| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB143 | 5,840,134 | 0 | T | G | 28.9% | 135.3 / 15.0 | 91 | V23G (GTG→GGG) | CJ019_05466 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/30); new base G (1/25); total (36/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.38e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TACCCGCCTTATGGCAAAGCCTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGGTGTTGC > ACB143/5840000‑5840259 | tACCCGCCTTATGGCAAAGCCTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCtggtg > 8:70126/1‑136 (MQ=255)tACCCGCCTTATGGCAAAGCCTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCtggtg > 5:120658/1‑136 (MQ=255) cccGCCTTATGGCAAAGCCTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGGGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCtggt < 3:363977/133‑1 (MQ=255) cGCCTTATGGCAAAGCCTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGt < 5:103812/136‑1 (MQ=255) cGCCTTATGGCAAAGCCTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGt < 2:79454/136‑1 (MQ=255) cGCCTTATGGCAAAGCCTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGt < 5:152695/136‑1 (MQ=255) cGCCTTATGGCAAAGCCTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGt < 6:229891/136‑1 (MQ=255) cGCCTTATGGCAAAGCCTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGt < 5:301205/136‑1 (MQ=255) cGCCTTATGGCAAAGCCTCGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGt < 1:168878/136‑1 (MQ=255) gCCTTATGGCAAAGCCTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTg > 3:164080/1‑136 (MQ=255) gCCTTATGGCAAAGCCTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGGGGGGTg > 3:346094/1‑136 (MQ=255) aTGGCAAAGCCTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCg > 8:127458/1‑136 (MQ=255) gCAAAGCCTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTg > 5:89722/1‑135 (MQ=255) cTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAAccg‑c > 1:182921/1‑136 (MQ=255) cTTGCAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCGCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCCGCCTGGTGGGGTGCAGAGTGCAAAccg‑c > 2:154890/1‑136 (MQ=255) cAGCGCCTGGTCTACAACCTGTCCATCCGCTGCGGTTCGCACCATGCACCGCCGCGACCGGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGGGCCAGCCTGGGGGGGGGCAGGGGGCAAACcg‑ccgc < 6:278048/135‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGCGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGGGCAGCGTGCAAACcg‑ccgc < 5:149144/135‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCGGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCCGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGGGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACcg‑ccgc < 2:20987/135‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGGTCTACAAACTGTACATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCGCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGGGCCAGCCTGGGGGGGGGCAGCGTGCAAACcg‑ccgc < 3:79552/135‑1 (MQ=255) gcgcCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGGGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGAc < 7:21701/136‑1 (MQ=255) gcgcCTGGTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATCCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGAc < 6:258850/136‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCCTACAAACTGTTCATCCGCTGCGGATCGCACCATCCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGGGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGAc < 1:378200/136‑1 (MQ=255) gcCTGGACAACAAACTGTTCATCCGCTGCGGATCGCCCCAGGCACCGCCGCGACCGGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGGGCTTTTCTGGGGGGGGCCAGCCTGGTGGGGGGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCg < 4:311150/136‑1 (MQ=255) ggTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTa > 4:102720/1‑136 (MQ=255) ggTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTa > 8:36459/1‑136 (MQ=255) ggTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGGGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTa > 6:89564/1‑136 (MQ=255) ggTCTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGAGGGTGCCCGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTa > 1:40469/1‑136 (MQ=255) ggcTACAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGGGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCt < 2:41213/132‑1 (MQ=255) cAAACTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCGGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGGGGGGGCCAGCCTGGGGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAg < 8:329742/134‑1 (MQ=255) aaCTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTAc > 5:82775/1‑136 (MQ=255) cTGTTCATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACtt > 5:280733/1‑136 (MQ=255) cATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTga > 2:349277/1‑136 (MQ=255) cATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTga > 3:298960/1‑136 (MQ=255) cATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTga > 2:158957/1‑136 (MQ=255) cATCCGCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGAGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCGATCAGGTACTTCGTga > 4:45032/1‑136 (MQ=255) aTCCGCTGAGGATCGCCCCCTGCCCCGCCGCGACGTGCGGCGTTTCCGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTGTGGCGGGTGCCAGCCTGGGGGGGTGCAGGGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTga < 1:103141/135‑1 (MQ=255) gtggAGTATCCCACCATGCACGGCCGCGAGCTGGTGGGTTGCCCCCGCGGCGCCTGTGGTTTTCTGGCGGGGCCCTGGGTGGTGGGGTGAAGCTTTCAACCGG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTgacgacg < 2:218105/133‑1 (MQ=255) ggtgcggAGCGCACCTTCCCCCCCCGCGACCTGGGGCGTTTCCGCCGGGGCGCCTGTGGTTTTGGGGGGGGGGCCAGCGGGGGGGGGGGCAGCGTGCAACCCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTgacgacg < 2:367190/131‑1 (MQ=255) ggggtggAGCGCACCAGGCCCCGCCGCGCCCGGCGGCGTTTCCGCCGGGGCGCCTGTGGTGTTGGGGGGGGGGCCCGCCTGGGGGGGGGCTGCGTGAAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTgacgacg < 3:19926/131‑1 (MQ=255) gCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTgacgacg < 6:85892/136‑1 (MQ=255) gCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGGGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTgacgacg < 8:116834/136‑1 (MQ=255) gCTGAGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGGGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTgacgacg < 3:326022/136‑1 (MQ=255) aGGATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCt < 8:231491/136‑1 (MQ=255) gATCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCCGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGc > 2:302130/1‑136 (MQ=255) gATCGCACCAAGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCACTGCTTTTCTGGCGGCTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGc > 2:38947/1‑136 (MQ=255) aTCGCACCATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGGGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGcc < 6:358788/136‑1 (MQ=255) ccATGCACCGCCGCTACCTGCTGGGTTTCAGCCGCGGCGCCTGGTCTTTTCTGGCGGGGGCCAGCCTGGTGGGGTGCTGGGTGAAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCctgct < 2:272980/136‑1 (MQ=255) cATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGGGGGGGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGAAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCctgctg < 4:83597/136‑1 (MQ=255) cATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCctgctg > 4:16118/1‑136 (MQ=255) cATGCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCctgctg > 7:136206/1‑136 (MQ=255) gCACCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCtgcgt > 4:170799/1‑136 (MQ=255) cccccgccgCGACGTGGTGGTTTTCAGCCGCGGCGCCAGTGCTTTTCGGGGGGGGGCCCGCGGGGGGGGGTGCAGGGGCCAACCCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCtgcgt < 5:232944/133‑1 (MQ=255) cACCGCCGCGACCTGCTGCTTTTCAGCCTGGGCGCCAGTGTTTTTCTGGGGGGGGCCAGCCTGGGGGGGTGCAGCGTGAAACCCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCtgcgt < 5:275827/135‑1 (MQ=255) aCCGCCGCGCCCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGCCCGGCTATCAGGTACTTCGTGCCGACGACCTGCCCCTGCtgcgtgc > 2:188146/1‑136 (MQ=255) aCCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCtgcgtgc > 2:90944/1‑136 (MQ=255) aCCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCtgcgtgc > 5:197817/1‑136 (MQ=255) aCCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCtgcgtgc > 3:126278/1‑136 (MQ=255) aCCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCtgcgtgc > 3:184702/1‑136 (MQ=255) aCCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCtgcgtgc > 3:249944/1‑136 (MQ=255) aCCGCCGCGACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCGTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTAGCAGGTACTTCGTGACGACGCCCTGCCCCTGCtgcgtgc > 7:128859/1‑136 (MQ=255) ccgccgCGACCTGCTGCGTTTCAGCCGCGGCGCCAGTGCTTTTGTGGGGGGGGCCCGCCGGGGGGGGGGCAGGGTGAAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCtgcgtgcg < 6:191254/136‑1 (MQ=255) gcccTGCTGGGTTTCCGCCGCGGCGCCTGTGATTTACTGGGGGGGGCCCGCCTGGGGGGGGGCCGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATcc < 7:137818/134‑1 (MQ=255) gACCTGCTGCGTTTCCGCGTCGGCGCCAGGGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGGGCAGGGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATcc < 3:213910/136‑1 (MQ=255) gACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATcc > 5:84394/1‑136 (MQ=255) gACCTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGGGGGGTGCCGCGTGAAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATcc < 1:29673/136‑1 (MQ=255) gACCTGCTGCGTTTCAGCCGCGGCGCCAGGGGTTTTCTGGGGGGTGCCAGCGTGGTGGGGGGCAGCGTGAAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATcc < 7:173220/136‑1 (MQ=255) ccTGCTGCGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGAGACCGGCTATCAGGTACTGCGTGCCGCCGCCCTGCCCCTGCGGCGTGCGCTGATCCCg > 5:272321/1‑136 (MQ=255) ctgcGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGGGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCggtg < 2:227138/135‑1 (MQ=255) ctgcGTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCGGGCGGGGGCCAGCCGGGGGGGGGGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCggtg < 6:143847/135‑1 (MQ=255) tgggTTTCCGCGGCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGGGGGTCCCAGCCTGGTGGGGGGCAGCGTGCAACCCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCggtggt < 3:173252/133‑1 (MQ=255) cGTTTCAGCCGCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGGGGGCCAGCCTGGGGGGGGGCAGCGTGAAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCggtggt < 3:154044/134‑1 (MQ=255) ttttacgCCTCGGCGCCTGTGCTTTTCTGGGGGGTGCCAGCGTGGTGGGGTGCAGCGTGAAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCt < 4:80240/130‑1 (MQ=255) gTTTCAGCCTCGGCGCCTGTGCTTTTCTGGCGGGTGCAAGCGGGGGGGGGGGCAGCGGGCAAACCC‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCt < 1:337864/136‑1 (MQ=255) gTTTCAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGGGGGTGCCTGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCt < 7:3296/136‑1 (MQ=255) cAGCCTCGGCGCCAGTGCTTTTCTGGCGCGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGCCCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGCCCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGcc > 1:107494/1‑136 (MQ=255) cgtCGGCGCCAGTGCTTTTGTGGGGGGTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGt < 8:250307/134‑1 (MQ=255) ccgcGGCTCCAGTGATTTTCTGGGGGGGGCATGCGTGGTGGGGTTCAGCGGGAAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGt < 1:40716/133‑1 (MQ=255) ccgcGGCCCCCGTGCTTTTCTGGGGGGTGCCAGCCTGGGGGGGTGCAGCGTGAAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGt < 8:153382/133‑1 (MQ=255) ccTCGGCGCCAGGGCGTTTCTGGGGGGTGCCAGCGGGGGGGGGGGCAGCGGGAAACCCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGt < 7:309749/136‑1 (MQ=255) ccTCGGCCCAAGTGCTTTTCTGGCGGGTGCCAGCCGGGGGGGGGCCAGCGTCCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGt < 3:30863/136‑1 (MQ=255) cgcGGCGCCAGTGGTTTTCGGGGGGGGGGCAGGCTGGGGGGGGGGAGCGTGCAAACCGCCCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGt < 1:132424/134‑1 (MQ=255) ccgcCAGGGCTTTTCGGGCGGGTGCCCGCCGGGGGGGGGGCCGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTAcaca < 5:104903/135‑1 (MQ=255) 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ggggggTGCCCGCGGGGGGGGGTGCCGGGTCCAACCCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCg < 2:186337/133‑1 (MQ=255) ggTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGgtgt > 7:67381/1‑136 (MQ=255) ggTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGgtgt > 6:84529/1‑136 (MQ=255) gggCCAGCCTGGGGGGGGGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGGTGtt < 5:129255/134‑1 (MQ=255) gTGCCAGCCTGGTGGGGTGCAGCGTGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGGTGtt < 1:349277/136‑1 (MQ=255) gCCAGCCTGGGGGGGGGCCGCGGGCAAACCG‑CCGCGACCGGCTATCAGGTACTTCGTGACGACGACCTGCCCCTGCTGCGTGCGCTGATCCCGGTGGTCCTGGCCGGTACACAGGCCACCGATGCGCCGGTGTTgc < 6:143524/136‑1 (MQ=255) | 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |