Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | KT2440 | 3,983,006 | 0 | A | C | 24.3% | 144.2 / 10.2 | 70 | T627P (ACC→CCC) | apc3 | Acetophenone carboxylase gamma subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (11/42); new base C (17/0); total (28/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.73e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCA > KT2440/3982873‑3983138 | gCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGCGCCCCCCGccccccccc > 8:384618/1‑136 (MQ=255) gCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCcg > 7:326344/1‑137 (MQ=255) cACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCTAGCTGCAGGGGGCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACcgc < 8:38538/137‑1 (MQ=255) cACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCGGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACcgc < 6:198437/137‑1 (MQ=255) aCCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCcgcg > 1:88221/1‑137 (MQ=255) aCCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAAtc < 8:326344/137‑1 (MQ=255) aCCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAAtc < 2:183831/137‑1 (MQ=255) aCTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGCGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCAATCCGTCCGc > 3:40115/1‑137 (MQ=255) aCTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGc > 4:259369/1‑137 (MQ=255) ggTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCg < 6:228436/136‑1 (MQ=255) cAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGc > 2:184035/1‑137 (MQ=255) cAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAAACCGTCCGCCCGAttc > 8:373310/1‑135 (MQ=255) aGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCt > 8:5743/1‑137 (MQ=255) aaCCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCAATCCCTCCCCCCGCTGCTGttg > 1:191/1‑136 (MQ=255) aaCCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTc > 1:126133/1‑137 (MQ=255) ccGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGCGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGt > 6:300039/1‑137 (MQ=255) gcccgcccGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGc < 3:88819/137‑1 (MQ=255) gCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCAATCCGTCCGCCCGCTGCTGTTCAGTGc > 2:94146/1‑137 (MQ=255) ccAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCCATCCGGCCGCCCGCTGCTGGTAAGTGcc > 2:134364/1‑137 (MQ=255) ccAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCCCCCCCACCGCGCCATCCGTCCGCCCGATGCGGTTCAGTGcc > 2:134361/1‑137 (MQ=255) cAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCg < 3:259369/137‑1 (MQ=255) ggTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGCGCCGCCCGCCCCCACCGCGCAATACGTCCGCCCGAAGCTGTTCAGTGCCGCCgggg > 1:150277/1‑135 (MQ=255) ggTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGCGCCCCCCCCCCCCCCCGCGCCATACGTCCCCCCCCAGCTGGTCAGTGCCGACggat > 3:159529/1‑135 (MQ=255) tGGAGCTGGTGAACCTGGCTTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGaa < 6:23920/137‑1 (MQ=255) gAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATg < 7:312155/137‑1 (MQ=255) gAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATg < 1:184035/137‑1 (MQ=255) gAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCca < 2:107898/137‑1 (MQ=255) aCCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGCGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCcaca < 2:325154/137‑1 (MQ=255) aCCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCcaca < 6:208952/137‑1 (MQ=255) aCCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCcaca < 6:147336/137‑1 (MQ=255) aCCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCCGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCcaca < 1:243346/137‑1 (MQ=255) gTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGGTCAGGGGCGCCGGTGAATGGCCGCCCCCACCGgtgg > 4:362112/1‑136 (MQ=255) ggCTCGGGGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGtt < 1:392615/136‑1 (MQ=255) cGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCCATCCGGCCCCCCCATGCGGTTCAGTGCCGCCGGGGTATGGCAGCCCCCACCGGGGTGCaaa > 3:56420/1‑136 (MQ=255) cGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAAc < 3:96100/137‑1 (MQ=255) cGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGACCCCCGCCCCCACCCCCCAATACCTCAGCCCCCTGCTGGTCCTGGCCGACGGTTAATGGCACCCCACAACCGTGTTCaaa > 2:232077/1‑136 (MQ=255) ggTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGCGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCCATACGGGCGCCCGCTGGGGGTGAGTGGCGGCGGGGAATTGGAGCCCCCCCCGGGGTTGaaac > 8:66682/1‑135 (MQ=255) ggTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCGCCCGCCCCCCCCGCGCAATCCGTCCGCCCGGTGCGGGTGAGTGCGGGCGGGGGATGGCAGCCCCCCCCGGGGTTCAAcc > 1:105543/1‑136 (MQ=255) ggTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCCATCCGTCCGCCCGCTGCTGTTGAGTGCCGACGGTGGATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAAcc > 3:333999/1‑136 (MQ=255) ggTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCCATCCGGCCGCCCGCTGGGGTGCAGTGCCGCCGGGGGATGGCAGCCCCCCCCGGGGTTAAAcc > 6:245534/1‑136 (MQ=255) ggTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGCTGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCCGCCCACCCCCGGGTTGAAcc > 6:246949/1‑136 (MQ=255) tGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGc < 5:245534/137‑1 (MQ=255) ggATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGc < 2:104534/136‑1 (MQ=255) ggCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAacca < 3:362112/137‑1 (MQ=255) ggCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAacca < 4:22612/137‑1 (MQ=255) aCCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGCGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCAATCCGTCCGCCCGCTGCGGTTCACTGCCCACGGTGAATGGCAGCCCACCCCGGGGGTCAACGGCACCCCCCTg > 1:129828/1‑137 (MQ=255) aCCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTg < 7:5743/137‑1 (MQ=255) ccTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGt < 4:145845/137‑1 (MQ=255) ccTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGt < 6:121097/137‑1 (MQ=255) cTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGtt < 3:80445/137‑1 (MQ=255) gccgccgCTACGCGTGGTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGGAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGc < 1:152716/136‑1 (MQ=255) cccgccGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGc < 8:38566/137‑1 (MQ=255) cccgccGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGc < 7:66682/137‑1 (MQ=255) cccgccGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGc < 6:355325/137‑1 (MQ=255) ccgccgCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCa < 3:385657/137‑1 (MQ=255) cgcAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGGCGACGGGGAATGGCAGCCCCCACCGGTGTTCAACCGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGccc > 8:87819/1‑137 (MQ=255) cAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGt < 7:260395/137‑1 (MQ=255) cAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGt < 5:367256/137‑1 (MQ=255) aaCCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGGCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACTGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTg < 3:162966/137‑1 (MQ=255) gAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATgg < 7:346033/137‑1 (MQ=255) tGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGcccc < 2:240698/137‑1 (MQ=255) ggggCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCtgtg < 2:126133/137‑1 (MQ=255) ggccggccGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGCCGGTGAATGGCCGCCAACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCAGTTGCCTGGCGAGACCGTGCCTTGccccggggtt > 8:370861/1‑131 (MQ=255) gAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGa < 4:333999/137‑1 (MQ=255) aGCCCCCCGCCCCCACCGCGCATTCCGTCCGCGCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGaa < 7:356758/137‑1 (MQ=255) ccccccGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGa < 2:344835/137‑1 (MQ=255) ccccccGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGa < 1:170652/137‑1 (MQ=255) ccccccccccccccGCGCAAAACGTCCGCCCCATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCCGCCCACCACGGTGTTCAACCGCAACCACCAGTTTACAGGGCACACCCTGGAAGGCCCCTGTTTGATCGCGGAAGaa > 2:137056/1‑136 (MQ=255) cccccGCCCCCCCCGCGCAATCCGTCCGCCCCAAGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTAAACCGCAACCACCAGTTGCCAGGGCAGACCCTGCAATGCCCCTGTGTGATAGAGGaataa > 2:170652/1‑134 (MQ=255) cccGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGacac < 3:25448/137‑1 (MQ=255) cccGCACCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGacac < 5:207896/137‑1 (MQ=255) ccccACCGCGCAAACCCTCCGCCCGAAGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATTGCAGCCCACACCGGTGTTAAAACGCAACCACCAGTTGCCAGGGCAGACCCTGCAAGGCCCCGGTGTGATCGAGGAAGACCccacca > 4:146873/1‑137 (MQ=255) | GCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCACCA > KT2440/3982873‑3983138 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |