Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | ACB122 | 1360592 | 1360997 | 406 | 29 [23] | [27] 28 | [CJ019_01275] | [CJ019_01275] |
GTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGG‑CCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACG > ACB122/1360868‑1361131 | gtggtgGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGG‑CCATGCCGGCCACAGCCGCCGGGGCCCCCCCCGGTATTAAAACGCTGGGCGCAGCAGccaccaag > 5:283242/1‑133 (MQ=255) ggtggCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGG‑GCCTGCCGGCCACCGCGGGCGTGGGCACGCCGGGAATTAAAACGCTGGGGGCAGCCGCAACCAAGCt > 5:90141/1‑135 (MQ=255) ggtggCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGG‑CCATGCCGGCACCAGCGGCAGTGGCCACGCCGGGAATTAAAACGCTGGGCGCCGCAGCCACCATGCt > 8:104808/1‑135 (MQ=255) ggTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGACACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGG‑CCATGCCGGCAACAGCGGTAGTGGCCACGACGGAAAATCAAACGCTGGGCGCAGAAGAAACCATGCTGAAGctgtc > 3:142810/1‑131 (MQ=255) gTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGG‑CCAAGCCGGCAACACCCGCAGTGGCCCCGACCGTAATTAAAACGCTGGGCGCCGCAGCAACCAAGCTGCATCggggg > 5:443354/1‑133 (MQ=255) ggCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGG‑CCCTGCCGGCAACAGCGGCCGTGGGCCCGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCCGCAGCAACCCTGGTGAAGCGGGGGACGCTCAAgg > 3:265594/1‑134 (MQ=255) aCGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCCATG‑CGGCAACCGCGGCCGTGGCCCCGACGGGAATTGAAACGCGGGGCGCAGCCGCACCCAAGCTGGAGCGGGTGACGCTAATGGCAATCCCGGGGGTGGGGAACCCg > 8:281248/1‑135 (MQ=255) ggCAGCGGCGGTGACGGTGGTGG‑CCCTGCCGGCCCCAGCCGCGCGGGCCCCGGCGGTAATTAAAAACCTGGGGGCCGCAGCAACCCTGCTGTGGCGGGGGGCGTTGATGGGAAACACGTGGGGGGGGGACCCggg > 4:197800/1‑135 (MQ=255) ggCAACAGCCGCAGTGGCCACGCCGGTAATTAAAACCCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCGGTAGCCGGTGGCGATCAAGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATTTAGGCGGTAAg > 2:282254/1‑135 (MQ=255) cAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCgatga > 3:525569/1‑135 (MQ=255) cAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGAGCATGGTAATCATGTCGGCGGTACGCCTGGCgagga > 6:499241/1‑135 (MQ=255) acgacgGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCa > 3:31106/1‑135 (MQ=255) acgacgGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCa > 3:507726/1‑135 (MQ=255) gacgGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCaa > 2:410693/1‑134 (MQ=255) ttCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTtgg > 7:89804/1‑135 (MQ=255) tCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCTTGCTGAAGCGTGTGAGGATCATGGCAATCTCGGGGGGGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTtggt < 1:247594/135‑1 (MQ=255) cAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTtggtg > 3:457615/1‑135 (MQ=255) cTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCAt > 8:444401/1‑41 (MQ=255) cTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCAt < 7:444401/41‑1 (MQ=255) cTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGAGCACGGCAATCATGGTGGTGGTGacc > 6:25914/1‑133 (MQ=255) gcagcagcaACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACg < 4:28360/108‑1 (MQ=255) gcagcagcaACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACg > 3:28360/1‑108 (MQ=255) gcagcagcaACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTg > 8:485319/1‑135 (MQ=255) cagcaACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGAAGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGa < 1:531809/135‑1 (MQ=255) aaCCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCAGGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCAc < 7:223219/135‑1 (MQ=255) aaCCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCAc < 5:126758/135‑1 (MQ=255) aaCCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGGGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCAc < 7:281248/135‑1 (MQ=255) ccATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGACCCCGGGGATGAGCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCGGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGGGAACCTGGTGCCGATCCCg > 8:168501/1‑134 (MQ=255) | GTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGG‑CCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACG > ACB122/1360868‑1361131 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |