Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	ACB122	5809543	5809645	103	12 [4]	[11] 12	[pilT]	[pilT]

CACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCA  >  ACB122/5809408‑5809552                                                                                                                                       |           ccctccGTGGGGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAACGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGAACCGCCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgc            <  1:112670/130‑1 (MQ=39) cccTACGTGGGGGCGAAGCGGTGGCTGCCGAACGAGCAGCAGCTGAGGCTGGCCAAGCGTTATGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgc            <  7:239468/133‑1 (MQ=38) cACTCCGTGGTGGCCTAGCGGGTGCGGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGGCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgc            <  2:129136/135‑1 (MQ=255) cACTACGTGGTGGCCACGCGGGTGCTGCCGAACGACCAGCAGCTGAGGCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgc            <  1:88787/135‑1 (MQ=255) cACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgc            <  2:231496/135‑1 (MQ=255) cACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgc            <  5:106660/135‑1 (MQ=255) cACTACGGGGGGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCGGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGAGCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgc            <  1:214002/135‑1 (MQ=255) cACTACGCCGCGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAACGCGCAGCAGCTCCGGCTGGCCAAGCGTTATGCTGTTGCGCGCTAACGGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACACGTAGCGCGTCGCTCTcgc            <  7:147931/135‑1 (MQ=25)   cTACGTGGTGGCCACGCGGGGGCGGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcacgc          <  8:167549/135‑1 (MQ=255)         ggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACCGGTAGCGCGTAGCTCTACCGCGCAGCt    >  2:88787/1‑135 (MQ=255)         gggggCCAAGCGGGTGCGGCCGAAAGTGCAGCAGCTGAGGCGGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTGCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCt    <  7:118222/132‑1 (MQ=39)           tggCCACGCGGGGGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCGGAGTCGGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTGCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTca  <  7:101955/135‑1 (MQ=39)                                                                                                                                       |           CACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCA  >  ACB122/5809408‑5809552

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑