| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB122 | 2,319,429 | G→T | 7.6% | T311K (ACG→AAG) | yjcS ← | Putative alkyl/aryl‑sulfatase YjcS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB122 | 2,319,429 | 0 | G | T | 7.6% | 166.7 / 3.7 | 61 | T311K (ACG→AAG) | yjcS | Putative alkyl/aryl‑sulfatase YjcS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (22/34); new base T (2/3); total (24/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
CGGATGGCCGCACCACCCCAAGTGGGCCAGTGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGG > ACB122/2319294‑2319563 | cgGATGGCCGCACCACCCCAAGTGGGCCAGTGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCg < 4:75798/136‑1 (MQ=255) ggATGGCCGCACCACCCCAAGTGGGCCAGTGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCg < 6:6970/135‑1 (MQ=255) gATGGCCGCACCACCCCAAGTGGGCCAGTGATGCTGGGCGACCACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCCCCAGCGCTTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTGTCGGATCGCGCCCCAGGGCCCCGCGCAGCggc > 7:199803/1‑134 (MQ=255) caccacCCCAAGTGGGCCAGTGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGtt < 4:374524/136‑1 (MQ=255) caccacCCCAAGTGGGCCAGTGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGt > 5:117842/1‑135 (MQ=255) accaccCCAAGTGGGCCAGTGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGtt < 1:198363/135‑1 (MQ=255) ggCCAGTGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATgg < 4:92334/135‑1 (MQ=255) aGTGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTTAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTgg > 5:6840/1‑135 (MQ=255) aGTGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTgg > 2:60896/1‑135 (MQ=255) gTGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGc > 5:263129/1‑135 (MQ=255) gTGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGc > 2:324149/1‑135 (MQ=255) tGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGt < 7:128810/136‑1 (MQ=255) tGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGt < 3:347291/136‑1 (MQ=255) tGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGt < 8:27762/136‑1 (MQ=255) gATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGt < 1:213655/135‑1 (MQ=255) gATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGt < 2:186688/135‑1 (MQ=255) gATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGt < 1:60896/135‑1 (MQ=255) aTGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGtt > 5:368597/1‑135 (MQ=255) ggCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGAGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGAGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTAGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGc > 7:174311/1‑135 (MQ=255) gCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGc < 6:368597/134‑1 (MQ=255) aaCACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATg < 1:143796/135‑1 (MQ=255) ccaccTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAg > 3:276354/1‑136 (MQ=255) ccaccTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAg > 8:116159/1‑136 (MQ=255) cGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGccc > 2:87925/1‑135 (MQ=255) ggCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCt < 1:70266/135‑1 (MQ=255) gCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCCGTACGTTCTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCg > 6:235932/1‑134 (MQ=255) cGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGa < 5:58682/135‑1 (MQ=255) aGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGaaat > 4:331457/1‑135 (MQ=255) gTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTGGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGgcgc < 5:325572/135‑1 (MQ=255) gTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGATGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGAGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGgcgc < 5:380873/135‑1 (MQ=255) gCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTg > 6:338968/1‑135 (MQ=255) cccACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTc < 8:286518/41‑1 (MQ=255) cccACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTc > 7:286518/1‑41 (MQ=255) cccACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGcc > 3:249631/1‑136 (MQ=255) acTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGt > 6:287246/1‑39 (MQ=255) acTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGt < 5:287246/39‑1 (MQ=255) gATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCTTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCt > 5:158746/1‑135 (MQ=255) gATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCTTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCt > 5:165566/1‑135 (MQ=255) gATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGCGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTCCCCGGGGTCCGCt > 5:379860/1‑135 (MQ=255) gATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGc < 5:373575/134‑1 (MQ=255) aTCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGc < 5:227120/63‑1 (MQ=255) aTCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGc > 6:227120/1‑63 (MQ=255) aCCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAActcc > 6:368812/1‑135 (MQ=255) ggCGCCGCGCAGCGTCAGTACGGTCTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTGCATTTCCGCAGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAActccacctcc < 8:216877/136‑1 (MQ=255) ggCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAActccacctcc < 8:154625/136‑1 (MQ=255) ggCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAActccacctcc < 4:209170/136‑1 (MQ=255) ggCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACAAGGGTTGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCGTCCGGCGCCTCGGTGCCCGGTGTCAGCTGGAActccacctcc < 8:293942/136‑1 (MQ=255) gCCCCGCGCAGCTTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAActccacctcc < 6:158746/135‑1 (MQ=255) gCCCCGCGCAGCTTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAActccacctcc < 6:165566/135‑1 (MQ=255) gCCCCGCGCAGCGTTAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGGCAGCTGGAActccacctcc < 6:6840/135‑1 (MQ=255) gCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAActccacctcc < 2:43153/135‑1 (MQ=255) gCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAActccacctcc < 5:235932/135‑1 (MQ=255) gCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAActccacctcc < 1:75679/135‑1 (MQ=255) gCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCAATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAActccacctcc < 2:354059/135‑1 (MQ=255) gCCCCGCGAAGCTGCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGGTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGTAAATAAATTTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAActccacctcc < 6:213827/135‑1 (MQ=255) cgcgCAGCGTCAGTACGGTGTGCTGCACAGGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCAcgcc < 4:343769/136‑1 (MQ=255) cgcAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGATCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCAcgccgc < 8:199803/136‑1 (MQ=255) gcAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCGCATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGCGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGCACTCCACCTCCCCGCCGCt > 3:343769/1‑136 (MQ=255) gcAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCAcgccgc < 2:27074/135‑1 (MQ=255) gcAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGGCAGCTGGAACTCCACCTCCAcgccgc < 6:263129/135‑1 (MQ=255) gcAGCGTCAGTACGGTGGGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGCGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGGGCCCGGGGGCAGCTGGAACTCCACCTCCAcgccgc < 6:226411/135‑1 (MQ=255) aGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGTGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGGCCGGGGGCAGATGGAACTCCACCTCCAcgccgcgc > 6:213653/1‑133 (MQ=255) aGCGGCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGGTCATTTCCGCCGGCGCCGCGGGGCCCGGGGTCCGCGGGCCCGCCACCTCCAcgccgcg > 4:247245/1‑133 (MQ=255) cGTCAGTACGTTGTGCTGAACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAgg < 3:49505/136‑1 (MQ=255) gTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAgg < 1:358552/135‑1 (MQ=255) | CGGATGGCCGCACCACCCCAAGTGGGCCAGTGATGCTGGGCGAACACCACCTCGGCCTGCTCGCCGTAGCGCACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGG > ACB122/2319294‑2319563 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |