| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB122 | 3,139,338 | T→G | 13.5% | L235R (CTG→CGG) | lsrD → | Autoinducer 2 import system permease proteinLsrD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB122 | 3,139,338 | 0 | T | G | 13.5% | 139.7 / 2.0 | 75 | L235R (CTG→CGG) | lsrD | Autoinducer 2 import system permease proteinLsrD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/25); new base G (2/11); total (39/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.10e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGTATTGGCGCGTGGCCGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCG > ACB122/3139204‑3139469 | ggTATTGGCGCGTGGCCGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGGTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCt > 5:222814/1‑135 (MQ=255) gTATTGGCGCGTGGCCGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTCGAGGCGCGTTATTCGGGCCAGGCGCAGCGACGTATAGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCGTTGCCAGCGCGCTg > 3:176026/1‑135 (MQ=255) tATTGGCGCGTGGCCGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTgg > 3:245972/1‑135 (MQ=255) tATTGGCGCGTGGCCGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGGTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCGGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGGTgg > 1:90526/1‑135 (MQ=255) cgTGGCCGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCAtt > 7:192344/1‑135 (MQ=255) ccGCTTAGGCCGGGAGTTCTTCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCCGGCATTctgct > 5:56614/1‑135 (MQ=255) ccGCTTAGGCCGGGAGATTATCGTCCTTGGCCGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTctgct > 8:60524/1‑135 (MQ=255) ccGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCCGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCCGCGGCGTATCGCGGCCCGGGTGGTCAACGCCACTGCCGTTGCCCGCGCGCGGGCGGGGATTgtgca > 5:175532/1‑134 (MQ=255) ccGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCCGCGACGTATCGCTGCCCTGGGGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCCTTctgct > 3:159337/1‑135 (MQ=255) ccGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGCCGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTTCCTTTGCCAGCGCGCGTGCGGGCCTTctgca > 2:262344/1‑134 (MQ=255) ccGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTctgct > 1:95686/1‑135 (MQ=255) ccGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTctgct > 7:214538/1‑135 (MQ=255) ccGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTctgct > 3:181529/1‑135 (MQ=255) ccGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTctgat > 8:103277/1‑133 (MQ=255) ccGCTTAGGCCGGCAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCGCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCAATatgca > 8:47160/1‑134 (MQ=255) aGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGc > 6:292375/1‑135 (MQ=255) tcagcGGCCTTGGAAGCCAGCCAGTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGTTGTCCAGCGCCAGGGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGAATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACg < 2:72449/135‑1 (MQ=255) cGTCCTTTGCAGACAGCCACACGTGGCCCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCCCTCCCCTCGTGTTGATCGACACTGCGTTTTCCATCGCGCTGGCCGGCATTCTGCTGCAGTCCACGGTGAAAGCCTa > 8:16469/1‑135 (MQ=255) ttGGCTGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTGGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCGTGGTGTTCATCGCCAGTGGCTTTGCCAGCGCGGTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTAcgcg < 7:47160/134‑1 (MQ=255) gCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTAGCGCTGCCCGGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCg < 5:223368/134‑1 (MQ=255) agccagccACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATg > 4:297791/1‑135 (MQ=255) ccagccagTGGGGGCGCGTTAGTCGGGCCGGGCGCAGCGACGTACCGCGCCCCTGGTGGCCACCGCCCGTGCCTTGGCCCGCCCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTc < 5:22167/135‑1 (MQ=255) cagccaCTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTcc > 7:134122/1‑135 (MQ=255) caCTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCa > 4:243042/1‑135 (MQ=255) caCTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCa < 6:236324/135‑1 (MQ=255) caCGGGTGGCGCGTTTTGGGGGCGTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCGCTGGTGGTCATCGCCAGTGCCTTGGCCAGCGCGGGGGCGGGCATTCTGCGGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCa < 6:19012/135‑1 (MQ=255) ggggCGCGTTATGCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCGGCCCGGGTGTTCAGCGCCAGTGCCTTTGCCCGCGCGGGGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGcc < 5:275203/133‑1 (MQ=255) tggCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCt > 2:37936/1‑135 (MQ=255) tggCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCt > 7:228410/1‑135 (MQ=255) ggTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGAATCGCTGCCCTGGTGTGCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGGGCGCTGGCGGGAATTCTGCTGCCGGCCACGGTTAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCtg < 6:222814/134‑1 (MQ=255) gTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCtga > 4:12991/1‑135 (MQ=255) gTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCtga > 1:136241/1‑135 (MQ=255) gTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCtga > 7:87772/1‑135 (MQ=255) ttATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCtgat < 6:47929/135‑1 (MQ=255) tGGCGCAGCTACGTATGGCTGCCGTGGTGTTCATCGCAAGTGCGTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCg < 3:289539/135‑1 (MQ=255) tGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCg < 3:60402/135‑1 (MQ=255) tGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTGCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCg < 4:86196/135‑1 (MQ=255) ggccgcAGCGCCGTCGCGCGGCCCGGGTGGTCATCGCCAGGGCCTTCGCCCGCGCGCGGGCGGGCATGCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCg < 1:156264/132‑1 (MQ=255) cgcAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGt < 4:245972/134‑1 (MQ=255) cgcAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTg > 5:115482/1‑135 (MQ=255) cGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCCCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTc > 1:5989/1‑135 (MQ=255) cgcgGCCCTGGGGTTCATCGCCAGTGCCTTGGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGACCGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCgg < 3:54338/135‑1 (MQ=255) cGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTTCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCgg > 2:296624/1‑135 (MQ=255) tGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTg > 7:24378/1‑134 (MQ=255) gggTGTTCATCGCCCTGGCCTTTGCCCGCGGGGGGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACACCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGt < 7:103277/134‑1 (MQ=255) gtTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAg > 3:292430/1‑135 (MQ=255) cGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGt < 2:238070/125‑1 (MQ=255) cGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGt > 1:238070/1‑125 (MQ=255) cGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGc > 3:63398/1‑134 (MQ=255) ccAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGcac < 6:115482/134‑1 (MQ=255) cAGTGCCTTTGCCCGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACaa < 1:37936/135‑1 (MQ=255) cAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGt < 7:221159/100‑1 (MQ=255) cAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGt > 8:221159/1‑100 (MQ=255) tgTGCCTTGGCCCGCGCGGGGGCGGGCATACTGCGGCCGGCCAGGGGGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAAc < 1:87721/134‑1 (MQ=255) gTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAAcc > 2:119084/1‑135 (MQ=255) gTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGATGAGCCTGCACAAcc > 8:113764/1‑135 (MQ=255) tGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCtt < 8:237727/105‑1 (MQ=255) tGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCtt > 7:237727/1‑105 (MQ=255) ccTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGc > 1:20582/1‑122 (MQ=255) ccTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGc < 2:20582/122‑1 (MQ=255) tGCCCGCGCGCGGGCGGGCAGTCTGCTGCCGGCCCCGGTGACCGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCAGCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCaa < 1:280034/135‑1 (MQ=255) gcccgggcgcGGGCGGGCCTGCTGCTCCCGGCCCGGGTGACCGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGGGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCaa < 5:245224/128‑1 (MQ=255) gCCCGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCGGCCGGCCACGGTGACCGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCaa < 5:116556/134‑1 (MQ=255) gCCCGCGCGCGGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCaa < 7:118140/134‑1 (MQ=255) gCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAGCCGGGTCaa < 8:192344/134‑1 (MQ=255) gCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCaa < 2:95686/134‑1 (MQ=255) gCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAAc > 8:258862/1‑135 (MQ=255) gCCAGCGCGCTGGCGGGCATGCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCaa < 4:159337/134‑1 (MQ=255) gCCAGCGCGCGGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCaa < 5:292375/134‑1 (MQ=255) ccgcgcgcGGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGGGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGt < 5:72914/133‑1 (MQ=255) cAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGt < 3:243042/135‑1 (MQ=255) cAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGt < 4:19191/135‑1 (MQ=255) cAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGt < 4:181529/135‑1 (MQ=255) cAGCGCGCGGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGt < 8:214538/135‑1 (MQ=255) gcTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCg > 5:96701/1‑134 (MQ=255) gcTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCg > 3:69766/1‑134 (MQ=255) | GGTATTGGCGCGTGGCCGCTTAGGCCGGGAGATCATCGTCCTTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCG > ACB122/3139204‑3139469 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |