) ttGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAagtagt < 8:73720/136‑1 (MQ=255) gTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAagtagt < 7:4477/134‑1 (MQ=255) tCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAagtagt < 5:357358/133‑1 (MQ=255) ccATGCCCATGTCGGTGAACTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACCGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCggt > 7:46187/1‑136 (MQ=255) tGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCggtggt < 7:238938/136‑1 (MQ=255) ccATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGCACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGgtgt > 2:85557/1‑135 (MQ=255) ccATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGtgtg > 3:370254/1‑136 (MQ=255) ccATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGtgtg > 7:305085/1‑136 (MQ=255) ccATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGACTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGgtgt > 2:333662/1‑135 (MQ=255) cGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCggtg < 3:220330/125‑1 (MQ=255) cGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCggtg > 4:220330/1‑125 (MQ=255) aaGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGAccc > 4:112105/1‑136 (MQ=255) aGTATGGTAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCGTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGATGAGCACGTCGTGGGCGTTGAACGGTCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGAcc < 2:261193/134‑1 (MQ=37) aGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCggtg < 3:271374/119‑1 (MQ=255) aGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCggtg > 4:271374/1‑119 (MQ=255) tGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTc < 3:153088/135‑1 (MQ=255) ggAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTcgc > 4:131044/1‑136 (MQ=255) aaaCTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGTACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGCACGTGACCCCTTcgc > 5:24987/1‑134 (MQ=255) aaaCTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTcgc > 2:212247/1‑134 (MQ=255) aaaCTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGAATGCGGTTGAAGGTGTACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACCGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTAGGTGGTGTGGAACGTGCCCCCTTagcg > 5:24984/1‑135 (MQ=255) cTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAgg < 3:131044/136‑1 (MQ=255) tCGGT‑GGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGt < 1:151124/135‑1 (MQ=255) ggTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCTCAGGt < 8:240616/134‑1 (MQ=255) ggTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGt < 4:204323/134‑1 (MQ=255) ggTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGt < 8:37488/134‑1 (MQ=255) ggTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGt < 7:20198/134‑1 (MQ=255) gTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTTTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGTAGGTGAACAGCACGTGGTGGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGGGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGt < 5:185877/133‑1 (MQ=37) gTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGt < 5:178735/133‑1 (MQ=255) gTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTg > 2:183588/1‑134 (MQ=255) gTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGACCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGt < 1:132943/133‑1 (MQ=255) tGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTg > 1:169028/1‑133 (MQ=255) gggTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAgg < 3:200074/136‑1 (MQ=255) ggAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGtt > 5:351324/1‑58 (MQ=255) ggAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGtt < 6:351324/58‑1 (MQ=255) ggAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAgg < 2:392437/116‑1 (MQ=255) ggAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAgg > 1:392437/1‑116 (MQ=255) gAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGATCGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCcg < 3:30298/136‑1 (MQ=255) gAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGcc > 5:225873/1‑135 (MQ=255) gAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCcg > 8:192392/1‑136 (MQ=255) ggtggtCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTTAACAGCACGTCGTCGGCGGTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCgtcgtc < 8:153732/136‑1 (MQ=255) ggTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGGCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCgtcgtc < 3:3490/136‑1 (MQ=255) gTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCgtcgtc < 1:14546/135‑1 (MQ=255) gTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCgtcgtc > 6:62658/1‑135 (MQ=255) gTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGGTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCgtcgtc < 2:260491/135‑1 (MQ=255) tGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCGTCGTCgg < 2:165295/135‑1 (MQ=255) ccTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGTAGGTGTAGGTCTTGCCGTCGGCGGgca > 5:266318/1‑135 (MQ=255) gAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTg < 4:27166/40‑1 (MQ=40) gAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTg > 3:27166/1‑40 (MQ=40) gAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAATTAGTCGGTGGTGTGGAACTTTACCCCTTCGCGCAGGTGGCAGGTGTATGTGTTGCCGTGGTCGGGCCCTTGCCa > 2:199361/1‑135 (MQ=25) gAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCGTCGTCGGACACTTCCCAt > 7:43116/1‑136 (MQ=255) tGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGGGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCGTCGTCGGACACTTCCCATTTGGt < 3:361841/136‑1 (MQ=255) gCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCGTCGTCGGACACTTCCCATTTgtt > 2:129740/1‑133 (MQ=255) gCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCGTCGTCGGACACTTCCCATTTGGt < 1:372835/135‑1 (MQ=255) gCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCGTCGTCGGACACTTCCCATTTGGt < 2:213758/135‑1 (MQ=255) gCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCGTCGTCGGACACTTCCCATTTGGt < 6:204494/135‑1 (MQ=255) gCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACCGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCGTCGTCGGACACTTCCCATTTGGt > 5:191323/1‑135 (MQ=255) ggctGAAGGTGTACAGCACGTCGGCGGCGTTGATCGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCGTCGTCGGACACTTCCCATTTGGTc < 6:24987/131‑1 (MQ=255) ttGAAGGTGTACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAagtagt < 3:32830/55‑1 (MQ=255) ttGAAGGTGTACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAagtagt > 4:32830/1‑55 (MQ=255) | TTCACCGTGTGCTCGTCAAGCTTCTCCACCTTGGCAATGTTCTTGTCCATGCCCATGTCGGTGAAGTATGGAAACTCGGTGGGGTACGCCTTGCGGAACGGGTTGTCCTTGTCGAGCATGCGGTTGAAGGTGAACAGCACGTCGTCGGCGTTGAACGGGCGACTGGGCTTGAAGTAGTCGGTGGTGTGGAACTTGACCCCTTCGCGCAGGTGGAAGGTGTAGGTCTTGCCGTCGTCGGACACTTCCCATTTGGTC > ACB122/1021308‑1021562 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |