| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB122 | 828,159 | C→T | 6.4% | A324T (GCC→ACC) | CJ019_00791 ← | putative sulfate transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB122 | 828,159 | 0 | C | T | 6.4% | 209.7 / 3.4 | 64 | A324T (GCC→ACC) | CJ019_00791 | putative sulfate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/31); new base T (2/2); total (30/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.98e-01 | |||||||||||
AATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGGCGCGCGGCATAGGAGCG > ACB122/828031‑828291 | aaTCCCCAGCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGAATAAGATTGGGCGCTACCAGCAGAAACAGGGTTACCGCCCGTGCGCCGATGATGCGGGTGTGCTGGGTCTGCGTGCCGGCAGCTTCGGCCACTgg < 8:123971/135‑1 (MQ=255)aaTCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCAGCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTgg < 6:159171/135‑1 (MQ=255) aTCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTggg > 3:232085/1‑135 (MQ=255) accaccGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTg > 4:286251/1‑135 (MQ=255) accaccGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTg > 8:167613/1‑135 (MQ=255) accaccGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTg > 8:189535/1‑135 (MQ=255) accaccGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTg > 2:143304/1‑135 (MQ=255) caccGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCg < 7:49909/135‑1 (MQ=255) ccAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAAc > 6:220950/1‑135 (MQ=255) aaaGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAActg < 5:117630/135‑1 (MQ=255) ttAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATc > 1:174554/1‑135 (MQ=255) ttAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATc > 4:101917/1‑135 (MQ=255) tAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCg < 2:174554/135‑1 (MQ=255) tAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCg < 6:298786/135‑1 (MQ=255) aGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGTCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCgg > 8:148343/1‑135 (MQ=255) aGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGTCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCg > 8:148345/1‑134 (MQ=255) 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gATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGTCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGc < 7:148343/134‑1 (MQ=255) gcTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGcc > 4:72791/1‑135 (MQ=255) cagcagCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGtt < 7:189535/135‑1 (MQ=255) cagcagCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGtt < 5:220950/135‑1 (MQ=255) cagcagCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGtt < 4:217233/135‑1 (MQ=255) cagcagCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGtt < 3:138162/135‑1 (MQ=255) cagcagCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGGGAGCTGGGGCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGtt < 8:93243/135‑1 (MQ=255) cagcagCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGAGGAGGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGtt < 1:114408/135‑1 (MQ=255) agcagcAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTg > 1:262224/1‑135 (MQ=255) agcagcAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTg > 5:244536/1‑135 (MQ=255) gggtccccGCCCGGGCGCCGAGGAGGCCGGTGAGCTGGGTCGGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCa < 1:143304/129‑1 (MQ=255) tACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAGCTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGAc > 6:132525/1‑134 (MQ=255) 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gcgcCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTcc > 8:93274/1‑135 (MQ=255) gcgcCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGACCCGACCAGACCGACCATTTcc > 3:296445/1‑135 (MQ=255) gcgcCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGCCCACTGGGGTGCGTGACGATCTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGATGGCCACGCCCAGACCGAACATTTcc > 1:45588/1‑135 (MQ=255) cgcCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCt < 1:162990/135‑1 (MQ=255) cgcCGATGATGCCGGTGAGCGGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCt < 6:256270/135‑1 (MQ=255) gcCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTg > 8:279155/1‑135 (MQ=255) atgatgCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTg > 8:239916/1‑135 (MQ=255) ccGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCCCGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGttt > 5:171439/1‑135 (MQ=255) cGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTa < 4:234355/135‑1 (MQ=255) cGGCGAGCTTGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGGGACGAACTGCTGCTGATAGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCAAGTTGGCCACGCCCAGACCTAACATTTCCTGTTTGGGGTTTa < 3:279993/135‑1 (MQ=255) gCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCg > 2:114730/1‑60 (MQ=255) gCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCg < 1:114730/60‑1 (MQ=255) cTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAg < 3:68648/135‑1 (MQ=255) cTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTAGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCAGGATGGGGTTTACCCGCATCTTGAg > 5:163626/1‑135 (MQ=255) gcgcgcGGGCAGGTTCGGCCACGGGGGTGCGGGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGgc < 6:171439/135‑1 (MQ=255) gCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGgc < 6:173512/135‑1 (MQ=255) gCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGgc > 5:173512/1‑135 (MQ=255) gAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGgc < 5:271879/133‑1 (MQ=255) gAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGgc < 7:91722/133‑1 (MQ=255) gAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGgc < 3:72791/133‑1 (MQ=255) gAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGgc < 3:46064/133‑1 (MQ=255) gggCAGGTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGGCGCGCgg < 1:148700/134‑1 (MQ=255) gCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGGCGCGCGGc > 4:132689/1‑134 (MQ=255) ggCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGGCGCGCGGCATAGGAGCg < 5:6055/135‑1 (MQ=255) | AATCACCACCGCAGCCAAAGCGCTGTTAGGCAGGTGCTGCATCAGATTGGGCGCTACCAGCAGCAACAGGGTTACCGCCAGGGCGCCGATGATGCCGGTGAGCTGGGTCTGCGAGCCGGCAGCTTCGGCCACTGGGGTGCGTGACGAACTGCTGCTGATCGGGATGCCCTGAAACAGCCCCGAGGCCACGTTGGCCACGCCCAGACCGAACATTTCCTGGTTGGGGTTTACCCGCATCTTGAGGCGCGCGGCATAGGAGCG > ACB122/828031‑828291 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |