| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB143 | 1,310,036:1 | +C | 100% | coding (401/1989 nt) | aaeB_2 → | p‑hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB143 | 1,310,036 | 1 | . | C | 82.8% | 185.0 / 32.3 | 58 | coding (401/1989 nt) | aaeB_2 | p‑hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/6); new base C (28/20); total (32/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Polymorphic indel expands or contracts a homopolymer stretch. | |||||||||||
CCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCA‑CCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCAGCAACTGGGCGGGCAGGCGCGGCAG > ACB143/1309902‑1310169 | ccTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCGACACCGCAGCGGTCATCGCCTTGCCGGCCATTGccca‑c > 6:136289/1‑136 (MQ=255) ttCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCA‑ccc‑ccc > 3:229869/1‑135 (MQ=255) tCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTTTGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGTCCATTGACCA‑cgc‑ccc < 6:67140/135‑2 (MQ=255) tCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCA‑ccc‑ccc < 4:196932/135‑2 (MQ=255) cTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCA‑ccc‑ccct < 8:138118/135‑3 (MQ=255) cTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCGATGCCTTCGTGCTGGCCGGCGACACCTCAGCGAGCATCGCCTGGCCGGCCATTGACCA‑cac‑cccgg > 2:89413/1‑133 (MQ=255) gCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCA‑CCC‑CCTGCa > 1:295794/1‑135 (MQ=255) cTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCA‑CCC‑CCTGCAAGTATTc < 5:29092/136‑1 (MQ=255) tGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGCCCACCCC‑CCTGCAAGTATTc > 4:17621/1‑135 (MQ=255) tGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGCCCACCCC‑CCTGCAAGTATTc > 3:15126/1‑135 (MQ=255) tGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCAGGCCATTGCCCACCCC‑CCTGCAAGTATTc > 6:175908/1‑135 (MQ=255) ggctggcGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGcc < 1:298566/135‑1 (MQ=255) ggctggcGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGcc < 5:71046/135‑1 (MQ=255) ggcGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGc < 1:135796/136‑1 (MQ=255) gcgcTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGc < 2:170439/135‑1 (MQ=255) gcgcTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGc < 4:88097/135‑1 (MQ=255) gcgcTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCA‑CCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGc < 7:251533/134‑1 (MQ=255) cTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGc > 6:105914/1‑136 (MQ=255) tgtACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCA‑CCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTg < 2:295794/134‑1 (MQ=255) aCCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTc > 3:65295/1‑112 (MQ=255) aCCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTc < 4:65295/112‑1 (MQ=255) aGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCgaga > 5:242206/1‑135 (MQ=255) cGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCt < 3:125835/136‑1 (MQ=255) cGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCt < 6:242206/136‑1 (MQ=255) cGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCt > 5:273906/1‑136 (MQ=255) ccACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGcc > 3:105842/1‑136 (MQ=255) ccACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGcc > 3:188473/1‑136 (MQ=255) ccACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGcc > 8:13983/1‑136 (MQ=255) aCCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCA‑CCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGAGCTGCCTgg > 8:77259/1‑136 (MQ=255) aGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTCCCGAGATCTGCCTGGGTATGTTCtgt > 6:153442/1‑136 (MQ=255) aGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCtgt > 8:26416/1‑136 (MQ=255) aGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCtgt < 8:100268/136‑1 (MQ=255) cTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCaa > 3:173609/1‑135 (MQ=255) gggCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAAcag > 8:38258/1‑136 (MQ=255) ccTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAAcagcca < 7:179719/136‑1 (MQ=255) ccTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAAcagcca < 3:128506/136‑1 (MQ=255) ccTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAAcagcca < 6:108160/136‑1 (MQ=255) ccTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGCCCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTg > 4:172091/1‑136 (MQ=255) ccTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGt < 1:107891/135‑1 (MQ=255) ccTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGt < 7:153606/135‑1 (MQ=255) cattCGTTATGGACTGCTAGAACGCAGCGATCATCGCCTTGCCGTCCATTGACCA‑CCCACCTTATATTATTCGAGCAGGCCGTTGCTAGATGTAACGATATCTGCATGGGTATTTTATGTGCAAAAGCCATCAGt < 8:47554/133‑1 (MQ=255) cTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGt > 3:217853/1‑134 (MQ=255) cTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGt < 4:217853/134‑1 (MQ=255) cTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGc > 7:69240/1‑136 (MQ=255) cTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGc > 7:210264/1‑136 (MQ=255) cTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCA‑CCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGcc > 1:194396/1‑136 (MQ=255) tGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGc > 1:159033/1‑136 (MQ=255) tGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGc > 4:55190/1‑136 (MQ=255) tGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCA‑CCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGt < 3:190799/128‑1 (MQ=255) tGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCA‑CCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGt > 4:190799/1‑128 (MQ=255) gCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTTTTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGct > 5:219199/1‑136 (MQ=255) gCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGct > 8:244380/1‑136 (MQ=255) gCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGc > 4:285536/1‑135 (MQ=255) gCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCa < 3:276950/136‑1 (MQ=255) gCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCa < 5:98349/136‑1 (MQ=255) cacCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGcc > 6:231364/1‑62 (MQ=255) cacCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGcc < 5:231364/62‑1 (MQ=255) cacCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCg > 2:275101/1‑136 (MQ=255) gCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTc < 4:173609/136‑1 (MQ=255) cAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCg > 2:96690/1‑136 (MQ=255) cGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGagc > 2:49478/1‑136 (MQ=255) ggCCATTGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCAGCAACTgggcggg > 3:199931/1‑134 (MQ=255) aTTGACCA‑CCC‑CCTGCAAGTAATCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCAGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTTCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCAGCAACTGGGCGGGCAGgcgc < 4:137369/136‑1 (MQ=255) ttGACCACCCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCAGCAACTGGGCGGGCAGgcgc < 2:187789/136‑1 (MQ=255) cca‑ccC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCAGCAACTGGGCGGGCAGGCGCGGCAg < 3:13232/136‑1 (MQ=255) | CCTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGACCA‑CCC‑CCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCAGCAACTGGGCGGGCAGGCGCGGCAG > ACB143/1309902‑1310169 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |