Missing coverage evidence...
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*	*	÷	ACB122	5193577	5193672	96	21 [13]	[14] 18	[gltR_4]–[CJ019_04888]	[gltR_4],[CJ019_04888]

TGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGC  >  ACB122/5193442‑5193617                                                                                                                                       |                                          tgctgGACGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGc                                           <  7:187763/135‑1 (MQ=255) tgctgGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGc                                           <  6:148545/135‑1 (MQ=255) tgctgGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGc                                           <  5:188879/135‑1 (MQ=255) tgcggGAAGGGTGGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGGGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGc                                           <  6:33098/135‑1 (MQ=255)       aaGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATc                                      <  4:280698/134‑1 (MQ=255)           gtggCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGGTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCt                                 <  3:368232/132‑1 (MQ=255)           gtggCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGGGGCGTGGCAGACCGGGGGGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCt                                 <  5:55520/132‑1 (MQ=255)           ggtGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCTCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCt                                 <  3:284800/133‑1 (MQ=255)           gTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGGGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCt                                 <  4:270734/135‑1 (MQ=255)                aGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGc                                           >  3:218609/1‑120 (MQ=255)                aGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGc                                           <  4:218609/120‑1 (MQ=255)                   cgccgccgAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGCTGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGAc                         <  8:19415/135‑1 (MQ=255)                        ccgAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACa                    <  3:45269/135‑1 (MQ=255)                          gAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGGGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGt                  <  4:171823/135‑1 (MQ=255)                                     tggtggtggCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTGTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGGGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTa       <  6:367850/135‑1 (MQ=255)                                       gtggtggCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGc     <  4:160562/135‑1 (MQ=255)                                          gtggcgtggcAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGc                                           >  5:30945/1‑94 (MQ=255)                                          gtggcgtggcAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGc                                           <  6:30945/94‑1 (MQ=255)                                          gtggcgtggcAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCggg  >  3:212239/1‑134 (MQ=255)                                                                cGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGAc                         <  5:331768/90‑1 (MQ=255)                                                                cGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGAc                         >  6:331768/1‑90 (MQ=255)                                                                                                                                       |                                          TGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTGGTCGATGAGGTGGTTGGGGTTTGCCGGCAGGTGTTGGCGCGGTATGCGCGGGATGTGGGTGGGCAGCGGATCGTGCTGGTCTGACCAACAGTCTCCGCCTGTAGCGGC  >  ACB122/5193442‑5193617

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑