| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | ACB143 | 4,805,237 | A→C | 29.2% | intergenic (+164/‑585) | dsbG → / → CJ019_04513 | Thiol:disulfide interchange protein DsbG/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB143 | 4,805,237 | 0 | A | C | 29.2% | 71.8 / 7.4 | 98 | intergenic (+164/‑585) | dsbG/CJ019_04513 | Thiol:disulfide interchange protein DsbG/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (8/46); new base C (4/15); total (29/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.97e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTGAAGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGTGATTGG > ACB143/4805103‑4805368 | gTGCAGCAGGCGACGTGGGGCAGGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAg < 1:395366/136‑1 (MQ=255) aaGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑T‑‑GGGG‑C‑g‑g > 6:72325/1‑136 (MQ=255) aaGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑G‑‑GGGG‑C‑g‑g > 5:220371/1‑136 (MQ=255) aaGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑G‑‑GGAC‑C‑g‑g > 6:243655/1‑136 (MQ=255) aGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCC‑T‑A‑‑GGCG‑C‑c‑gg > 2:116256/1‑136 (MQ=255) gACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑AC‑GGGC‑C‑G‑GGTTTAcc > 4:346898/1‑136 (MQ=255) aCGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑TGGG‑C‑GCGGGTTAccg > 1:14677/1‑135 (MQ=38) aCGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGCG‑CGG‑GGTTTAccc > 7:89914/1‑136 (MQ=255) aCGTGGGGCATGGCAAATTATACGCCGGTGTTCGCGGGTGACCCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGAGGTCGGCCG‑T‑AC‑GGGG‑G‑G‑GGTTTGccc > 3:303070/1‑136 (MQ=255) ggggCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCC‑T‑A‑‑GGGG‑CGG‑GGTTTACCcccg > 1:384078/1‑135 (MQ=38) tGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑T‑‑GGGG‑CGG‑GGGTTACCGCCGAAGGGGc > 8:304955/1‑136 (MQ=37) aCCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGCGCC‑G‑GGTTTACCCCCGCATGGCCCgcc > 6:162048/1‑134 (MQ=38) cTACGCCGGTGTTCGCTGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑AGTGGTG‑G‑G‑GGTTTACCCCGGACAGGGGCgccgagg > 4:234537/1‑130 (MQ=255) cTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTT‑G‑‑GGGG‑C‑G‑GGTTT‑CCCGCCCAAgggccgg‑gccaggg > 6:189069/1‑132 (MQ=37) cTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCCGCGCGGTCGGCCG‑TGG‑‑GGGG‑C‑G‑GGGTTGCCCCCCAAGGGCCCggccagcc > 6:118411/1‑130 (MQ=37) 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< 2:21900/135‑1 (MQ=21) cTAGGGGGCTCGCGCTACCGGCTGGGTTTGGCGCCAGGCCCGTGAGCGCACGGCCGGCGCGGGCGGCCG‑T‑A‑‑GGCG‑G‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgc < 8:261215/136‑1 (MQ=21) gggggCGCGCGCTACGGGCTGGGTTTTGCGCCTGCCCGGTTAGCGCACGGCGGGCGGGGTCGGCGG‑T‑A‑‑GGCG‑G‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgc < 3:355377/135‑1 (MQ=18) gggccggcgcTATCGGGTGGGGTTTGCGCCTGGCCCGTGATCGCATGGCCGGGGGGGCGGGCCT‑T‑A‑‑GTTG‑G‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgccg < 7:230265/130‑1 (MQ=17) gggCTCGGGCAAACGGCGGGGTTTTGCGCCAGGCCGGTCATCGCACGGCCTGCGCGGGCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgccg < 6:181743/136‑1 (MQ=18) gggCTCGCGCTACCGGCGGGGTTTTGCGCCAGGCCGGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGGCGGCCG‑T‑A‑‑GGCG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgccg < 7:259190/136‑1 (MQ=21) gggCTCGCGCTACCGGCGGGGTTTTGCGCCAGGCCGGTGATCCCACGGCCTGCCGGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑G‑G‑GTTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgccg < 6:438/136‑1 (MQ=21) gggCGCGCGCTAACGGGTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCACGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgccg < 7:371438/136‑1 (MQ=255) gggCGCGCCCTAAGGGCGGGGTTTTGCGCCAGGCCCGGTAGCGCACGGCGGGCGGGGTGGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgccg < 8:43353/136‑1 (MQ=18) ggCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑G‑‑GGGGCC‑G‑GGGTTACCC‑CGCAAGGGGCGG‑GCCCGCGGGGCCAATTAACACCACCCGTTCCCCGGTgcccccc > 5:111645/1‑135 (MQ=255) gcgcgcgCTAACGCCTGGGGTTGGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCGGCGCGGGCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgccgcc < 7:128954/133‑1 (MQ=21) gCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGGG‑C‑G‑GGGTTAACCGCGCAAGGGCCGG‑GCCGGC‑GGGGCCAATTCAACCAGCCGGTCACCCGTgccgccccc > 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gacagcGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTa < 2:322679/131‑1 (MQ=255) aaaaCGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCACGGCCGGCGGGGGCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTAt < 2:58528/134‑1 (MQ=21) tgTTTTGCGCCAGGCCGTTTTGCGAAAGGCCTGCGCGGTGGGCCG‑T‑A‑‑GGTG‑G‑G‑GTTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTaa < 6:85619/135‑1 (MQ=14) ggTTTTGGGCCCGGCCCGTGATCCCAAGCCCTGGGCGGGCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTaa < 7:40322/136‑1 (MQ=18) ggTTTTGCGCCAGGCCGGTGAGCGCAAGGCCGGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTaa < 4:287217/136‑1 (MQ=255) ggTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTaa < 8:89059/136‑1 (MQ=255) ggTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTaa < 8:312986/136‑1 (MQ=255) ggTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCGGCGGGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTaa < 2:384078/136‑1 (MQ=255) ggTTTTGCCCCCGGCAGTTGAGCCCAAGCCCTGCGCGGTGGGCCT‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GTTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTaa < 5:219933/136‑1 (MQ=14) ggTTTTCCGACCGGACCGTGATCGCACGGCCTGCGCGGTCGACCG‑T‑A‑‑GGGG‑C‑G‑GTTTTACCAGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCATCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACTGTATTCGC‑GGTTaa < 8:113411/136‑1 (MQ=17) 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gCCCGTGATCGCACGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACg < 8:195716/136‑1 (MQ=255) cggttaTCCCACGGCCTGCGCGTGCGGCGT‑T‑A‑‑GGAT‑C‑G‑GTTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCTTTCACCGTTGCCTCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCt < 8:157855/131‑1 (MQ=14) ccGTGATCGCACGGCCGGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGCG‑G‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCt < 7:75202/136‑1 (MQ=255) ccGTCAGCGCACGGCCGGCGCGGTGGGCGG‑T‑A‑‑GCAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCt < 3:278435/136‑1 (MQ=17) gTGATCGCACGGCGGGCGGGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GTAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGa < 4:267657/136‑1 (MQ=17) agcGCACGGCCGGCGCGGGCGCCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCg < 4:294835/134‑1 (MQ=14) aTCGCACGGCCGGCGGGGGCGGCGG‑T‑A‑‑GCCG‑G‑G‑GTTTAACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATc < 2:89742/135‑1 (MQ=17) tCGCATGGCGGGCGGGGGGGGCGG‑T‑T‑‑GGCG‑G‑G‑GTTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCg < 5:196628/135‑1 (MQ=14) gcGCACGGCCGGCGGGGGCGGCCT‑T‑T‑‑GGAG‑G‑G‑GGTTAACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCg < 6:122572/134‑1 (MQ=17) cGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGCG‑G‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCgg < 6:358066/135‑1 (MQ=255) cGCAAGGCCTGCGCGGGCGGCGG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCgg < 5:179880/135‑1 (MQ=255) catggCCGGCGGGGTGGGCCG‑T‑T‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCggggg < 2:6294/133‑1 (MQ=17) cacggCCGGCGGGGGCGGCGG‑A‑A‑‑GTTG‑G‑G‑GGTTACCCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCggggg < 4:41124/133‑1 (MQ=17) cAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCggggg < 1:233371/136‑1 (MQ=255) tggCCTGCGGGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGTG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTg < 2:245645/135‑1 (MQ=255) cgggcTGCGCGGTGGGCCG‑T‑A‑‑GGCG‑G‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTg < 5:127484/132‑1 (MQ=255) aGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTg < 1:248870/136‑1 (MQ=255) ggCCTGCGCGGGCGGCCT‑T‑T‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTgg < 6:161160/136‑1 (MQ=255) gcccTGCGGGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GCAG‑G‑G‑GTTTAACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTgg < 1:214868/134‑1 (MQ=17) gggcgGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGCG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGaca < 3:246591/134‑1 (MQ=255) cgcgGACGGCCG‑T‑A‑‑GTAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGaca < 5:68428/135‑1 (MQ=255) gggTGGGCGG‑T‑A‑‑GCCG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACAt < 2:245430/135‑1 (MQ=255) gggTCGGCGG‑A‑A‑‑GTCG‑G‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACAt < 2:75684/135‑1 (MQ=17) gggTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GTTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACAt < 2:111005/135‑1 (MQ=255) cgGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACAt < 8:33648/136‑1 (MQ=255) ggTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTAt < 8:374611/90‑1 (MQ=255) ggTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTAt > 7:374611/1‑90 (MQ=255) gggCGG‑T‑A‑‑GGTG‑C‑G‑GTTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGTGTGGAGACACATTggg < 2:100838/135‑2 (MQ=17) gtttggAG‑G‑G‑GTTTAACCCGGGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGTGAtt < 2:396059/132‑1 (MQ=17) tggAG‑G‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGTGATTgg < 8:4488/134‑1 (MQ=255) | GTGAAGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGTGATTGG > ACB143/4805103‑4805368 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |